Honestamente, creio que você deva desligar seu computador, e levá-lo a um técnico que irá remover o seu disco rígido, e, utilizando um outro computador, provavelmente rodando GNU/Linux, irá fazer a recuperação dos seus arquivos. É o método mais seguro.

Em todo caso, se quiser tentar por conta própria, creio que a primeira coisa a fazer é remover o vírus. Mas isso não é uma tarefa fácil, e nem vou me arriscar a dar palpites de como fazê-la. Talvez um anti-vírus? Procurar programas estranhos no Gerenciador de Tarefas (CTRL+SHIFT+ESC, aba Processos)? Reiniciar o computador em “Modo de Segurança”?

Uma vez que o vírus tenha sido neutralizado e não possa mais apagar os arquivos, aí sim, instale o Recuva, como indicado no post, e teste recuperar os arquivos apagados. Se o vírus apenas “apagou-os” sem sobrescrevê-los, há grandes chances de você recuperá-los.

Mas lembre-se: se são arquivos muito importantes, é melhor não tentar algo que não esteja segura de fazer. E mais importante: quanto mais utilizar o computador, menores são as chances de recuperar os arquivos (pois podem ser sobrescritos por outros processos), certo?

No mais, boa sorte, e saudações aí para Portugal.

Primeiramente, para responder melhor sua pergunta, eu precisaria saber que tipo de servidor é esse: é um servidor dedicado, seu, onde você tem acesso a todas as configurações? Você aluga esse servidor? É um plano de hospedagem? Vou supor que seja um plano de hospedagem que você contratou.

Nesse caso, você deveria verificar a disponibilidade de acrescentar domínios no seu plano. Caso exista essa possibilidade, no CPANEL existe a funcionalidade “Domínios Suplementares” ou “Domínios Add-ons” ou “Add-ons Domains”, dependendo do seu CPANEL, na categoria “Domínios”.

Ao entrar nessa opção, você consegue adicionar domínios adicionais e apontá-los para uma pasta específica dentro do seu servidor. Daí, é só configurar o DNS no Registar que registrou o domínio para você (registro.br, caso seja um domínio .br) e está pronto.