marine science ku

Visualisasi Ekstraksi DNA, dan Analisis Sequen DNA dengan BLAST

2011-12-28T09:06:00.000-08:00

Bioteknologi adalah suatu teknik yang menggunakan organisme hidup atau substansi tertentu dari makhluk hidup untuk membuat atau memodifikasi sebuah produk, untuk mendukung kegiatan hewan, dan tumbuhan atau menggunakan mikroorganisme untuk kegiatan tertentu. Bioteknologi kini berkembang sangat pesat di negara maju, bahkan ada anggapan masa depan bahwa manusia didominasi oleh produk bioteknologi. Apalagi sejak dikuasainya teknologi DNA rekombinan oleh ilmuwan, yaitu kemampuan untuk merekayasa materi dasar kehidupan yang disebut gen. Dengan adanya teknologi DNA rekombinan, kini manusia dapat memotong dan mengeluarkan gen dari tempatnya pada kromosom, dan memindahkannya ke sel individu lain atau jenis makhluk hidup yang lain, serta dapat bekerja dengan normal dalam tubuh penerima atau yang mengalami rekayasa itu. Dengan teknologi baru ini banyak sekali hal dalam kehidupan kita yang dapat teratasi dengan baik.

DNA dapat berperan dalam bidang evolusi, antropologi, bioarkeologiforensik, kedokteran, farmasi, pertanian, peternakan, bioteknologi dan ilmu biologi terapan yang lain. Contohnya pada di bidang farmasi, dihasilkan hormon insulin dengan menyisipkan gen penyandi insulin pada E. Coli. Pada bidang forensik, pihak kepolisian dapat mengungkap kasus kejahatan dengan sidik jari DNA

Begitu pentingnya DNA saat ini, yang berhubungan dengan rekyasa DNA, maka perlu cara untuk dapat mengisolasi DNA, mengingat ukuran DNAyang sangat kecil dan letaknya berada di dalam inti sel. DNA dapat diperoleh dengan cara isolasi, dari jaringan atau sel tumbuhan hewan maupun manusia. Pada tumbuhan, isolasi DNA dapat menggunakan sampel akar, batang, daun, bunga darah, akar rambut, kuku, limfa, kulit, semen ataupun organ lainnya buah maupun biji. Sedangkan pada hewan atau manusia, DNA dapat diisolasi.

Visualisasi Ekstraksi DNA

DNA adalah asam nukleat yang mengandung materi genetik dan berfungsi untuk mengatur perkembangan biologis seluruh bentuk kehidupan secara seluler. DNA terdapat pada nukleus, mitokondria dan kloroplas. Perbedaan di antara ketiganya adalah DNA nukleus berbentuk linear dan berasosiasi sangat erat dengan protein histon, sedangkan DNA mitokondria dan kloroplas berbentuk sirkular dan tidak berasosiasi dengan protein histon. Selain itu, DNA mitokondria dan kloroplas memiliki ciri khas, yaitu hanya mewariskan sifat-sifat yang berasal dari garis ibu. Hal ini sangat berbeda dengan DNA nukleus yang memiliki pola pewarisan sifat dari kedua orangtua. Dilihat dari organismenya, struktur DNA prokariot berbeda dengan struktur DNA eukariot. DNA prokariot tidak memiliki protein histon dan berbentuk sirkular, sedangkan DNA eukariot berbentuk linear dan memiliki protein histon (Klug & Cummings 1994: 315--316; Raven & Johnson 2002: 94).

Keseluruhan DNA yang menyusun DNA mitokondria, kloroplas, dan inti tersebut disebut juga sebagai DNA genom, dengan penyebutan umum adalah DNA genom mitokondria, DNA genom kloroplast dan DNA genom inti (Muladno 2002).

DNA memiliki struktur pilinan utas ganda yang antiparalel dengan komponen-komponennya, yaitu gula pentosa (deoksiribosa), gugus fosfat, dan pasangan basa. Pasangan basa pada DNA terdiri atas dua macam, yaitu basa purin dan pirimidin. Basa purin terdiri atas adenin (A) dan guanin (G) yang memiliki struktur cincin-ganda, sedangkan basa pirimidin terdiri atas sitosin (C) dan timin (T) yang memiliki struktur cincin-tunggal. Ketika Guanin berikatan dengan Sitosin, maka akan terbentuk tiga ikatan hidrogen, sedangkan ketika Adenin berikatan dengan Timin maka hanya akan terbentuk dua ikatan hidrogen. Satu komponen pembangun (building block) DNA terdiri atas satu gula pentosa, satu gugus fosfat dan satu pasang basa yang disebut nukleotida (Lewis 2003: 176-178).

Metode yang digunakan untuk mengisolasi DNA dari berbagai jenis tanaman, organ tanaman, maupun jaringannya dapat dilakukan dengan berbagai cara. Namun pada intinya terdapat tiga faktor utama yang sangat penting untuk dalam melakukan purifikasi dan ekstraksi DNA secara maksimal. Pertama adalah cara dalam menghomogenkan jaringan tanaman khususnya adalah dinding selnya. Kedua adalah komposisi dari larutan buffer yang ditambahkan dalam penggerusan jaringan tanaman dan yang ketiga adalah penghilangan enzim penghambat-polisakarida. (Rizki S.Si, 2008)

Ekstraksi merupakan suatu proses pemisahan suatu bahan dari campurannya dengan menggunakan pelarut yang berbeda yang tidak saling campur. Cara yang paling sederhana adalah dengan ekstraksi bertahap, yaitu cukup dengan hanya menambahkan pelarut pengekstraksi yang tidak saling campur dengan pelarut semula. Kemudian dikocok sehingga terjadi keseimbangan konsentrasi zat yang akan diekstraksi dan dicapai suatu lapisan kemudian didiamkan dan dipisahkan ( S.M. Khopkar, 1990 ).

DNA juga dapat diisolasi, baik pada manusia maupun pada tumbuhan DNA manusia dapat diisolasi melalui darah. Darah manusia terdiri atas plasma darah, globulus lemak, substansi kimia (karbohidrat, protein dan hormon), dan gas (oksigen, nitrogen dan karbon dioksida). Plasma darah terdiri atas eritrosit (sel darah merah), leukosit (sel darah putih) dan trombosit (platelet). Komponen darah yang diisolasi yaitu sel darah putih. Sel darah putih dijadikan pilihan karena memiliki nukleus, di mana terdapat DNA di dalamnya. DNA pada tumbuhan juga dapat diisolasi, contohnya pada tumbuhan bawang merah (Allium cepa) dan pada pisang

Prinsip-prinsip dalam melakukan isolasi DNA ada 2, yaitu sentrifugasi dan presipitasi. Prinsip utama sentrifugasi adalah memisahkan substansi berdasarkan berat jenis molekul dengan cara memberikan gaya sentrifugal sehingga substansi yang lebih berat akan berada di dasar, sedangkan substansi yang lebih ringan akan terletak di atas. Teknik sentrifugasi tersebut dilakukan di dalam sebuah mesin yang bernama mesin sentrifugasi dengan kecepatan yang bervariasi, contohnya 2500 rpm (rotation per minute) atau 3000 rpm (Kimball 2005: 4; Lewiston 2002:1--3; LPCH 2005: 2)

Analisis sequen DNA dengan Blast (Penjajaran Sekuens)

Sekuens Alignment merupakan metode dasar dalam analisis sekuens. Metode ini digunakan untuk mempelajari evolusi sekuens-sekuens yang sama (common ancestor). Ketidakcocokan (mismatch) dalam alignment diasosiasikan dengan proses mutassi. Sedangkan kesenjangan diasosiasikan dengan proses insersi atau delesi (http://wikikpedia.org/wiki/Bioinformatika).

Sekuens Alignment adalah proses penyusunan pengaturan dua atau lebioh sekuens sehingga persamaan sekuens-sekuens tresebut tampak nyata. Basis sekuens dalam suatu alignment diberi sisipan (umumnya dengan tanda ) sedemikian rupa sehingga kolom-kolomnya memuat karakter yang identik atau sama diantara sekuens sekuens tersebut (http://wikikpedia.org/wiki/Bioinformatika).

1.2.1. Basis data utama untuk sekuens asam nucleat saat ini antara lain:

1. GenBank (Amerika Serikat)

2. EMBL (European Molecular Biology Laboratory, Eropa)

3. DDBJ (DNA Data Bank of Japan, Jepang)

1.2.2. Basis data utama untuk sekuens primer protein saat ini antara lain:

1. PIR (Protein Information Resourch, Amerik Serikat)

2. Swiss-Prot (Eropa)

3. TrEMBL (Eropa)

4. UniProt (Amerika Serikat)

Pengolahan Data hasil identifikasi sekuen mengunakan program Bioinformatika

Istilah bioinformatika mulai ditemukan pada pertengahan era 1980-an untuk mengsacu pada penerapan komputer dalam biologi. Namun demikian, penerapan bidang-bidang dalam bioinformatika sudah dilakukan sejak tahun 1960-an (http://wikikpedia.org/wiki/Bioinformatika).

Bioinformatika adalah ilmu yang mempelajari penerapan teknik yang komputasional untuk mengola dan menganalisis informasi biologis. Bidang ini mencakup penerapan metode-metode matematika, statistika dan informatika untuk memecahkan masalah-masalah biologis terutama dengan menggunakan sequen DNA dan asam amino serta informasi yang berkaitan (http://wikikpedia.org/wiki/Bioinformatika).

Metode Alignment

Penjajaran DNA (sekuensing DNA) dapat dilakukan dengan beberapa metode, antara lain:

1. BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)

BLAST merupakan perkakas bioinformatika yang berkaitan erat dengan penggunaan basis data sekuen biologis. Blast berguna untuk menemukan gen sejenis pada beberapa organisme atau intuk memeriksa ke absahan hasil sekuensing maupun untuk memeriksa fungsi gen hasil sekuensing

2. Clustal

Clustal adalah program bioinformatika untuk alignment multiple, yaitu alignment beberapa sekuens sekaligus. Dua varian utama clustal adalh Clustal W dan Clustal X.

a. Clustal W

Clustal W adalah suatu program umum yang bertujuan untuk sekuensing alignment ganda (http://ebi.ac.ukTools/clustalw2/index.html).

b. Clustal X

Clustal X adalah suatu program baru yang menghubungkan Clustal W untuk kelurusan sekuens ganda. Clustal X memiliki dua mode yang dapat dipilih menggunakan saklar secara langsung pada tampilan multiple alignmet mode dan profile alignet mode (http://bips.u-strasbg.fr/en/documentation/ClustalX/).

3. Metode NeedLeman-Wuncsh

Metode NeedLeman-Wuncsh digunakan untuk menyusun Alignment global diantara dua atau lebih sekuens, yaitu alignment atas keseluruhan panjang sekuens tersebut

(http://wikikpedia.org/wiki/Bioinformatika).

4. Metode Smith-Waterman

Metode Smith - Waterman menghasilkan alignment lokal, yaitu alignment atas bagian-bagian dalam sekuens

(http://wikikpedia.org/wiki/Bioinformatika).

5. HMM (Hidden Markov Model)

HMM (Hidden Markov Model) merupakan model statistika yang mulanya digunakan dalam ilmu komputer untuk mengenali pembicaraan manusia (speech recognition). Namun dalam sekuens, metode HMM berguna dalam prediksi daerah pegkode protein dalam genom dan juga prediksi struktur sekunder protein

(http://wikikpedia.org/wiki/Bioinformatika).

Kerang Mutiara

2011-12-28T08:21:00.000-08:00

Kerang Mutiara laut adalah hewan laut penghasil mutiara yang bertubuh lunak yaitu hewan dalam biologi di masukan dalam pilum molusca. Mutiara yang di hasilkan merupakan suatu keistimewaan. dimana pilum tersebut terbagi atas enam kelas yaitu: (1) Monoplacophora; (2) Amphineura; (3) Gastropoda; (4) Lamellibranchiata atau Pellecypoda; (5) Scaphopoda; (6) Cephalopoda.

Kerang mutiara dapat diklasifikasikan sebagai berikut:

Kingdom : Invertebrata

Pilum : Mollusca

Klas : Pellecypoda

Ordo : Anysomyaria

Famili : Pteridae

Genus : Pinctada

Spesies : Pinctada sp. dan Pteria sp.

Kerang mutiara mempunyai dua cangkok yang dapat membuka dan menutup dengan menggunakan otot aduktor dalam tubuhnya. Cangkok ini berfungsi untuk melindungi tubuh. Cangkok di bagian dorsal tebal dan di bagian ventral tipis. Cangkok ini terdiri dari tiga lapisan, yaitu:

a. Periostrakum adalah lapisan terluar dari zat kitin yang berfungsi sebagai

pelindung.

b. Lapisan prismatik, tersusun dari kristal-kristal kapur yang berbentuk

prisma.

c. Lapisan nakreas atau sering disebut lapisan induk mutiara, tersusun

dari lapisan kalsit (karbonat) yang tipis dan paralle

di bawah ini adalah gambar bagian-bagian tubuh kerang yang dipotong secara melintang

(A)Penampang melintang tubuh Pelecypoda; (B) Penampang

melintang cangkok dan mantel.

Kerang mutiara bernafas dengan dua buah insang. bagian mantel Insang ini berbentuk lembaran-lembaran (lamela) yang banyak mengandung batang insang. Sementara itu antara tubuh dan mantel terdapat rongga mantel. Rongga ini merupakan jalan masuk keluarnya air. Sistem pencernaan kerang mutiara dimulai dari mulut, kerongkongan, lambung, usus dan akhirnya bermuara pada anus. Anus ini terdapat di saluran yang sama dengan saluran untuk keluarnya air. Sedangkan makanan golongan hewan kerang ini adalah hewan-hewan kecil yang terdapat dalam perairan yaitu berupa protozoa diatom, dll. Makanan ini dicerna di lambung dengan bantuan getah pencernaan dan hati. Sisa-sisa makanan dikeluarkan melalui anus.

Ada tiga spesies penghasil mutiara terpenting yang di budidayakan yaitu, Pinctada martensii, Pinctada margaritifera dan Pinctada maxima. Sebagai jenis yang ukuran terbesar adalah Pinctada maxima.

Manfaat kerang mutiara, Kerang mutiara di manfaatkan sebagai bahan perhiasan yang nilai harganya sangat mahal, selain itu cangkangnya juga di manfaatkan untuk perhiasan rumah dan cindramata,selain di manfaatkan untuk perhiasan kerang mutiara juga di manfaatkan utuk bahan pembuat cosmetic karena mutiara mengandung zat pemutih yang mampu di percaya untuk memutihkan kulit.

Pada umumnya di dunia perdagangan kerang mutiara di hasilkan melalui budidaya kerang induk dan inokulasi nukleus ke dalam mantel kerang yang di budidayakan.

Asam lemak Esensial

2011-12-25T01:57:00.000-08:00

Latar belakang

Asam lemak adalah asam organik yang terdapat sebagai ester trigliserida atau lemak.baik yang berasal dari hewan ataupun tumbuhan.pada umumnya asam lemak mempunyai jumlah atom karbon genap.

Asam lemak adalah asam yang lemah.apabila dapat larut dalam air molekul asam lemak akan terionisasi sebagian dan melepaskan ion H⁺.dalam hal ini PH larutan tergantung pada kostanta keasaman dan derajat ionisasi masing-masing asam lemak.

Asam lemak terbagi dua yaitu asam lemak jenuh dan tidak jenu (esensial).asam lemak jenuh adalah rantai karbon yang tidak mengandung ikatan rangkap.contohnya asam lemak butirat, asam lemak kaproat, asam lemak palmitat, asam lemak stearat, asam lemak kaprilat, asam lemak kaprat, asam lemak laurat, asam lemak miristat, asam lemak stearat.

Asam lemak tidak jenuh adalah asam lemak yang mengandung atau mempunyai ikatan rangkap lebih dari satu dan mengandung asam esensial yaitu asam yang tidak dapat di sintesiskan dalam tubuh contohnya asam oleat,asam linoleat,asam linolena,asam arakidonat.Di dalam bab II akan di bahas lebih lanjut tentang asam lemak esensial.

Pengertian asam lemak esensial

Asam lemak esensial merupakan sebutan bagi asam lemak yang tidak dapat dibuat sendiri oleh atau tidak dapat mencukupi kebutuhan minimal dari suatu spesies ( hewan atau manusia ). Hal ini terjadi karena spesies yang bersangkutan tidak memiliki (atau memiliki tetapi kurang fungsional) enzim yang bertanggung jawab dalam melakukan sintesis asam lemak tersebut. Atau asam lemak yang tidak bisa di sintesiskan dalam tubuh karena mempunyai ikatan rangkap lebih dari satu

contoh

ü Linoliat ( memiliki ikatan rangkap 2 )

ü Linolenat ( memiliki ikatan rangkap 3 )

ü Arakidonat ( memiliki ikatan rangkap 4 )

Nama	rumus	sumber
Linoleat*	CH₃CH₂CH=CHCH₂CH=CH(CH₂)₇CO₂H	Minyak nabati
Linolenat*	CH₃CH₂CH=CHCH₂CH=CHCH₂CH =CH(CH₂)₇CO₂H	Minyak biji rami
Arakidonat*	CH₃(CH₂)₄(CH=CHCH₂)₄(CH₂)₂CO₂H	Minyak nabati

*asam lemak esensial yang harus ada dalam makanan, karena tidak dapat diproduksi di dalam tubuh Komposisi kasar asam lemak dari beberapa minyak dan lemak yang umum dikonsumsi (dalam %)

(Anna Poedjiadi 2006)

Bagi setiap spesies, asam lemak yang esensial berbeda-beda. Contoh:

Bagi manusia, asam lemak esensial mencakup golongan asam lemak tak jenuh jamak (polyunsaturated fatty acids, PUFA) tipe cis, khususnya dari kelompok asam lemak Omega-3 (misalnya asam α-linolenat, EPA, dan DHA) dan asam lemak Omega-6 (misalnya asam linoleat). Tubuh manusia tidak mampu menghasilkan enzim desaturase, tetapi mampu memanjangkan dan merombak PUFA.
Kucing tidak mampu memanjangkan asam linoleat menjadi asam arakidonat (ARA) (suatu asam lemak Omega-6) yang diperlukannya karena tidak mempunyai enzim untuk keperluan itu. Tumbuhan tidak menghasilkan ARA, maka kucing menjadi karnivora obligat untuk memenuhi keperluan ini.

(http;//www nutrition-healtinfo.com)

Sumber asam lemak esensial

Sumber-sumber penting asamlemak esensial yaitu PUFA Omega-3 dan Omega-6 mencakup ikan laut (seperti tuna, kod, sardin), kerang, biji flax, minyak kedelai, minyak raps, minyak chia, biji blewah, sayuran berdaun, dan walnut. Minyak kelapa bukan sumber PUFA. Minyak inti sawit mengandung asam linoleat meskipun tidak banyak.

(http://www.sulastomo.com)

Fungsi Asam Lemak Esensial Bagi Kesehatan

Asam lemak atau biasa disebut sebagai lemak terbagi menjadi dua golongan, yaitu asam lemak jenuh dan asam lemak tak jenuh. Pada asam lemak tak jenuh, dalam struktur molekulnya ada ikatan rangkap, sedangkan pada asam lemak jenuh tidak ada.

Asam lemak tak jenuh sendiri digolongkan menjadi dua golongan yaitu asam lemak esensial dan asam lemak non-esensial. Asam lemak esensial adalah asam lemak yang mutlak diperlukan tubuh dalam proses metabolisme tetapi tubuh tidak bisa menghasilkannya sehingga harus ada masukan dari masakan. Sedangkan asam lemak non esensial fungsinya tidak sepenting asam lemak esensial. Ada dua jenis asam lemak esensial yaitu asam linoleat (omega-6) dan asam linolenat ( omega-3), omega 6 terdapat dalam minyak-minyak berkualitas tinggi seperti minyak bunga matahari, zaitun, dan safflower, sedangkan omega 3 terdapat dalam minyak ikan laut dalam seperti ikan kod.

Fungsi asam lemak esensial dalam tubuh Omega 6 dan omega 3 bersama-sama memainkan peranan yang sangat vital bagi tubuh, kedua zat tersebut bekerja sebagai suatu peneyeimbang yang membantu mengatur ribuan reaksi biokimia dalam tubuh. Sebagai contoh, kedua zat tersebut mendukung prostaglandin, zat sejenis hormon yang sangat vital untuk mengatur fungsi utama tubuh seperti kardiovaskuler, saraf, kekebalan dan reproduksi. Omega 6 juga membantu membentuk membran dalam sel-sel tubuh, mengamankan sel dari benda asing, dan memperkuat struktur sel. Ketika diet kekurangan asam lemak ini, dan kebanyakan makanan yang masuk tergolong ‘jahat’ (asam lemak jenuh), maka membran sel yang terbentuk sangat kurang elastis dan fungsinya terganggu. Hal ini memnyebabkan terjadinya gangguan fungsi sel secara keseluruhan yang akhirnya juga menyebabkan gangguan kesehatan.

Fungsi Peningkatan kesehatan Omega 6 membantu peningkatan performa dan keatletisan, dengan berbagai cara. Zat ini menurunkan tingkat kerusakan sel otot, mempercepat pertumbuhan sel otot yang baru, mempercepat waktu pemulihan tenaga, membantu perpindahan oksigen dari paru-paru ke aliran darah, membantu berbagai fungsi metabolisme dan pengeluaran berbagai hormone esemisal testoteron. Zat tersebut juga menjaga kesehatan kulit dan persendian, dengan meningkatkan pelumasan pada sendi dan mencegah kerusakan kulit. Karena itu, banyak orang yag mengalami sakit persendian termasuk rematik mengkonsumsi omega 6 dikombinasikan dengan omega 3 untuk mengurangai rasa sakit dan pembengkakan.

Efek kekurangan asam lemak esensial Salah satu efek dari terjadinya kekurangan omega 6 dalam diet adalah peningkatan berat badan/kegemukan. Ini memang kelihatan aneh, kekurangan suatu asam lemak justru menyebabkan kegemukan, tetapi memang yang terpenting adalah mendapatkan jenis asam lemak yang tepat. Diet yang kurang akan omega 6 dan tinggi dengan asam lemak jenuh akan memperlambat metabolisme tubuh, sehingga tubuh akan mengakumulasikan makanan yang masuk sebagai lemak tubuh yang akhirnya menyebakan kegemukan. Kekurangan zat ini juga bisa membuat tubuh kekurangan asam lemak lain yaitu asam arakhidonat, yang merupakan komponen penting dalam metabolisme tubuh (asam arakhidonat dibuat dalam tubuh dengan bahan baku omega 6).

(Findley,D.A 1985)

Aspek Gizi Asam Lemak Esensial

Sesungguhnya tubuh tidak memerlukan konsumsi lemak, karena dapat disintesis dari karbohidrat maupun protein. Namun terdapat beberapa asam lemak yang tidak dapat disintesis oleh tubuh, sehingga harus disuplai dari makanan dan asam lemak esensial.

Metabolisme dan Fungsi

Istilah asam lemak esensial pada awalnya digunakan untuk asam-asam lemak yang memberikan gejala sakit pada tikus yang diberi ransum bebas lemak tetapi cukup mengandung zat-zat gizi yang lain.

Asam linoleat (18:2 omega 6), linoleat (18:3, omega 3) dan arahidonat (20:4 omega 6), merupakan asam-asam lemak yang pertama kali ditemukan bersifat esensial dan sampai sekarang digolongkan sebagai asam lemak esensial utama. Asam lemak tersebut tergolong sebagai asam lemak tidak jenuh.

Sedikitnya ada dua fungsi asam lemak esensisal bagi tubuh yaitu : (1) sebagai komponen semua tubuh dan menentukan sifat-sifat biokimia dan (2) sebagai prekursor prostaglandin suatu senyawa biologis yang aktif.

Masing-masing asam lemak esensial mempunyai fungsi yang berbeda, demikian pula prostaglandin mempunyai fungsi tersendiri. Linoleat dan arahidonat diperlukan untuk pertumbuhan tubuh dan fungsi kulit yang normal, sedangkan prostaglandin yang diproduksi arahidonat diperlukan untuk berfungsinya ginjal, koagulasi darah, kesuburan dan kehamilan.

Sumber dalam Makanan

Bahan pangan yang banyak mengandung asam lemak esensial terutama adalah kacang-kacangan dan biji-bijian, misalnya kacang kedelai, kacang tanah, minyak jagung, minyak biji, bunga matahari, minyak biji kapas, algae, ikan (terutama ikan laut) dan kerang-kerangan.

Karena asam lemak esensial merupakan asam lemak yang mudah rusak maka pengolahan makanan perlu dilakukan secara hati-hati agar manfaat lemak esensialnya masih dapat diperoleh. Misalnya penggunaan suhu pemasakan yang tidak terlalu tinggi atau waktu pemasakan yang tidak terlalu lama serta meng hindarkan terlalu banyak kontak dengan udara dan cahaya matahari.

Penggunaan minyak (jagung, kedelai, bunga matahari, dan biji kapas) sebagai minyak goreng, tidak terlalu menguntungkan karena asam lemak esensialnya dapat rusak pada suhu penggorengan, dan selain itu minyak yang terbawa dalam makanan yang digoreng juga tidak terlalu banyak. Sebaliknya minyak-minyak tersebut digunakan dalam tumis sayuran atau dicampurkan dalam sayuran (selada), agar jumlah yang terkomsumsi cukup banyak dan dalam keadaan baik.

Defisiensi dan Kebutuhan

Suplai asam lemak esensial (melalui konsumsi makanan) yang tidak cukup dapat membawa akibat yang kurang baik seperti : (1) pertumbuhan terhambat, (2) kulit ruam, (3) meningkatnya kehilangan air melalui kulit, (4) menurunkan efesiensi penggunaan zat-zat gizi, (5) penimbunan lemak dalam hati, (6) penurunannya produksi prostaglandin (dengan akibat yang timbul karena defesiensi prostaglandin) dan (7) terganggunya metabolisme lipoprotein.

Suatu penelitian menunjukkan bahwa defesiensi protein dan atau asam lemak esensial dapat mempengaruhi secara negatif aktivitas reproduksi, pertumbuhan yang normal, serta fungsi otak dan hati. Data mutakhir menunjukkan bahwa asam lemak arahidonat dan dokosaheksaenoat diperlukan untuk perkembangan yang normal sistim syaraf pusat.

Energi bagi tubuh dapat disuplai baik oleh karbohidrat (pati, gula), lamak maupun protein. Kebutuhan tubuh manusia akan energi bervariasi menurut umur, jenis kelamin dan jenis pekerjaan (aktivitas tubuh). Bagi orang dewasa di Indonesia kebutuhan tersebut rata-rata sekitar 2100 kilokalori.

FAO (Food and Agriculture Organization) menganjurkan agar asam lemak esensial dikonsumsi sedikitnya sebanyak 3% dari total energi yang dikonsumsi, baik untuk anak maupun orang dewasa. Selama masa kehamilan dan menyusui, FAO merekomondasikan masing-masing sebanyak 4,5 dan 5-7% dari total energi yang dikonsumsi. Asam lemak esensial termasuk sejumlah kecil asam lemak esensial berantai panjang, terdapat 8% dari jumlah energi yang terkandung dalam air susu ibu (ASI). Karena itu idealnya susu pengganti ibu harus mengandung asam lemak esensisal sebanyak yang terdapat dalam ASI.

Aspek Gizi Lain

Kadar kolesterol yang tinggi dalam plasma darah cenderung menyebabkan timbulnya penyakit jantung koroner. Karena itu pencegahan timbulnya penyakit ini salah satunya adalah dengan menurunkan kadar kolesterol dalam plasma.

Asam lemak esensial sebagai asam lemak tidak jenuh dapat berfungsi untuk menurunkan kadar kolesterol plasma tersebut, dengan cara meningkatkan degradasi kolesterol oleh jaringan-jaringan tubuh.

Data mutakhir menunjukkan bahwa asam lemak omega 4 yang berasal dari ikan dan hasil laut lainnya dapat berfungsi untuk menurunkan kadar kolesterol dalam plasma darah. Karena itu orang sekarang berlomba untuk meningkatkan konsumsi ikan dan hasil laut dalam rangka pencegahan timbulnya penyakit jantung koroner.

(Lehinger,A.L 1970)

Kesimpulan

1.Asam lemak esensial merupakan sebutan bagi asam lemak yang tidak dapat dibuat sendiri atau tidak dapat mencukupi kebutuhan minimal dari suatu spesies ( hewan atau manusia ). Hal ini terjadi karena spesies yang bersangkutan tidak memiliki enzim yang bertanggung jawab dalam melakukan sintesis asam lemak tersebut. Atau asam lemak yang tidak bisa di sintesiskan dalam tubuh karena mempunyai ikatan rangkap lebih dari satu

contoh

ü Linoliat ( memiliki ikatan rangkap 2 )

ü Linolenat ( memiliki ikatan rangkap 3 )

ü Arakidonat ( memiliki ikatan rangkap 4 )

2.Sumber asam lemak esensial :Sumber-sumber penting asamlemak esensial yaitu PUFA Omega-3 dan Omega-6 mencakup ikan laut (seperti tuna, kod, sardin), kerang, biji flax, minyak kedelai, minyak raps, minyak chia, biji blewah, sayuran berdaun, dan walnut. Minyak kelapa bukan sumber PUFA. Minyak inti sawit mengandung asam linoleat meskipun tidak banyak

.

3.Fungsi asam lemak esensial fungsi asam lemak esensial dalam tubuh Omega 6 dan omega 3 bersama-sama memainkan peranan yang sangat vital bagi tubuh, kedua zat tersebut bekerja sebagai suatu peneyeimbang yang membantu mengatur ribuan reaksi biokimia dalam tubuh. Sebagai contoh, kedua zat tersebut mendukung prostaglandin, zat sejenis hormon yang sangat vital untuk mengatur fungsi utama tubuh seperti kardiovaskuler, saraf, kekebalan dan reproduksi. Omega 6 juga membantu membentuk membran dalam sel-sel tubuh, mengamankan sel dari benda asing, dan memperkuat struktur sel. Ketika diet kekurangan asam lemak ini, dan kebanyakan makanan yang masuk tergolong ‘jahat’ (asam lemak jenuh), maka membran sel yang terbentuk sangat kurang elastis dan fungsinya terganggu. Hal ini memnyebabkan terjadinya gangguan fungsi sel secara keseluruhan yang akhirnya juga menyebabkan gangguan kesehatan.

3.Aspek Gizi Asam Lemak Esensial

Asam lemak adalah bagian dari molekul lemak. Ini dapat berfungsi sebagai zat penyusun lemak tubuh atau dapat juga digunakan tubuh untuk menghasilkan energi. Asam lemak atau lemak di dalam tubuh selain berasal dari lemak/minyak yang dikonsumsi, juga dapat berupa hasil sitensis tubuh dari karbohidrat atau protein. Sesungguhnya tubuh tidak memerlukan konsumsi lemak, karena dapat disintesis dari karbohidrat maupun protein. Namun terdapat beberapa asam lemak yang tidak dapat disintesis oleh tubuh, sehingga harus disuplai dari makanan dan asam lemak esensial. pada awalnya digunakan untuk asam-asam lemak yang memberikan gejala sakit pada tikus yang diberi ransum bebas lemak tetapi cukup mengandung zat-zat gizi yang lain. Asam linoleat (18:2 omega 6), linoleat (18:3, omega 3) dan arahidonat (20:4 omega 6), merupakan asam-asam lemak yang pertama kali ditemukan bersifat esensial dan sampai sekarang digolongkan sebagai asam lemak esensial utama. Asam lemak tersebut tergolong sebagai asam lemak tidak jenuh.

Contact-me

2011-06-15T14:25:00.005-07:00

About-me

2011-06-15T14:25:00.003-07:00

My Galery

2011-06-15T14:25:00.001-07:00

Articles

2011-06-15T14:24:00.001-07:00

Visualisasi Ekstraksi DNA, dan Analisis Sequen DNA dengan BLAST

Kerang Mutiara
Molusca

Asam Lemak Esensial

Alginat

My Marine Science

2011-06-15T14:23:00.001-07:00

Molusca

2011-05-16T21:42:00.000-07:00

Moluska (filum Mollusca, dari bahasa latin: molluscus artinya lunak) merupakan hewan tribloblastic selomata yang bertubuh lunak. Ke dalamnya termasuk semua hewan lunak yang memiliki cangkang (kelompok Thecosomata) misalnya jenis kerang-kerangan.Maupun tanpa cangkang (kelompok Gymnosomata) misalnya Cilionina. Contoh moluska secara umum yang sering di jumpai dalam kehidupan sehari-hari seperti berbagai jenis siput, kerang-kerangan, serta cumi-cumi dan kerabatnya.

Moluska merupakan filum terbesar kedua dalam kerajaan binatang setelah filum Arthropoda. Moluska hidup di laut, air tawar, payau, dan daratan. Dari palung benua di laut sampai pegunungan yang tinggi, bahkan mudah saja ditemukan di sekitar rumah kita.Moluska dipelajari dalam cabang zoologi yang disebut malakologi (malacology).

Moluska mempunyai bentuk tubuh yang simetri bilateral,tertutup mantel yang menghasilkan cangkang dan mempunyai kaki ventral dan mempunyai saluran pencernaan yang lengkap terdiri dari mulut, esofagus, lambung, usus, dan anus. Pada mollusca tertentu ada pula yang memiliki rahang dan lidah.Lidah bergigi yang melengkung kebelakang disebut radula. Radula berfungsi untuk melumat makanan.

Mollusca yang hidup di air bernapas dengan insang.Sedangkan yang hidup di darat tidak memiliki insang. Pertukaran udara mollusca dilakukan di rongga mantel berpembuluh darah yang berfungsi sebagai paru-paru.Organ ekskresinya berupa seoasang nefridia yang berperan sebagai ginjal.

System saraf moluska terdirin atas cincin saraf mengelilingi esofagus dengan beberapa pasang ganglion dan dua pasang benang saraf yang sepasang berhubungan dengan kaki dan sepasang lagi berhubungan dengan mantel serta organ-organ dalam.

Anatomi moluska relatif mirip dengan vertebrata. Hal ini menyebabkan banyak ahli memperkirakan bahwa vertebrata dan moluska masih memiliki kedekatan hubungan evolusi. Hal ini diperkuat pula dengan kenyataan bahwa moluska, terutama Cephalopoda, memiliki otak yang berkembang baik dan beberapa di antaranya terbukti memiliki kemampuan mengingat yang kuat.

Cara hidup dan habitat Mollusca hidup secar heterotrof dengan memakan ganggang, udang, ikan ataupun sisa-sisa organisme. Mollusca bereproduksi secara seksual dan masing-masing organ seksual saling terpisah pada individu lain. Fertilisasi dilakukan secara internal dan eksternal untuk menghasilkan telur.Telur berkembang menjadi larva dan berkembang lagi menjadi individu dewasa.

Umumnya mollusca menguntungkan bagi manusia tetapi ada pula yang merugikan.Peran mollusca yang menguntungkan adalah sebagai berikut Sumber makanan berprotein tinggi, misalnya tiram batu (Aemaea sp.), kerang (Anadara sp.), kerang hijau (Mytilus viridis), Tridacna sp,sotong (Sepia sp.)cumi-cumi (Loligo sp.), remis (Corbicula javanica), dan bekicot (Achatina fulica).sebagai Perhiasan, misalnya tiram mutiara (Pinctada margaritifera).sebagai Hiasan dan kancing, misalnya dari cangkang tiram batu, Nautilus, dan tiram mutiara.sebagai Bahan baku terasi, misalnya cangkang Tridacna sp.

Mollusca yang merugikan bagi manusia, misalnya bekicot dan keong sawah yang merupakan hama dari tanaman. Siput air adalah perantara cacing Fasciola hepatica.

Ciri tubuh moluska.

1. Tubuh tidak bersegmen. Simetri bilateral.

2. Ukuran dan bentuk tubuh sangat bervariasi.

Contoh siput yang panjangnya hanya beberapa milimeter dengan bentuk bulat telur.Namun ada yang dengan bentuk torpedo bersayap yang panjangnya lebih dari 18 m seperti cum-cumi raksasa.

3. Struktur dan fungsi tubuh

Tubuh mollusca terdiri dari tiga bagian utama :

- Kaki merupakan penjulur bagian ventral tubuhnya yang berotot.

fungsi untuk bergerak merayap atau menggali dan beradaptasi untuk bertahan di substrat, menggali dan membor substrat.

- Massa viseral adalah bagian tubuh mollusca yang lunak.Massa viseral merupakan kumpulan sebagaian besar organ tubuh seperti pencernaan, ekskresi, dan reproduksi.

- Mantel membentuk rongga mantel kantong tinta yang berisi cairan.

Fungsi mantel sebagai paru-paru.

Fungsi Cairan yang terdapat di dalam mantel yaitu sebagai senjata untuk menghadapi musuh dengan cara menyeprot.

Klasifikasi

Mollusca merupakan filum terbesar dari kingdom animalia.berdasarkan bentuk tubuh,jumlah cangkang,menurut tipe kaki, posisi kaki, ,Molluska dibedakan menjadi 8 (delapan) kelas yaitu :

1.      Kelas Polyplacophora
                     Pelecypoda Dikenal dengan istilah "chiton" yaitun cangkangnya tersusun seperti genting ( beberapa di antaranya memiliki ornamen duri-duri ), terdiri dari beberapa species dan sebagian besar hidup di laut dalam yang memiliki ciri khas, yaitu kaki berbentuk pipih seperti kapak dan memiliki dua buah cangkang pipih yang setangkup sehingga disebut juga Bivalvia

Misalnya

1. kerang (Anadara sp.)

2. tiram mutiara (Pinctada margaritifera dan Pinctada mertinsis)

3. kerang raksasa (Tridacna sp)

4. kerang hijau (Mytilus viridis)

klasifikasi ilmiah

Kerajaan : Animalia

Subkingdom : Metazoa

Divisi : Kerang-kerangan

Kelas : Polyplacophora ( , 1816Blainville, 1816)

2. Kelas scaphopoda

Hewan ini disebut tusk-shells atu siput tering karena taringnya mirip gading gajah atau taring pada umumnya cangkang scaphopoda terbuka pada keduanya ujungnya dan hewan ini hidup dengan cara membenanmkan diri pada substrak pasir yang bersih di laut dangkal,tetapi pada beberapa spesies terdapat pada kedalaman 1.850m.

Kaki hewan ini berukuran kecil sperti proboscis,pada kepala terdapat mulut dan captaculatetapi tidak ada mata dan tentakel sebagai alat indra.

Klasifikasi ilmiah

Kerajaan : Animalia

Divisi : Kerang-kerangan

Kelas : Scaphopoda (Bronn, 1862)

3. Kelas Pelecypoda (Bivalvia)

Bivalvia (berarti dua cangkang) adalah kelas dalam moluska yang mencakup semua kerang-kerangan yang memiliki sepasang cangkang. Nama lainnya adalah Lamellibranchia, Pelecypoda, atau bivalva. Ke dalam kelompok ini termasuk berbagai kerang, kupang, remis, kijing, lokan, simping, tiram, serta kima,meskipun variasi di dalam bivalvia sebenarnya sangat luas.

Kerang-kerangan banyak bermanfaat dalam kehidupan manusia sejak masa purba. Dagingnya dimakan sebagai sumber protein. Cangkangnya dimanfaatkan sebagai perhiasan, bahan kerajinan tangan, bekal kubur, serta alat pembayaran pada masa lampau. Mutiara dihasilkan oleh beberapa jenis tiram. Pemanfaatan modern juga menjadikan kerang-kerangan sebagai biofilter terhadap polutan.

Klasifikasi ilmiah

Kerajaan : Animalia

Filum : Molusca

Divisi : kerang-kerangan

kelass : Bivalvia

Rostroconchia

subkelass : Palaeotaxodonta

Isofilibranchi

Pteriomorphia

Herteroconchia

Anomaldesmata

4. Kelas Gastropoda

dalam bahasa latin gaster artinya perut, podos artinya kaki. Gastropoda adalah kelompok hewan yang menggunakan perut sebagai alat gerak atau kakinya.

Misalnya

- siput air (Lymnaea sp.)

- remis (Corbicula javanica)

- bekicot (Achatia fulica)

klasifikasi ilmiah

Kerajaan : Animalia

Divisi : Kerang-kerangan

Kelas : Gastropoda (Cuvier, 1797)

5. Kelas Cepholopoda

Cephalopoda dalam bahasa latin, chepalo artinya kepala podos artinya kaki, jadi cephalopoda merupakan Mollusca yang memiliki kaki di kepala. Hidup Cephalopoda seluruhnya di laut dengan merayap atau berenang di dasar laut dan hewan ini mampu bergerak cepat dengan berenang

Misalnya

1. Sotong (Sepia officinalis)

2. Cumi-cumi (loligo sp)

3. Gurita (Octopus sp)

Klasifikasi Ilmiah

Kerajaan : Animalia

Filum : Mollusca

Kelas : Cephalopoda (Cuvier, 1797)

Subklas : Nautiloidea

: Ammonoidea

: Coleoidea

6. Kelas Coudofoveata (Chaetodermomorpha)

Caudofoveata juga dikenal sebagai Chaetodermomorpha yaitu merupakan kelompok moluska dengan bentuk tubuh silindris dan tidak mempunyai cangkang tidak mempunyai kaki,dan mantel menutupi seluruh permukaan tubuh untuk penganti cangkang Chaetodermomorpha adalah hewan yang hidup sebagai bentos laut dan pemakan sedimen, Chaetodermomorpha memiliki ciri khas yaitu tidak di jumpai sistem organ seperti pada moluska seperti radula.

Klasifikasi ilmiah

Kerajaan : animalia

Subkingdom : metazoan

Divisi : kerang-kerangan

Kelas : caudoveata

Keluarga : chaetodermatidae

Limifossoridae

Prochaetodermatidae

Falcidentidae

Matechaetodermatidae

Scutopidae

7. Kelas Monoplacophora

Hewan yang mempunyai bentuk tubuh seperti siput kecil berukuran 3mm sampai 3cm tubuh bagian dorsal tertutup dengan sebuah cangkang bagian ventral terdapat sebuah kaki yang datar dan bundar,di bagian lateral dan posterior kaki di kelilingi rongga mantel yang luas dalam rongga mantel tersebut terdapat 5 atau 6 pasang cetenidia monopectinate serta 5 pasang atau 6 pasang ginjal.

kepala tampak jelas saluran pencernaan lengkap ,mulut di lengkapi radula,anus di bagian posterior,semua jenis adalah deposit,reproduksi seksual,dioecious dan pembuahan di luar ataufertilisasi eksternal.

kelas ini hanya di temukan dalam bentuk fosil dari cambrian dandevonian sekitar 500 juta sampai 350 juta tahun yang lampau.

pada tahun 1952 di temukan spesies yang hidup di jurang dasar di samudera pasifik di lepas pantai costa rice pada kedalaman 2.000 m sampai 7.000 m .sejak itu ditemukan 11 spesies,semuanya termauk dalam satu ordo.monoplacophora di temukan pada bagian timur pasifik.

Monoplacophora yang berarti "bearing satu piring", adalah sebuah kelas dari dimeriamiThese organisms were known only from the record, ranging from the early to the mid- periods (ca. 550 - 380 million years ago) ^{[ 1 ]} until April 1952, when a living specimen was collected from deep depths in the off 's Pacific coast. ^{[ 2 ]} In 1957 that species was described and named Neopilina galatheae by its discoverer, Danish biologist Henning M. Lemche (1904-1977) ^{[ 3 ]} .. sangat Sedikit yang diketahui tentang monoplacophora meraka They have a single, flat, rounded bilateral shell that is often thin and fragile; it ranges in size from 3 to 30 millimetres.Hanya terdiri dari beberapa species, bentuknya mirip limpet (kerang topi) dengan lubang pengeluaran air pada apex atau puncaknya. Hidup di laut dalam dan jarang.

Klasifikasi ilmiah Monoplacophora

Kerajaan : Animalia

Filum : kerang-kerangan

kelass : Monoplacophora

kelompok : Cyritonellida

Tryblidiida

8. Kelas Neomeniomorpha

Adalah hewan yang memiliki bentuk tubuh seperti cacing,memanjang menurut sumbu anterior posterior tidak mempunyai cangkang,kepala tidak jelas tidak mempunyai alat ekresi maupun gonoduct,bahkan beberapa spesies tidak mempunyai radula.panjang tubuh 1mm sampai 30cm.dan hidup di laut dan biasa terdapat pada koloni coelenterate,karena sebagai hewan karnivora merupakan pemakan polip-polipnya.terdapat 180 spesies,semunya hermafrodit, di bagi menjadi dua ordo atas dasar jumlah lapisan kapur dan ada atau tidakadanya papilla epidermis.

DAFTAR PUSTAKA

Anugrah nontji, 2008 plankton laut lipi press Jakarta

Suryarso 2002. Profil sumber daya kelautan perairan selat malaka pusat penelitian oseanografi,lembaga ilmu pengetahuan Indonesia.

Treves, Keren (2003). Helvetica Chimica Acta "Aragonite Formasi di Chiton (kerang-kerangan) girdle". Helvetica Chimica Log 86: 1101. Doi: 10.1002/hlca.200390096. edit

Soegioarto, A. 1965 Perkembangan oseanologi di Indonesia di Indonesia 1945-1965 research di Indonesia.III.Pertanian.Depertemen urusan riset Nasional, Jakarta

Raymont, J. E. 1980. Plankton and Productivity in The Oceans. Vol. 1: Phytoplankton. Pergamon Press, Oxford: 489 pp

Alginat

2011-05-16T06:54:00.000-07:00

A. Pengertian Alginat

Alginat merupakan fikokoloid atau hidrokoloidyang diekstrksi dari phaeophyceae (alga coklat).senyawa tersebut merupakan suatu polimer linier yang disusun oleh dua unit monomerik,yaitu β-D-mannuronic acid dan α-L-guluronic acid. Adapun rumput laut komersil sebagai penghasil alginate berasal dari genus-genus laminaria, lessonia, ascophyllum, sargassum, and turbinaria.

B. Ekstraksi Alginat

Ekstraksi adalah pemisahan satu atau beberapa bahan dari suatu padatan atau cairan dengan bantuan pelarut. Ekstraksi merupakan salah satu cara pemisahan satu atau lebih komponen dari suatu bahan yang merupakan sumber komponen tersebut. Prinsip ekstraksi dengan pelarut berdasarkan pada kelarutan komponen terhadap komponen lain dalam campuran, pada ekstraksi tersebut terjadi pemisahan antara komponen yang mempunyai kelarutan kecil dalam pelarut yang digunakan, komponen yang larut dapat berupa cair maupun padat, oleh karena itu ekstraksi dengan pelarut dapat dilakukan untuk ekstraksi komponen cairan dari system campuran cairan – cairan maupun cair – padat dan ekstraksi komponen padat dari system campuran padat – padat maupun padat cair .

C. Prinsip mendapatkan alginat

proses ekstraksi alginat dilakukan dalam suasana basa (penambahan larutan Na2CO3), karena alginat larut dalam basa dan tidak larut dalam asam. alga dicuci, kemudian dilarutkan dalam alkali, yaitu larutan natrium karbonat. Setelah selulosanya hilang, maka alginat dapat dipisahkan dengan cara pengendapan dalam bentuk garam kalsium atau asam alginat. Bila hasilnya kalsium alginat, maka endapan itu sebaiknya dicuci dengan asam sehingga hasilnya berubah menjadi asam alginat, kemudian ditambah basa untuk memperoleh jenis garam yang di kehendaki .Pada umumnya pembuatan alginat terdiri atas seleksi, pemotongan, perendaman, pengendapan dan pemurnian.

D. Fungsi Alginat

Alginat berfungsi sebagai pemelihara bentuk jaringan pada makanan yang di bekukan, counteract penggetahan dan pengerasan dalam industri roti berlapis gula, pensuspensi dalam sirop. Pengemulasi dalam salad dressing, serta penambahan busa pada industri bir. Dibidang bioteknologi alginat digunakan sebgai algin-immobilisasi sel dari yeats pada proses produksi alkohol, dibidang farmasi dan kosmetik alginat di manfaatkan dalam bentuk asam alginat atau garam sodium alginat dan kalsium.