Excellente présentation vendredi passé au Microclub [1] par Sandor Kasas, du Laboratoire de Physique de la Matière Vivante (LPMV) de l’EPFL. Il nous a expliqué comment les microscopes à force atomique permettent d’observer, de filmer voire de palper les “briques de la vie” (protéines, enzymes, ADN) en plein action.

Il a commencé par nous expliquer comment fonctionne un microscope à force atomique, AFM pour les intimes. C’est une évolution du microscope à effet tunnel (STM) inventé (en Suisse) en 1981 par Gerd Binnig et Heinrich Rohrer. Ils ont obtenu pour ça le prix Nobel 5 ans plus tard seulement (un record récemment battu par Obama).

Le principe du STM consiste à promener une pointe ultra fine au dessus d’une surface à observer, et à mesurer le “courant tunnel” produit par les électrons passant de l’échantillon à la pointe, ce qui permet de mesurer la distance entre les deux et de produire des images avec une résolution sub atomique. Plus fort encore : en appliquant une plus forte tension entre la pointe et l’échantillon, on parvient à coller un atome à la pointe, puis aller le déposer à un endroit précis, pour réaliser des choses incroyables comme celle-ci:

Le STM souffre toutefois de quelques limitations: il ne fonctionne que dans un vide très poussé, avec des échantillons conducteurs d’électricité refroidis bien en dessous de 0°C.

Ces inconvénients n’existe pas avec l’AFM, qui “palpe” la surface en mesurant avec un laser la nanométrique flexion  d’une minuscule poutre portant la pointe, sous l’effet combiné des forces  de Van der Waals (attractive) et électrostatique (répulsive). Avec un AFM, on peut observer des échantillons dans l’eau, à température ambiante. On peut observer de la matière vivante !

Sandor Kasas nous a ainsi montré de spectaculaires images de brins d’ADN  comme celle-ci, qui sera expliquée en détail plus bas:

Mieux encore : on arrive à  appliquer des forces très précises sur l’échantillon, en appuyant les quelques atomes de l’extrémité de la pointe dessus.  Après avoir déposé  des microtubules sur un substrat percé, l’équipe du LPMV est ainsi parvenue à mesurer les modules d’élasticité et de cisaillement de ces constituants de la paroi cellulaire [2]!

Plus fort encore : l’AFM permet de mesurer la force avec laquelle des protéines se lient entre elles, et de mieux comprendre des phénomènes biochimiques inaccessibles jusqu’ici. Sandor Kasas nous a ainsi présenté une étude sur le “complexe snare” , la membrane cellulaire du bout des axones où les neurotransmetteurs sont libérés pour transmettre l’influx nerveux entre les neurones. En mesurant les forces d’adhésion entre les protéines syntaxin 1 (sx1), SNAP-25 (S25) et VAMP 2 (V2), les chercheurs sont parvenus à  comprendre comment elles étaient agencées et comment  la toxine du tetanos (TeTx) perturbe le fonctionnement de ces protéines. [3] Wow !

Mais la recherche qui m’a le plus excité est celle qui a produit les images d’ADN plus haut. L’ADN est une très longue molécule : chacune de nos cellules en contient environ 1 mètre, super enroulée en une minuscule pelote, ce qui cause inévitablement des noeuds. Mais des “têtes de lecture” se promènent le long des brins d’ADN pour les décoder ou les répliquer, et les noeuds risquent de bloquer ce mécanisme vital.

Heureusement, il y a la topoisomérase II. C’est la présence de cette enzyme qui permet à la pelote de la première photo de se dénouer complètement en un petit quart d’heure. On n’est pas encore certains de comment elle fait, mais les chercheurs du LPMV aimeraient bien poursuivre leurs travaux [4] et prouver qu’elle triche en coupant un brin et en le raccommodant après avoir croisé l’autre! Un éviteur d’axe biologique ! incroyable, non ?

Cette présentation fait partie des 10 meilleures auxquelles j’aie assisté, toutes catégories confondues. Merveilleusement multidisciplinaire, on naviguait en toute confiance entre mécanique quantique et biologie, entre chimie, optique et dynamique. Un régal. Merci Dr. Kasas !

Références:

1. S Kasas, “Presentation Microclub 2009″, (pdf des slides avec encore plus d’images)
2. A Yersin et al “Interactions between synaptic vesicle fusion proteins explored by atomic force microscopy“, Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS), July 22, 2003 vol. 100 no. 15, p 8736-8741
3. A. Kis, S. Kasas et al “Nanomechanics of Microtubules”, Physical Review Letter, 2002, Vol. 89, Nr 24
4. Erika Ercolini “Scaling Properties of DNA Knots Studied by Atomic Force Microscopy”, EPFL Thèse No 4041, 2008

logo de l' "abandonware"

Ne jetez plus vos vieux magazines d’informatique! Scannez-les et envoyez-les à abandonware-magazines.org. Ce site collectionne les très vieux numéros de Micro-Systèmes, l’Ordinateur Individuel et autres Soft&Micro. A part faire couler une petite larme nostalgique en relisant le test complet du TRS-80 ou du VIC-20, ce site contribue à préserver l’histoire de l’informatique.

La notion d’abandonware est surtout appliquée dans le domaine du logiciel, où certains considèrent qu’un  logiciel de plus de 10 ans qui n’est plus commercialisé ni supporté, et donc ne rapporte plus d’argent à ses auteurs, peut être mis à disposition gratuitement. C’est un peu limite du point de vue du droit d’auteur qui protège les œuvres jusqu’à 70 ans après la mort de leurs auteurs, mais c’est toléré…

Le site des vieux jeux, c’est là. Bon, je retourne faire quelques tableaux de Lemmings : la version Win95 tourne très bien sur ma bécane Windows Seven 64 bits. On pondait du code bien foutu, à l’époque…

Or donc Vista et W7 supportent les liens sur les arborescences NTFS. Jusqu’ou? voici quelques expériences, faites sur un dique à 2 partitions: C: et D: qui ont Vista et W7 64 bits. Le système démarré obtient le C:, l’autre le D: et respectivement. Un seul répertoire \temp est suffisant; on peut le créer ainsi:

C:\>mklink /J temp d:\temp
Jonction créée pour temp <<===>> d:\temp

Ainsi l’on voit c:\temp et D:\temp, mais le “vrai” est sur D:, est c’est transparent:

C:\temp>dir
 Le volume dans le lecteur C s'appelle Vista
 Le numéro de série du volume est 4C45-D48C
 Répertoire de C:\temp
20.06.2009  11:02    <REP>          .
20.06.2009  11:02    <REP>          ..
11.06.2009  10:05           131'906 cmd-c.pdf
06.06.2009  06:25               403 driverinst.log

Pour la petite histoire, le disque C: avait déjà un lien sur c:\temp, nommé tmp. Ce dernier était un moment orphelin, vu que le répertoire cible “C:\temp” était détruit en vue de le remplacer par le lien sur son alter-ego de D:\temp. Et maintenant, si je liste C:\tmp, le contenu est automatiquement celui de D:\temp !

Qui dit mieux? Un programme, pour voir. La tricherie est assez monstrueuse: j’envisage de lancer non moins que Firefox de W7 (en 32 bits, donc dans le répertoire x86) par la session Vista. Un premier essai ne fonctianne pas, car des résidus sont restés dans “Programm Files” de Vista:

C:\Program Files>mklink /J "Mozilla Firefox" "d:\Program Files (x86)\Mozilla Firefox"
Impossible de créer un fichier déjà existant.

La destruction du répertoire soigne le mal; et on reprend:

C:\Program Files>mklink /J "Mozilla Firefox" "d:\Program Files (x86)\Mozilla Firefox"
Jonction créée pour Mozilla Firefox <<===>> d:\Program Files (x86)\Mozilla Firefox

Ensuite, je crée le raccourci sur l’EXE mappé dans le lien. Celui-ci possède le répertoire: “C:\Program Files\Mozilla Firefox\firefox.exe”. Il vise dont à travers le lien! Et ça fonctionne pile-poil.

En conclusion, on peut grâce aux liens arranger  des configurations sans ré-installer, installer à double ou copier les mêmes données. Prudence avec les backup…

Yves Masur

Si j’avais eu un abonnement chez Swisscom ou Orange, j’aurais pris un iPhone sans trop hésiter, vu l’enthousiasme des heureux propriétaires que je connais. Mais je suis chez Sunrise depuis longtemps, et la politique tout de même assez restrictive d’Apple sur ce qui peut tourner sur son bijou m’embête un peu, donc j’ai choisi un “Google Phone”, plus précisément le tout récent “HTC Magic” tournant sous le système d’exploitation de Google : Android.

La vidéo ci-dessous montre bien les bases d’utilisation de l’engin:

Sur ce genre d’appareils, le téléphone n’est plus qu’une fonction parmi de nombreuses autres : ce sont de véritables ordinateurs de poche. Voici mon impression après une petite dizaine d’heures de configuration et d’utilisation.

1. quelques secondes après la mise sous tension, j’avais tous mes contacts, mon agenda et mes e-mails dans la main : la synchronisation avec GMail et Google Agenda est un point très fort en faveur du Google Phone si vous utilisez déjà les outils de Google
2. Le problème principal, c’est le “clavier”. Il est vraiment difficile de taper vite et juste sur les toutes petites touches apparaissant à l’écran. C’est à peine  mieux en tournant l’appareil dans le sens de la largeur, mais alors on ne voit plus rien de ce qu’il y avait à l’écran. En plus, c’est un clavier AZERTY qui apparait lorsque le système est en français …
3. Mieux vaut avoir un WiFi sous la main pendant les premières heures d’utilisation, car on charge vite quelques dizaine de megas (l’option surf de Sunrise ne permet que 250 Mb/mois). J’ai donc commencé par charger quelques application utiles:
   • APNdroid, pour enclencher/déclencher la connexion 3G ou EDGE à volonté et éviter ainsi les mauvaises surprises en fin de mois
   • NetMeter, pour mesurer le trafic sur les différentes connexions
   • WeFi, pour se connecter automatiquement aux WiFi ouverts.
4. Musique : un point fort de l’iPhone, c’est le célèbre iTunes et son système de synchronisation. Pour l’HTC Magic, j’ai trouvé la combinaison gagnante:
   • “MediaSync” de Salling Software, qui permet de synchroniser iTunes avec beaucoup de portables non-Apple dont mon HTC Magic
   • Tunewiki. Ce player spectaculaire a immédiatement remplacé celui fourni par défaut. Il permet de naviguer dans les artistes, albums et morceaux presqu’aussi facilement qu’iTunes, affiche aussi la couverture de l’album, mais en plus il affiche les paroles de chansons (la vocation première de tunewiki, remonte les morceaux écoutés sur last.fm et, nec plus ultra, recherche sur YouTube les clips des morceaux écoutés.
5. le PhoneBook de VoxMobili est une autre découverte remplaçant avantageusement l’application “Contacts” d’Android. On y voit d’un coup d’oeil non seulement les contacts, mais l’historique des dernières communications avec eux. Les anniversaires et leur rappel sont aussi gérés par PhoneBook
6. Les autres applications que j’ai rapidement installées me permettent de rester connecté à facebook, LinkedIn et Meebo. NewsRob me permet de lire les dernières nouvelles de mes flux RSS sur Google Reader.  Mais surtout, Beelicious me permet de consulter mes indispensables sites favoris sur delicious.
7. Doté d’un GPS et d’une boussole, le HTC Magic utilise évidemment Google Maps pour a “killer app” que je viens de découvrir, c’est Wikitude.
8. Autonomie : j’ai constaté environ 8h d’utilisation intensive sur WiFi, et la batterie ne s’est vidée que de 5% pendant la nuit de 8h suivante malgré la réception de plusieurs e-mails et un tas d’applications ouvertes.

Bref, jusqu’ici je dirais que le Google Phone est au moins aussi puissant que l’iPhone, mais certainement un peu moins intuitif à utiliser. Il y a aussi moins d’applications Android pour l’instant, mais ça va changer. Voici pourquoi :

1. Apple a une politique restrictive sur les applications qui peuvent tourner sur leur iPhone. Ils touchent notamment des royalties sur tous les logiciels vendus sur iTunes, et interdisent donc les moyens qui permettraient de contourner ce monopole. Ainsi, les iPhone ne peuvent pas faire tourner d’application Java ou Flash. Pour développer des applications pour iPhone il faut les programmer avec le langage d’Apple (Object Pascal) sur le SDK d’Apple qui tourne sur un Mac d’Apple uniquement.
2. A l’inverse, Google joue l’ouverture : l’explorateur supporte Flash (bientôt, en fait…) et Java. Java est d’ailleurs le langage de base pour le développement d’applications Android sur la base d’un SDK disponible gratuitement sous Windows, Linux et aussi sous Mac. On voit même apparaitre des choses comme Android Scripting, qui permet de réaliser de petites applications en script LUA ou Python (mon langage préféré du moment!) , quelque chose de formellement interdit par la licence de développement d’Apple.

Apple a une longueur d’avance, mais Google va très vite. Choisis ton camp camarade, moi j’ai chooisi.

• comparaison iPhone / HTC Magic

Chapitres choisis de la conférence du 19 juin 2009 par Björn Rump

la finance actuellement : savoir naviguer dans la tempête

Introduction

Les paysans, un exemple à suivre. Une comparaison:

1 : Similarités

2 : Différences

Les raisons de choisir les fonds de placement

A cause de leur transparence!

• En Suisse il existe plus que 14′000 fonds, en avril 2006 >>> 8000 !
• Ils sont tous contrôlés par la FINMA, ex. commission fédérale des banques.
  et doivent publier journalièrement leur dernière valeur nette. Il n’est pas facile de tuyauter.
• Par contre la gestion d’un fond est une entreprise bien lucrative et avec peu de risque, c’est la raison que le nombre de fonds en Suisse augmente chaque année.
• Similairement aux sportives, le publique peut connaître et comparaître leur performances. Similairement à celle d’un athlète de pointe, d’un joueur de tennis, d’un skieur ou d’un joueur de golf, tout le monde sait qu’il son vraiment top. Il est d’importance secondaire comment ils arrivent à leur performance (par ex. la marque de son équipement), seul leurs résultats sportifs compte. Pour les fonds il est en général très difficile de juger leur performance réelle. Leurs gestionnaires et les banques n’aiment pas les comparaisons. Mais comme les comparaisons sont possibles, la concurrence entre les gestionnaires joue.
• La banque de données du Fund Selection Service montre les résultats de tous les fonds accrédités en Suisse durant les 5 années passées. En calculant une moyenne des années passées il est possible de comparer les rendements en en calculant les intérêts pondérés.
• Les différences de ces résultats sont énormes. Les meilleurs rendent un multiple de la moyenne, à ne pas parler du dernier de la liste qui se nomme « agessive growth » et qui a perdu plus que 6 % par an durant les 5 années passées !
• A ne pas à oublier, en Suisse les gains en capital sont libre d’impôts.

• .Fund Selection Service

Conclusions

Investir avec succès est un travail sérieux et de longue haleine. Pour atteindre des résultats sérieux, ce n’est pas un jeu. Il existent maintes théories qui ne résistent à aucun test ou comparaison.

Même pour trouver un gestionnaire sérieux, un conseil qui défend vos intérêts, il faut du temps et de l’expérience. Les meilleurs gardent bien leur stratégies, et demande un dépôt minimum de 1 Moi. $. et plus. Exception, Warren Buffet, en commencent comme garçon, an appliquant une stratégie bien recherchée systématiques et à long terme il est devenu en des homes les plus riches en Amérique. Il a même fondé des fonds qui appliquent sa stratégie au bénéfice de beaucoup de citoyens comme vous et mois.

Selon mon expérience de plus de 40 ans, un placement en fonds bien choisi représente la meilleure stratégie, du débutant au investisseur moyen. Cela coûte quelque chose, mais un bon choix en vaut un multiple.

Pas faire de l’agent —> Madoff, – Lehman

mais gagner de l’argent —> comme Warren Buffet

Choisissez vous-même !

References

1. Management :  Fredmund Malik “Le Management efficace : diriger, réussir, vivre“, 2008, Economica, Paris, ISBN 978-2-7178-5396-4
2. Statistics: K.A. Brownlee, “Industrial Experimentation“
3. Analyses: Mark Tinghino “Technical Analysis Tools“, Page 215
4. Psychologie: Jacob Bernstein, “ The Investors Quotient“

Win7 : le bon

Après quelques jours d’utilisation, voici un petit bilan de Win7. Parlons déjà de ce qui fonctionne bien.

Il est facile à installer: image ISO, créer un DVD, lancer l’installation. Choisir la partition non-Vista. Ainsi, il crée un “dual-boot” qui permet de choisir. Curieusement, mes disques étaient ainsi:

C: Vista et programmes -et- D: données

Avec Win7, je me retrouve les lettres de lecteurs inversées. Par contre il supporte parfaitement le NTFS de Vista. Evidemment, les liens créés avec la commande MKLINK pointent faux sous Win7.

Le menu Démarrer est (a mon avis) moins perturbant et difficile à régler que sous Vista: il ressemble plus à un tableau, présentant des portions d’Explorer: déplacer, copier, renommer y est facile.

Win7 boote plus vite que Vista; mange moins de mémoire. Et utilise 4 Gb sur 4, alors que Vista n’utilise que 3,5 Gb. Même si j’ai une version 64 bits, toute les applications 32 bits fonctionnent parfaitement. Même l’application Sysinternal “Process Explorer”, le remplacement du Tasmanager est OK. La gravure de DVD avec CDBurnerXP, la conversion de son MP3 par dBpowerAMP, l’inevitable OpenOffice 3.1, tout fonctionne.

Certaines applications, que j’avais la flemme d’installer, ont été simplement copiées. Le dilemne est dans quel répertoire: “c:\Program Files” désormais dévolu aux applications 64 bits, ou dans “c:\Program Files (x86)” ? La tricherie ne marche bien que dans le premier, à cause du nom du chemin.

Win7 : le moins bon

Tout ne se passe pas sans douleur.  Des détails? la webcam pas reconnue (je ne désespère pas), la gestion de l’énergie semble mal fagotée: l’écran s’allume à demi luminosité, et la première combinaison “Fn + soleil” le met à fond, ensuite la progression est correcte. Au prochain stand-by, ce sera à refaire, la luminosité n’est pas mémorisée.

Si le driver USB de mon stylo optique, prévu pour Win XP a pu marcher en le lançant comme Administrateur dans Vista, là il ne voit pas la présence du stylo. Si je plante le stylo dans la prise (son: bidup…) Win7 lui cherche un pilote… Idem pour installer des convertisseurs série RS-232 USB.

J’ai déjà parlé de la limitation video, sans savoir si c’est Win7 ou quoi?

Avast n’a pas apprécié le passage.

Et je le voit présentement, Firefox plante si l’on veut télécharger une image! Je saisi donc le reste de ce texte dans IE8, 64 bits!

Pour les ennuis, il ne reste qu’à suivre les conseils avisés du Dr Goulu: conserver une émulation de Vista…

Yves Masur

Le coup du DVD

Argh! me suis-je exclamé, lorsque j’ai tenté de visionner un DVD. En effet, un premier message donne: Le Lecteur Windows Media ne peut pas lire ce DVD, car il est impossible d’activer la protection de copie analogique sur l’affichage de sortie. Essayez d’installer un pilote récent pour votre carte vidéo.

La solution proposée sur le net est : Your DVD decoder software needs to be configured. If you have another DVD player program installed on your computer, play the DVD using that program, and then try playing the DVD in Windows Media Player again.

Bon, j’essaie le Dell MediaDirect, qui se lance…  Et affiche: L’application ne peut pas lire ce DVD en raison de l’affichage…(etc)

De dépit, j’essaie le DVD sous Vista… et tout fonctionne! Bon, me dis-je, il faut copier du HDD Vista au HDD Win7  le répertoire au complet au lieu de l’installer. Je vous fait grâce des problèmes de droits; et j’y arrive.

Je lance cette version copiée… et rebelotte. Même pb.

Faiblesse de Win7?

//Yves

Besoin de résoudre un système d’équations linéaires (N équations à N inconnues) rapidement ?

Les tableurs les plus répandus peuvent vous aider !

Avec Excel, tout est expliqué ici en anglais : on peut soit utiliser le “solveur”, soit les fonctions matricielles INVERSEMAT et PRODUITMAT (respectivement MINVERSE et MMULT en anglais) de façon toute simple :

Ces fonctions existent aussi dans le “Calc” d’Open Office, mais limitées à 25 équations. (je ne connais pas la limite avec Excel)

MINVERSE et MMULT existent aussi parmi les fonctions tableau du tableur de Google Docs, sans limitation connue

Décidément, ce tableur gratuit, puissant et en ligne n’a plus grand chose à envier à ses ancêtres …

Puisqu’on peut télécharger une version de Windows 7 qui marchera jusqu’en juin 2010 gratuitement, autant en profiter pour faire un grand nettoyage de printemps. J’avais deux options :

1. mettre à jour mon Vista qui avait été mis à jour d’un XP qui avait peut-être bien été mis à jour depuis Windows 2000 il y a longtemps
2. faire une nouvelle installation, mais dans ce cas autant en profiter pour passer au 64 bits (x64 pour les intimes), maintenant que presque tous les logiciels tournent en 64 bits aussi ou en mode compatibilité sans problème.

J’étais très tenté par la deuxième solution, mais elle impliquait de “perdre” de nombreux programmes tout bien configurés, ou du moins de les laisser sur la partition Vista, m’obligeant à rebooter pour y accéder …

Et je suis tombé sur VMware Converter : Eureka ! Ce soft aussi génial que gratuit tourne sur tous les Windows* depuis NT4 SP4+ et fabrique une “machine virtuelle” à partir d’une machine physique !

J’ai ainsi pu sauvegarder mon système Vista complet sous forme d’un très gros fichier sur un disque USB, puis installé Seven x64  sur une autre partition que Vista par prudence ( mais ça ne s’est pas révélé utile, j’aurais tout aussi bien pu écraser la partition Vista tout de suite)

Ensuite il ne reste plus qu’à installer VMWare sur Seven, le lancer, charger la machine virtuelle Vista et tadaaammm! :

Seven et Vista (cliquez pour agrandir)

Je me retrouve avec mon nouveau système tout neuf sept, tout propre et dedans dans une fenêtre mon vieux système pourri mais bien utile d’ici à ce que j’aie tout migré.

Premières impressions de Seven:

En fait c’est les deuxièmes parce que j’avais déjà installé la Beta dans un VMware sous Vista, pour voir. Donc:

1. Seven = ce que Vista aurait du être : plus petit, plus simple. Plus rapide ? c’est toujours plus rapide quand c’est neuf sept. Faudra voir à l’usage.
2. ils ont encore changé la “barre des tâches” et ça bouleverse (encore) nos habitudes, mais le nouveau système n’est pas mauvais.

Note* : convertir une machine Windows 98 est apparemment aussi possible, mais en utilisant une combine avec Norton Ghost

Samedi 16 mai 2009 à l’EPFL

L'affiche officielle. Cliquez dessus pour l'agrandir

Les nouveautés de cette année sont multiples :

• plus de 1500 places d’atelier pour les jeunes, avec la moitié des places réservables par internet
• plus de 700 robots pour les visiteurs et visiteuses, soit à emporter, programmer ou simplement voir fonctionner
• une vingtaine d’expositions de robots par des écoles, clubs, associations et entreprises
• des concours de robots spectaculaires et uniques au monde
• le même jour, possibilité de visiter les portes ouvertes de l’université de Lausanne, Les Mystères de l’UNIL

En résumé, une journée unique, riche en émotions et en opportunités d’en apprendre plus sur la robotique et la technologie en général.

Important: il est fortement conseillé de se rendre sur le site EPFL par les transports public (M1, bus 33) à cause des évènements combinés de l’EPFL (festival) et de l’UNIL (portes ouvertes) en cette journée.

Programme

Présentations :

• 9:30 – 10:30 Introduction à la robotique mobile, par Francesco Mondada
• 10:45 – 11:45 La robotique dans les travaux de maturité, par Ludovic Barman, Antoine Albertelli, Pierre Grydbeck, Daniel et Jean-Claude Besse

Concours :

• 13:00 – 15:00 Robots à hydrogène, concours réalisé avec le soutien financier du “Fond communal pour l’utilisation rationnelle de l’électricité et la promotion des énergies renouvelables” des services industriels de la ville de Lausanne.
• 15:30 – 17:00 Le « triathlon » robotique ! Robopoly = des étudiant·e·s + leurs robots, en particulier le kit PRisme (développé par le club depuis sa création). Le Grand Concours se sont ces robots qui s’affrontent sur une piste effrénée et lors d’un challenge enflammé.

Expositions : En continu de 9 heures à 18 heures

Ateliers : De 9 heures à 18 heures selon les horaires de chaque atelier

plus d’infos et inscriptions sur http://festivalrobotique.epfl.ch/