Nishihara Laboratory

来週月曜からはタイへ

2012-01-27T17:14:00.000+09:00

去年から、組織がかわり、新たな長崎大学院水産・環境科学総合研究科ができた。僕は、その中の海洋フィールド科学専攻の教員です。専攻は、5年一貫というプログラムを立てていて、博士を育てるための教育をします。5年間みっちり教育して、政界世界に通用する研究者をだすつもりです。

入試は口述試験や筆記試験があり、高い英語能力も求めている。どの大学とも同じだとおもいます。ただ、我々は必要に応じて、わざわざ海外にいって試験を実地実施することもある。

ということで、来週タイにいきますが、これはタイにいる学生が試験を受けたいからです。僕とあと二人の教員といきます。

タイの最低気温は24℃。最高は30℃前後。

いいですね。長崎には早く夏がこないかな。

アップデート：また感じ漢字の間違いが指摘された。一回ぐらいは校正しないとね。

アップデート２：またやっちゃいました。

祐徳稲荷神社

2012-01-22T14:48:00.001+09:00

初詣。今年も頑張ろう。

金沢大学へのみち

2012-01-18T10:37:00.002+09:00

金沢市は寒かったが、雪は積もっていなかったのでよかったです。金沢駅前のホテルにとまり、駅ビルのなかのレストランで食事をとった。つかれのせいが、8時半ぐらいにねてしまい、気づいたらあさの6時。

駅から、金沢大学までの距離を考えず歩きで、いきました。川をのっぼっていって、合計2時間でついた。いい散歩だ。途中でみられた木造の橋に一瞬完動したが、したからみたら鉄骨。やっぱり、そうだったんだね。でも川・街の風景はよかった。

大学についたら、雪がたくさん積もっていました。向かしはお城の城壁内にあったらしいが、いまはとても綺麗でモダンなキャンパス。

キールン最後の夜

2012-01-17T06:00:00.000+09:00

キールンにいって、河邉先生の共同研究者（Riyarさん）にとてもお世話になった。毎晩つきあってくれて、最後の夜も自分たちの忘年会に参加せてくれた。夕食はＮＴＯＵの忘年会と同じ店だったが、今度は料理の写真がとれたので、よかったです。この周辺では、あの店が有名なだろうね。

そのよるの忘年会にはNTOUのWang先生＋研究室メンバーもいて、Ｄ１のＮ塚くん（河邉研）もいた。

幸せそうなN塚くんです：

あ、それであの料理。何度も食べてもいいイカ入りおこわとビーフンスープ。おこわは本当においしかった。スープは長崎ちゃんぽんのスープをあっさりした感じだった。

ＮＴＯＵのWang先生の研究室メンバーとＦＲＩのMs. Chen＆Dr. Kawabe, and Dr. Riyar & Co..

おまけにキールンの夜市場。暗かったので、あまりいい写真はてれてません。

今年ははno students??

2012-01-16T13:48:00.001+09:00

今年の研究室希望状況が発表された。今年は学生来ないかもな。しかも、藻類は全く人気無いな。桑野先生のとこらも一人だけだ。

仕方がないな。

でも、河端さんには学生がついたのでよかった！

今日はから金沢大学

2012-01-16T08:24:00.001+09:00

長崎空港スタバで萩原先生と朝食をとった。私は金沢大学に行くが、かれは環環境省へ。金沢大学に李くんだと言ったら、「僕は金沢のこと詳しいよ」っと教えたくれました。出新地は金沢だったんだね。

ＮＴＯＵ国際交流推進室

2012-01-15T06:00:00.000+09:00

台湾関係の最後のポストです。

ＮＴＯＵに設置した長大・ＮＴＯＵの国際交流推進室です。

キールンの町

2012-01-14T06:00:00.000+09:00

キールンは港町です。子供のごろの、小売店の多い町に住んでいたこともあるので、ちょっと懐かしいですね。一番最初の写真はホテルです（K Hotel）。その次はお寺。最後にはハーリーのような小舟が二隻公園におかれていた。

台湾はいい！

2012-01-13T06:00:00.000+09:00

あの海岸に小さな広場があり、沖縄の人たちのための記念像があった。いいですね。

台湾の海岸線へ

2012-01-12T06:00:00.000+09:00

忘年会に参加したあと、NTOUの国際交流センターのYvonneさんと仕事の同僚が僕とかわべさんをちょこっとした観光地に連れて行ってくれました。いじさきは和平島という橋でつながっている小さな島です。砂岩の沿岸だったので、波が沿岸を不思議な形に削っていた。もちろん、どのような藻類があるかを確認してみたが、波があらくて足元もすべりやすかったので、海のすぐ近くにはいけなかった。地元の方はアオサのような藻類は集めていた。釣り人も何人かいて、アオリイカ目的で釣りもしていました（イカようのルアーを持っていたのでね）。

うちあげ？忘年会

2012-01-11T06:00:00.000+09:00

いま、台湾は忘年会シーズンです。旧正月をお祝う文化として、いまから盛り上がる。今日の講義のあと、NTOU教職員の忘年会に参加させていただきました。忘年会はキャンパスの近くにあるレストランで昼食をとりながらした。普通の勤務日の昼間だったので、ちょっと不思議でした。カニのすがたあげ（脱皮後のカニなので、まるごと食べれます）やビーフンの面の入ったスープなど、おいしいものがぞくぞくとでてきました。さらに、くじ引きでプレゼントもあたったりして、とても楽しかったです。ちなみに、みなさんはそのまま仕事にもどったようです。

料理の写真をとるつもりだったが、食べるのに忙しくて…でも、海藻の入った一品だけは取りました！キリンサイのようが気がします。台湾では、このサラダよりもいためものやスープにしたりすることが多いいです。

台湾について、講義はよかった

2012-01-10T18:05:00.001+09:00

台湾について、二日め。相変わらず、キールンは曇っていて、雨も降っているが、こんなに寒くとは予想いがいでした。今朝は１５℃もなかったと思うし、ホテルの部屋には暖房もない、ので…ややどぶくさいし、湿っているし。仕方がないですね。

今日は講義の日でした。台湾海洋大学（ＮＴＯＵ）で、大学院生むけに生態系サービスと物理学的要因の関係について講義した。かわべ先生はマグロやヒラメの移動について、うめざわ先生は物質（栄養塩）の循環についても講義した。３人あわせて３時間の模擬講義。なぜこのような講義をしたのかというと、将来ＮＴＯＵと単位交換を含めた学術交流をしたいからです。

かわべ、グレッグ、うめざわの順でしたが、僕とうめざわの講義中、若干寝ている学生がいたな。短期留学中のたつの、やまぐちとなかつかも出席してくれました。３にんともは台湾を大変楽しんでいるようです。

実は今ＮＴＯＵの学生は期末試験中なので、うちらがこの時期にいくのは結構な迷惑じゃないかなとおもいました。長崎大学とＮＴＯＵのスケジュールの違いを乗り越えることも今後の課題だとおもうな。

Kawabe's lecture

Greg's lecture

Umezawa's lecture

Group photo of the participants. In the middle is Dr Hwang, who organized everything.

初めての羽田国際空港

2012-01-09T11:45:00.001+09:00

初めて来た羽田国際空港。何だか、福岡空港と大変似ている感想です。
今はANAのラウンジにいて、うどんやサンドイッチをいただいた。
征矢野研は相変わらず楽しそうにしています。

なぜか写真がでてなかったので、更新しました。

明日から台湾

2012-01-08T20:49:00.001+09:00

明日から台湾へ。台湾海洋大学にお世話になります。月曜日の午後について、火曜日は授業をする。梅ちゃんも河邊さんも授業をします。僕は"The effects of abiotic variables on marine macrophyte biodiversity"と言う講義をします。でも、まだ納得するほどの準備ができていないので、ちょっと不安です。
ところで、まったく関係ない話題ですが、最近家ではAmi Nakazonoのデビューアルバム(Musiq)を毎晩聞いています。Amiはアメリカの~~BOSTON~~New Yorkで活動している若手のjazzアーティストです。Anyway, check-it-out.

あけましたおめでとうございます

2012-01-01T16:10:00.001+09:00

もう、２０１２年ですね。去年は本当に忙しい年でした。ＴＴ審査の最終年度のため、たくさんの資料の準備と不安を感じた。変な膝のけがもするし、おかげで５ｋｇも成長しいた。結局いくつかの活動をそのままほうちし、結構不満のあるとしにもなった。

Ｒゼミはどうしあたらいいのか。

学生の確保はどうしたらいいのか。

論文も書かないと、結果もださないと。

膝の手術もしないと…

２０１２年もがんばろう。

センターにいる仲間のおかげで、テニュアもとれたので、きっと今年もいいことあるな。

研究室紹介

2011-12-21T17:00:00.001+09:00

今年も研究室紹介を河邊先生と石松先生と合同でやっています。3年生に自分の研究の面白さをアピールするばです。
特に気合いがはいっているにはこのかたです。

最後のテニュア・トラックシンポジウム

2011-12-20T09:11:00.002+09:00

平成20年2月にテニュアトラック(TT)助教として長崎大学に着任してから、ほぼ4年がたちます。この4年間いろいろの人にお世話になったおかげで、来年度も残れるようになった。皆さん有難うございます！

このTTプログラムは平成18年に9機関から始まり、から最終的に42機関まで広がった。研究費などが保証され、さらに講義の負担も軽減され本当に恵まれた環境でのびのびと研究ができた。おかげさまで、充実・自立した研究室ができた。

昨日の午後からは長崎大学医学部良順会館ボードインホールで長崎大学の若手研究者の自立的研究環境整備促進プログラムの最終TTシンポが開催された。まずは片峰学長や文部科学省の坂倉さんの挨拶があり、基調講演はプログラム主管である熊谷さんだった。中山理事が長崎大学のTTの事業報告もしてくれました。

片峰学長

文部科学省科学技術・学術政策局基盤政策課長の坂倉さん

独立行政法人科学技術振興機構科学技術システム改革事業プログラムオフィサーの熊谷さん

中山理事

最後には、いくつかのTTの先生の研究発表などもあった。もっとも早く自立して、独立したセンターまで立てた濱田准教授（国の事業仕分けで有名になった低コスト高パフォーマンスのスパコンの開発者）がキーノートとして、発表し、その後は医学（伊藤、新、荻）、水産・環境（梅澤）や化学（鎌田）についての発表があった。発表者全員の写真をとったつもりだったが、出来が悪かったので…濱田さんだけ紹介します。すみません！

濱田准教授

シンポジウムが終了したあと、懇談会がひらかれ今年最後のTT行事(TT最後?)の集まり。江上さん、Richardさんと濱田さんは写真とったとき、いなかったのが残念だ。


左から右：鎌田、Greg、正田、村松、増山、小野寺、伊藤、大山、梅澤、新、荻、南

East China Sea ２０１１シンポ

2011-12-16T18:45:00.002+09:00

11月末、2年に一回、東シナ海周辺の大学があつまり、研究発表したり、学生に国際交流のばを提供している。このあいだは、学生らのポスターの要すを紹介しましたが、ここではシンポの一日前の写真を紹介します。

那覇の国際通りにいってきました。河端さんがあれはミーバイだ！など発言して、店主が「魚博士だな」といって、後日でも食べにきてと言っていました。

センター長は満足したようです。

新ブログを立ち上げました

2011-12-09T09:37:00.001+09:00

統計処理環境「Ｒ」のコードを紹介するためのブログを立ち上げました。

リンクはこちら：http://nagaremo-rnotes.blogspot.com/2011/12/blog-post.html

でくるだけ、週に一回ぐらいのペースで更新したいとおもいます。

今回は作図の紹介です。

久しぶりの１パイント

2011-12-08T19:52:00.001+09:00

かわべさんは講演者の懇親会へ。
僕は、近くのアイリッシュパブで久しぶりのギネスを。

シンポ終了

2011-12-08T19:16:00.001+09:00

震災シンポがぶじに終了した。さまざまな分野の人の発表はいい参考になった。今後も活用できる情報も得た。また、現場の復興の状況もなんとなくわかった。やっぱり、復興の地域差はおおきい。非常にすすんでいるところとまだ手もつけてないようなところも。

開始前の会場

かわべ准教授の講演は濃厚だった。結構うけはよかったとおもう。大学の宣伝もできて、「さすがだな」とおもった。魚類の行動の話、バイテレの話、どうすれば復興につながるか、など多様な話を一つのトークにまとめた。

講演

最後にはパネルディスカッション。復興はどうすすめればいいのか、インフラはどうすればいいのかなどのテーマを中心に、モデレータがすすめた。会場からの質問や意見もあって、活気のあるディスカッションになった。

そういっても、一番印象にのこったのはある講演者の発言です。長期の研究はできない。論文を中心とした評価体制は、若い研究者の研究を制限している。僕もそうおもう。研究いまの時代を反映して、インスタント社会になっている。

ゆっきるいいデータをとって、時間をかけていい論文は書きたい。

東京へ

2011-12-07T18:21:00.001+09:00

今日から東京にきています。東日本大震災についてのシンポジウムに参加するためです。
シンポは明日、センターのかわべ准教授がトークをします。

今年のパソコン運は本当にひどい！

2011-12-01T13:59:00.001+09:00

パソコン。ないと仕事ができない。フィールド調査につかうものを4年前買っていました。4年も頑張ってくれた。とても丈夫で、落としたこともある。海水や水もかぶったこともある。それでも、壊れなかった。

ところが、壊れるはずのないパソコンが漏電して、機動できなくなった。

先月、解析パソコンのハードディスクがだめになって、大変だった。今回はフィールドパソコン（波野ソニックのタフブック）がダウン。漏電して、立ち上がらない状態。今年のパソコン運はひどいな。卒論生のデータが入っているので必死にハードディスクを探し、パソコンを破壊した。とにかく、ハードディスクはどこだ！って言うことです。保険は降りるかもしらないとあとできいたが、もうこんなに破壊したので検証はできないでしょう。データを抽出するのが先だね。

とりあえず、ハードディスクは認識されたので、こんな感じでデータを下ろしています。

8th International Workshop

2011-11-24T22:54:00.001+09:00

初日の５大学シンポ（The 8th International Workshop on the Oceanography and Fisheries Science of he East China Sea）がおわった。今年は１２０人程度の参加者のかげで、非常に活発なシンポジウムになった。キーノートもよかったし、ポスターもひじょうによかった。口頭発よりいい内容だったとおもうぐらいよかった。

自分も午後のセッションで発表したが、あいかわらずオチにない発表でおわった。イントロはよかったよといわらてけどね。やっぱりオチがないので。

今回、自分の研究室の木村くんはポスター発表した。ちゃんと質疑に答えていたそうです。よく頑張った。センターから唯一の４年生の発表者ですが、修士なみに頑張ったとおもいます。

学生の発表風景です。

Recovering data from a failing HD

2011-11-16T08:10:00.001+09:00

ハードディスク修復方法。Xubuntu 11.10の環境で行いました。説明は英語ですが、使ったコマンドは「lshw」, 「ddrescue」, 「dd」, 「mount」, 「resize2fs」, と「e2fsck」です。手順は一番下にあります。修復作業は1日でできますが、久しぶりにやっとので二日以上かかった！

I was using Xubuntu 11.10 when I was trying this.

To get a list of the devices on th PC run fdisk, sudo fdisk -l.

If you are lucky then it will detect the disk. In my case, the OS didn't detect it.

So I tried sudo lshw -C disk -short and cat /proc/partitions to get the name of the device.

Then, I used ddrescue (package name is gddrescue) to image the file. I did this by first running ddrescue --no-split /dev/sdd1 / media/gamma/image /media/gamma/image.logfile, then by trying ddrescue -r 3 /dev/sdd1 /media/gamma/image /media/gamma/image.logfile to try to squeeze every bit of data out of the drive.

Next, I used dd to make another image as backup, so I can try to repair the original. I do this by dd if=/media/gamma/image of=/media/gamma/image_backup. This took a while. Next I tried to mount the image to recovered mount -o ro image recovered as a read-only file, but that failed. The block sizes that were being reported were different. So I fixed that by resize2fs image SIZE, where SIZE is the target size. This time it mounted. Next, I used e2fsck -vyp recovered, recovered is the folder to mount the partition to, to repair the filesystem.

After which I can now look at all my files that I recovered and use rsync to move them all to a safer place!

It took more than two days, but I figured it out and got 90% of my data back!

To summarize:


sudo lshw -C disk -short


ddrescue --no-split /dev/sdd1 /media/gamma/image /media/gamma/image.logfile


ddrescue -r 3 /dev/sdd1 /media/gamma/image /media/gamma/image.logfile


dd if=/media/gamma/image of=/media/gamma/image_backup



mkdir /media/gamma/recovered


mount -o ro /media/gamma/image /media/gamma/recovered


# In my case, I had to resize the image to size SIZE.

resize2fs /media/gamma/image SIZE
mount -o ro /media/gamma/image /media/gamma/recovered

e2fsck -vyp recovered