QUIMICA EN LA USC

NOMENCLATURA IUPAC DE LOS ALCANOS

2024-10-07T17:34:00.000+02:00

Voy a escribir esta entrada para dejar una guía rápida de reglas de formulación de orgánica :

Esta web está muy bien para repasar los conceptos de 2º de bachillerato

http://www.gobiernodecanarias.org/educacion/3/Usrn/lentiscal/1-CDQuimica-TIC/FicherosQ/apuntesformulacionOrganica.htm

NORMAS DE NOMENCLATURA IUPAC DE LOS ALCANOS

Alcanos lineales:

1.- Los cuatro primeros miembros de la serie se nombran como: n-metano, n-etano, n-propano y n-butano. La letra ene (en itálica) seguida de un guión: n-, que se le antepone al nombre (como por ejemplo en n-butano), es para indicar que se trata del isómero de cadena lineal del butano.

2.- El nombre de los alcanos lineales con más de cuatro átomos de carbono se construye del siguiente modo: una raíz, que es un prefijo indicando el nº de átomos de carbono de la cadena: pent (5), hex (6), hept (7), oct (8), non (9), dec (10), undec (11),..., nonadec (19), icos o eicos (20), etc, seguida de la terminación ano.

Alcanos ramificados:

a) con sustituyentes lineales

1.- Se localiza la cadena principal, es decir:

a) la que sea más larga, o si este criterio no decide

b) la que posea mayor nº de sustituyentes, o si este criterio no decide

c) la que posea la menor combinación numérica de los sustituyentes, o si este criterio no decide

d) la que posea la mayor prelación alfabética del sustituyente con el localizador más bajo.

2.- Se nombra la cadena principal como un alcano lineal.

3.- Se nombran los sustituyentes (no ramificados) como alcanos lineales, pero utilizando la terminación ilo en lugar de ano.

4.- Se numera la cadena principal, el nº 1 se le asigna al carbono del extremo de la cadena

a) para el que se consiga la combinación numérica de sustituyentes más baja, o si este criterio no decide

b) al carbono del extemo más próximo al sustituyente de mayor prelación alfabética.

5.- Se construye el nombre del alcano: nombres de los sustituyentes (sin la o final) por orden alfabético, precedidos por sus localizadores numéricos, separados (los sustituyentes entre sí y cada sustituyente de su localizador numérico), por guiones y seguidos al final (sin guión ni espacio) por el nombre de la cadena principal, es decir:

localizador numérico del primer sustituyente por orden alfabético-nombre del primer sustituyente por orden alfabético sin la o final-...-localizador numérico del último sustituyente por orden alfabético-nombre del último sustituyente por orden alfabético sin la o final(seguido sin hueco del)nombre de la cadena principal.

Cuando existen varios sustituyentes no ramificados iguales se indican conjuntamente anteponiendo los prefijos di, tri, tetra,...al nombre del sustituyente. Las posiciones se indican conjuntamente mediante los localizadores numéricos separados por comas y antepuestos al prefijo di, tri, tetra.... Estos prefijos no se tienen en cuenta para establecer el orden alfabético de los sustituyentes.

b) con sustituyentes ramificados

En estos casos se utiliza la regla 3 modificada:

3.- Se nombran los sustituyentes (ramificados) como un alcano ramificado, es decir se siguen los pasos 1-5 del apartado anterior para cada sustituyente ramificado, pero teniendo en cuenta lo siguiente:

a) el carbono nº 1 de un sustituyente es siempre el que está unido a la cadena principal.

b) algunos sustituyentes ramificados tienen nombres comunes muy utilizados (ej: iso..., isopropilo, isobutilo; sec-... o s-... como el sec-butilo o s-butilo, terc-... o t-... como el terc-butilo; etc).

SISTEMA DE NOMENCLATURA R,S (DE CAHN, INGOLD Y PRELOG)

* aplicación: nombrar la configuración de estereocentros, tales como un carbono estereogénico.

1.- Se establece el orden relativo de prioridad de los sustituyentes del centro estereogénico siguiendo las reglas de secuencia siguientes:

a) tiene mayor prioridad el sustituyente cuyo átomo directamente unido al carbono estereogénico tenga mayor número atómico (a igualdad de número atómico tiene mayor prioridad el isótopo de mayor masa).

b) si la regla anterior no decide, se aplica reiterativamente a lo largo de la cadena de cada sustituyente hasta donde sea necesario, es decir hasta el primer punto que nos permita diferenciar entre los sustituyentes. Si los sustituyentes están ramificados, se recorren evaluando en primer lugar las ramificaciones de mayor prioridad.

c) a efectos de establecer el orden relativo de prioridad de los sustituyentes, los enlaces multiples que se encuentren en ellos se transforman en el número correspondiente de enlaces sencillos, añadiéndose los átomos ficticios necesarios para ello.

2.- Se dispone la molécula de modo que el sustituyente de menor prioridad quede lo más alejado del observador; los otros tres quedarán pues dirigidos hacia el observador.

3.- A continuación se recorren los tres sustituyentes de mayor prioridad en orden decreciente de prioridad. Si el sentido de recorrido es horario la configuración del centro es R. Si el sentido de recorrido es antihorario la configuración del centro estereogénico es S.

4.- Los símbolos R ó S correspondientes a cada estereocentro se colocan dentro de un paréntesis. Este paréntesis precede al nombre del compuesto y va separado del mismo mediante un guión. Cada símbolo R ó S va precedido del localizador numérico del estereocentro al que corresponde y separado por comas del siguiente símbolo.

Videos youtube quimica

2011-10-17T05:32:00.000+02:00

Hoy os quiero dejar un recurso que he encontrado en youtube. Resulta que hay un menú
que pone Videos, Música,En directo,Education.
Solemos quedarnos en el primero, os invito a descubrir canales especificos de química:

http://www.youtube.com/education?category=University/Science/Chemistry

2011-10-10T00:06:00.000+02:00

Hola:

Hoy una pequeña nota sobre software libre para quimicos,encontré esta web de la Universidad de la Laguna (Tenerife) que me pareció muy interesante, aquí podéis ver info sobre tres programas Avogrado,Jmol y Open Babel..Me voy a descargar los programas y os daré mi opinión.Creo que es una buena idea, ir usando software especializado para química, para trabajar en casa.

Os dejo el link :

http://selibre.osl.ull.es/Qu%C3%ADmica/applications

si alguien ya conoce estos programas o los usa a partir de ahora, agradeceria opiniones en forma de comentario, gracias.

Base de datos de empresas

2011-10-07T00:56:00.000+02:00

Hola:

Tras el verano comienza un nuevo curso,ánimo a todos, os enfrenteis al grado, esteis en cuarto o quinto de la licenciatura o esteis acabando por libre, aqui seguire subiendo apuntes,curiosidades y cosas que me puedan parecer útiles.

Queria hacer una pequeña entrada sobre las empresas quimicas españolas, ya que me he encontrado una base de datos muy interesante.Creo que es bueno saber, dónde y quién hace los productos que consumimos y que empresas tenemos cerca. Tanto a la hora de buscar un empleo, como para documentarnos como a la hora de pensar en crear nuestra propia empresa creo que esta base de datos puede ser útil.Os dejó aqui el link : http://www.adinte.net/basefeique/indice.htm

ACCESO DIRECTO APUNTES BIOQUIMICA II

2011-06-23T20:17:00.000+02:00

Aqui os dejo la página web de la asignatura de bioquimica 2 ,de la USC , es supercompleta

http://aula.cesga.es/courses/BIOQUIMICAII/document/BioquimicaII/Bienvenida.html?cidReq=BIOQUIMICAII

libros consulta on- line

2011-06-12T16:45:00.000+02:00

Este post se va a ir modificando añadiendo libros que podeis ver on-line:

diccionario de quimica física, en google books: http://books.google.es/books?id=9_7xnVy4GzsC&printsec=frontcover&source=gbs_atb#v=onepage&q&f=false

Quimica general:"quimica la ciencia central": http://books.google.es/books?id=43qKhqwAoLgC&printsec=frontcover&source=gbs_atb#v=onepage&q&f=false

Ingeniería química: operaciones básicas : http://books.google.es/books?id=qsIH0zrUIMEC&printsec=frontcover&source=gbs_atb#v=onepage&q&f=falsehttp://books.google.es/books?id=qsIH0zrUIMEC&printsec=frontcover&source=gbs_atb#v=onepage&q&f=false

proceso frasch

2011-06-11T14:50:00.000+02:00

http://www.textoscientificos.com/quimica/azufre/proceso-azufre-frasch

Este procedimiento produce azufre elemental, que no requería una mayor purificación. Sin embargo, debido a un número limitado de tales depósitos de azufre y el alto costo de trabajar ellos, este proceso de extracción de azufre no se ha utilizado de una manera importante en cualquier parte del mundo, desde el año 2002.

La mayor cantidad del azufre elemental del mundo se ha obtenido por el proceso de Frasch a partir de las piedras calizas porosas que lo contienen. Hermán Fransch desarrolló su ingenioso método, que consiste en fundir el azufre bajo tierra o el mar, y luego bombearlo hasta la superficie. Se utiliza equipo común de los pozos petroleros para hacer las perforaciones hasta el fondo de los estratos cargados de azufre, a una profundidad entre 150 y 750 m bajo tierra.

Se introduce un juego de tres tubos concéntricos, se pasa un tubo de 10 cm a través del de 20 cm, de modo que quede un espacio anular entre los dos, extendiéndolo casi hasta el fondo de la roca cargada de azufre, y se le apoya en un collar que sella el espacio anular entre los tubos de 20 y 10 cm. Un tubo para aire, de 3 cm de diámetro, dentro de los otros, llega hasta una profundidad ligeramente por encima del collar mencionado. El tubo de 20 cm se perfora en dos niveles diferentes, uno encima y otro debajo del collar anular. El conjunto superior de perforaciones permite que escape el agua caliente, y el azufre fundido entra al sistema a través de las perforaciones inferiores.

Se pasa agua caliente a más o menos 160°C (punto de fusión del azufre 115°C) hacia abajo del espacio anular, entre los tubos de 20 y 10 cm y se hace entrar aire comprimido hacia abajo del tubo de 3 cm para que el azufre líquido pueda subir a la superficie.

Más info sobre azufre:

http://www.textoscientificos.com/quimica/azufre

http://html.rincondelvago.com/azufre.html

oxido nitrico

2011-06-09T21:48:00.000+02:00

Esta sustancia es un gas paramagnético
El paramagnetismo es la tendencia de los momentos magnéticos libres (espín u orbitales) a alinearse paralelamente a un campo magnético.

se sintetiza industrialmente a partir del amoniaco y el oxigeno molecular:

4 NH3 + 5 O2 → 4 NO + 6 H2O

En el laboratorio se genera normalmente por reducción de ácido nitrico con cobre al 50%

8 HNO3 + 3 Cu → 3 Cu(NO3)2 + 4 H2O + 2 NO

El NO se oxida facilmente a NO2, se puede apreciar al exponer el NO , que es incoloro, al aire unas nubes café-rojizas que son NO2

2NO +O2--> 2NO2

Pero en un recipiente hermético es muy estable.Cuando se enfría y se licua o solidifica muestra tendencia a formar N2O2.

El NO pierde con facilidad su electrón del orbital de antienlace para formar el ión nitrosilo NO+ que es diamagnético y tiene una longitud de enlace N-O menor.

El diamagnetismo es una propiedad de los materiales que consiste en ser repelidos por los imanes.
Las sustancias, en su gran mayoría, son diamagnéticas, puesto que todos los pares de electrones con espín opuesto contribuyen débilmente al diamagnetismo, y sólo en los casos en los que hay electrones desparejados existe una contribución paramagnética (o más compleja) en sentido contrario.

propelente

2011-06-08T13:12:00.000+02:00

Buscando está palabra para una mejor comprensión del concepto , descubri que para la RAE, no existe.

Os dejo algunas definiciones:

-un fluido capaz de ejercer presión al estar contenido en un recipiente cerrado a temperatura ambiente. Los propelentes proveen la energía capaz de expeler el contenido, influyendo en la forma en la cual el producto es descargado pudiendo ser espumas, nieblas

-una sustancia capaz de expeler el contenido de un aerosol a través de la válvula cuando ésta es actuada.

aluminio

2011-06-07T16:45:00.000+02:00

Su numero atómico es el 13 y pertenece a la familia del Boro.Los 13 protones que forman el núcleo están rodeados de 13 electrones dispuestos en la forma:

1s22s22p63s23p1

Existen en la naturaleza dos isótopos de este elemento, el 27Al y el 26Al. El primero de ellos es estable mientras que el segundo es radiactivo y su vida media es de 7,2×105 años.Al igual que el 14C, la medida de las abundancias del 26Al es utilizada en técnicas de datación

Se trata de un metal no ferroso. En estado natural se encuentra en muchos silicatos. Como mineral se extrae del mineral conocido como bauxita,(recibe su nombre de la localidad francesa de Les Baux, donde fue extraída por primera vez. Actualmente los principales yacimientos se encuentran en el Caribe, Australia, Brasil y África)por transformación mediante el proceso Bayer y a continuación en aluminio mediante electrólisis.

Tiene unas propiedades que lo hacen muy útil en ingeniería mecánica, tales como su baja densidad y su alta resistencia a la corrosión. Es un buen conductor de la electricidad, se mecaniza con facilidad y es relativamente barato. Por todo ello, es el metal que más se utiliza después del acero.

Es un metal con un gran potencial de reducción estándar negativo y, como es de esperar, es muy reactivo.
Cualquier superficie expuesta de aluminio metálico reacciona rápidamente con el oxígeno para formar óxido de aluminio Al2O3. En estas condiciones, una capa impermeable de óxido, de entre 10 -4 y 10 -6 mm de espesor, protege las capas de átomos de Al subyacentes. Esto sucede porque el ión oxígeno tiene un radio similar al del átomo de Al.
El especial atractivo del aluminio es su baja densidad, que solo supera el magnesio
(si no tenemos en cuenta a los metales alcalinos muy reactivos)
El aluminio es buen conductor del calor, propiedad que explica su uso en utensilios de cocina; sin embargo, no es tan bueno como el cobre. También es excepcional como conductor de la electricidad. El problema principal que plantea su uso en el cableado doméstico está en las conexiones. Si el aluminio se une al cobre, se establece una celda electroquímica en condiciones de humedad, que hace que se produzca la oxidación del aluminio.

- Propiedades químicas del aluminio

1. Arde con llama cuando está pulverizado dando óxido de aluminio
2. Arde de forma exotérmica con los halógenos
3. Es un metal anfótero
4. Las soluciones de sales de aluminio son ácidas

Producción

El aluminio es el metal más abundante de la corteza terrestre, principalmente en forma de arcillas. Pero extraerlo no es rentable. En los ambientes cálidos y húmedos los iones más solubles son lixiviados de la estructura de la arcilla para dejar el mineral bauxita.

La primera etapa del proceso de extracción es la purificación de la bauxita.
Esto se consigue mediante la digestión del mineral triturado con solución de hidróxido de sodio caliente para dar el ion aluminato soluble:

Al2O3(s) + 2OH-(ac)+3 H2O -----> 2 [ Al(OH)4] – (ac)

Los materiales insolubles, en especial el óxido de hierro (III) se eliminan por filtración en forma de “lodo rojo”.

Al enfriarse la solución, en equilibrio se desplaza hacia la izquierda y se precipita el trihidrato de óxido de aluminio, en tanto que, las impurezas quedan en solución:

2 [ Al(OH)4] – (ac)-----> Al2O3•3H2O(g)

Para electrolizar el óxido de aluminio era necesario encontrar un compuesto de aluminio con un punto de fusión más bajo, como el mineral criolita(Na3 AlF6), hay pocos depósitos de este mineral. Debido a su escasez casi toda la criolita se fabrica.

El óxido de aluminio se disuelve en la criolita fundida alrededor de 950ºC. El aluminio fundido se produce en el cátodo y el oxígeno que se forma en el ánodo oxida el carbono a monóxido de carbono.

Al3+( Na3 AlF6) + 3 é ----> Al (l)

O2-( Na3 AlF6) + C ---->CO (g) + 2 é

El proceso consume mucha energía.
La producción de aluminio genera 4 productos secundarios que crean importantes problemas de contaminación:

1- Lodo rojo: que se produce en la purificación de la bauxita y es fuertemente básico
2- Fluoruro de hidrógeno gaseoso: que se produce cuando la criolita reacciona con los rastros de humedad del óxido de aluminio.
3- Óxidos de carbono: que se producen en el ánodo
4- Fluorocarbonos,:que se producen por reacción del flúor con el ánodo de carbono.

El aluminio es 100% reciclable sin merma de sus cualidades físicas, y su recuperación por medio del reciclaje se ha convertido en un faceta importante de la industria del aluminio. El proceso de reciclaje del aluminio necesita poca energía.

Aqui teneis un video de la producción de Aluminio :

http://www.youtube.com/watch?v=CGDV_v-aiRU

Reynolds ( ese gran amigo de Chenlo)

2011-06-07T02:25:00.000+02:00

A partir de la wikipedia : El número de Reynolds (Re) es un número adimensional utilizado en mecánica de fluidos, diseño de reactores y fenómenos de transporte para caracterizar el movimiento de un fluido.

El número de Reynolds relaciona la densidad, viscosidad, velocidad y dimensión típica de un flujo en una expresión adimensional, que interviene en numerosos problemas de dinámica de fluidos. Desde un punto de vista matemático el número de Reynolds de un problema o situación concreta se define por medio de la siguiente fórmula:

o equivalentemente por:

donde:

ρ

: densidad del fluido

v s

: velocidad característica del fluido

D

: diámetro de la tubería a través de la cual circula el fluido o longitud característica del sistema

μ

: viscosidad dinámica del fluido

ν

: viscosidad cinemática del fluido

Como todo número adimensional es un cociente, una comparación. En este caso es la relación entre los términos convectivos y los términos viscosos de las ecuaciones de Navier-Stokes que gobiernan el movimiento de los fluidos.

Dejando a parte la Wiki...

Osbourne Reynolds realizó un experimento en 1883 que es el punto de arranque experimental en el que se fundamenta el estudio de los regimenes de circulación.
La situación experimental consiste en hacer circular un líquido a distintas velocidades por el interior de una conducción recta y transparente.La inyección de un colorante en un punto de la conducción permite visualizar los cambios cualitativos que se originan en el líquido que circula por ella al variar el caudal y la velocidad media v=q/S, de un experimento a otro.
Si la velocidad del líquido es baja el filamento del líquido mantiene la forma a lo largo del recorrido, al aumentar la velocidad el filamento coloreado se ondula y a partir de cierto valor, se rompe e inunda transversalmente la conducción.

El modulo de Reynolds reune las magnitudes que caracterizan el fenómeno de la circulación,delimita los diferentes regímenes y sirve de base para otros fenómenos de algún modo relacionados con la circulación de fluidos.

El módulo de Reynolds nos da una idea de la relación entre fuerzas inerciales y fuerzas viscosas que actúan en el seno de un fluido

Re: Fuerzas inerciales/ fuerzas viscosas

Las fuerzas inerciales facilitan el movimiento y las viscosas ofrecen resistencia.

Cuando hablamos de tuberías :

Si Re<2100 el régimen se considera laminar
y si Re> 4000 el régimen se considera turbulento

para ampliar info ,aqui os dejo un link de un libro on-line : http://books.google.es/books?id=XZNYpvnO_V8C&lpg=PA213&dq=modulo%20de%20reynolds&pg=PA214#v=onepage&q&f=false

Redes para la Ciencia » El domingo, Redes 97: El mundo de abajo a arriba

2011-05-29T21:44:00.000+02:00

Redes para la Ciencia » El domingo, Redes 97: El mundo de abajo a arriba

Nobel de Química Harold Kroto habla con Punset, lo podeis ver en la 2 de TVE

Concepto de replicación

2011-05-17T02:18:00.000+02:00

La replicación del ADN asegura que la información genética pase de manera inalterada a la descendencia durante el transcurso de la vida de la célula.
De cada división celular se deben generar nuevas copias de cada una de las miles de moléculas que conforman las células, incluyendo la duplicación de todas las moléculas de ADN.
La replicación es el proceso de reproducción fiel de una copia molde de ADN. Este proceso hace posible que la información genética de un organismo pueda ser pasado a sus células hijas cuando haya división celular.
Al emplear ADN como molde, la secuendia de nucleótidos se copia por apareamiento de bases, de tal forma que se produce una secuencia de ácidos nucleicos complementarios al molde de ADN.
El reconocimiento de cada nucleótido del ADN por un nucleótido complementario no polimerizado, requiere que las dos cadenas de la hélice de ADN se encuentren separadas para que los grupos dadores y aceptores de electrones se los enlaces de hidrógeno queden libres y permitan posteriormente una alineación de forma adecuada y ordenada.Luego, gracias a la acción de la ADN polimerasa se forma una nueva cadena de ácidos nucleicos.
Durante la replicación de ADN, cada cadena del ADN antiguo, actúa como molde de la formación de una nueva cadena completa.Como cada una de las cadenas hijas hereda una cadena de ADN y una cadena recién sintetizada se dice que el ADN se replica de manera semiconservativa.

Para la correción de lectura, es necesaria la acción de la ADN polimerasa que actúa solo si presenta un extremo 3'-OH de la cadena cebadora o iniciadora sobre la cual se añaden los siguientes nucleótidos.Las moléculas de la ADN polimerasa son capaces de trabajar con cadenas defectuosas de ADN mediante el empleo de un dominio catalítico que corta cualquier residuo desapareado del final de la cadena iniciadora.

Existe una región concreta de replicación que se desplaza a lo largo de la doble hélice del ADN, en forma de Y, que se conoce como horquilla de replicación, sonde se sintetiza el ADN de las dos hélices hijas mediante un complejo enzimático que contiene ADN polimerasa. La horquilla de replicación tiene una estructura asimétrica . Se produce una cadena hija de ADN de forma continua ( cadena leading o conductora) , que se elabora antes que la cadena hija discontinua ( hiebra lagging o retardada) , la cual aparece más lentamente, porque debe esperar a que la cadena conductora exponga la cadena molde sobre la que se sintetizará cada uno de los denominados "fragmentos de Okazaki". Para la replicación de ADN sólo se necesita la ADN polimerasa en dirección 5'-3'. Para el caso de la cadena conductora sólo es necesario un iniciador especial al comienzo de la replicación cuando se ha establecido la horquilla de replicación. La ADN polimerasa del extemo retardado de la horquilla completa un corto fragmento de de ADN tras lo cual empieza a sintetizar otro fragmento nuevo en un punto situado más adelante de la cadena molde.Para que actúe la ADN polimerasa es necesario la presencia de una enzima regeneradora de cadenas iniciadoras o cebadoras de ARN o ARN primasas.En las células eucariotas son sinterizados a intervalos sobre la cadena retardada para luego se alargados mediante la ADN polimerasa .La sintesis de cada fragmento de Okazaki finaliza cuando la ADN polimerasa se encuentra con el ARN iniciador unido al extremo 5' del fragmento anterior. Los fragmentos de Okazaki sólo se sintetizan en dirección 5'-3'.Después de sus síntesis los fragmentos se unen entre sí, generando grandes cadenas de ADN. Mediante la enzima ligasa, se suelda un enlace fosfodiester roto, gracias a la activación de un extremo 5' en presencia de una molécula de ATP, antes de formarse un nuevo enlace.

aqui también teneis información muy bien estructurada y con varios gráficos :

http://e-ciencia.com/recursos/enciclopedia/Replicaci%C3%B3n

Replicación en procariotas 1 DNA polimerasa

2011-05-09T21:28:00.000+02:00

La información siguiente está sacada direcatamente de la web :
http://www.medmol.es/glosario/65/

Me pareció que está muy bien redactada y clara y que tiene una muy buena animación.

La ADN polimerasa es la principal enzima de la replicación. Partiendo de una cadena inicial o “primer” la ADN polimerasa añade nucleótidos complementarios a la cadena molde extendiendo la nueva cadena de ADN en dirección 5’- 3’.

La ADN polimerasa es la enzima principal en el proceso de replicación. Partiendo de una cadena inicial o “primer” la ADN polimerasa es capaz de añadir nucleótidos complementarios a la cadena molde estableciendo enlaces fosfodiéster. La ADN polimerasa sólo puede catalizar el crecimiento de la cadena inicial en dirección 5'-3'. La ADN polimerasa también se encarga de la reparación del ADN asociada a la replicación.

Hay 5 ADN polimerasas diferentes bien caracterizadas, diferenciándose en su localización, actividad y sensibilidad a los inhibidores: alfa, beta, gamma, delta y épsilon:
• Las ADN polimerasas delta y epsilon dirigen la replicación de la cadena conductora o “leading strand” que es la cadena que crece de 5' a 3' en mismo sentido que crece la nueva copia de ADN. La ADN polimerasa epsilon parece que también está involucrada en un tipo de reparación del ADN. Además, las ADN polimerasas gamma, delta y epsilon tienen actividad exonucleasa 3'-5' y, por tanto, son capaces de eliminar los nucleótidos del extremo 3' que han sido incorporados incorrectamente en un proceso conocido como corrección de pruebas.
• La ADN polimerasa alfa participa en el proceso de replicación del ADN dirigiendo la replicación de la cadena retardada o “lagging strand” que es la cadena que crece de 3' a 5' que es el sentido contrario al del crecimiento global de la nueva copia de ADN.
• La ADN polimerasa beta se encarga de los procesos de reparación del ADN.
• La ADN polimerasa gamma realiza la replicación del ADN mitocondrial.

Bidireccionalidad en la replicación del DNA

2011-05-06T06:46:00.000+02:00

El movimiento de la horquilla es bidireccional en la mayoría de los casos, es decir, a partir de un punto se sintetizan las dos cadenas en ambos sentidos. Esto ocurre en la mayoría de los organismos, pero se dan excepciones en algunos procariontes debido a que los mecanismos de replicación que tienen lugar dependen de la propia estructura de su material hereditario (si el ADN es circular, lineal, bicatenario o monocatenario).Así, en casos particulares como el ADN mitocondrial, algunos plásmidos y algunos genomas monocatenarios de fagos pequeños, la replicación se da unidireccionalmente pudiendo haber uno o dos orígenes de replicación.

No obstante, la replicación se puede considerar, de forma general, bidireccional.

La evidencia experimental del crecimiento bidireccional de la hebra de ADN viene dada por una técnica basada en el marcaje radiactivo del ADN usando timidina marcada con tritio. Primero se añade timidina marcada y luego sin marcar, y siguiendo el rastro de tritio se observa hacia dónde se ha replicado la molécula de ADN.También se puede, mediante el recuento de copias de genes marcadores, determinar si la replicación es unidireccional o bidireccional.

Exonucleasas : Las fosfodiesterasas o nucleasas son enzimas hidrolasas que catalizan la ruptura de los enlaces fosfodiéster, como por ejemplo los que se establecen en los ácidos nucleicos entre la pentosa de un nucleótido y el grupo fosfato de otro. Su acción regula la concentración dentro de las células del AMP cíclico y del GMP cíclico.

La helicasa rompe los puentes de hidrógeno de la doble hélice permitiendo el avance de la horquilla de replicación.

La topoisomerasa impide que el ADN se enrede debido al superenrollamiento producido por la separación de la doble hélice.

Las proteínas SSB se unen la hebra discontínua de ADN, impidiendo que ésta se una consigo misma.

La ADN polimerasa sintetiza la cadena complementaria de forma continua en la hebra adelantada y de forma discontínua en la hebra rezagada.

La ARN primasa sintetiza el cebador de ARN necesario para la síntesis de la cadena complementaria a la cadena rezagada.

Replicación DNA

2011-05-06T06:40:00.000+02:00

según la wikipedia :

El proceso de replicación de ADN es el mecanismo que permite al ADN duplicarse (es decir, sintetizar una copia idéntica). De esta manera de una molécula de ADN única, se obtienen dos o más "clones" de la primera. Esta duplicación del material genético se produce de acuerdo con un mecanismo semiconservador, lo que indica que las dos cadenas complementarias del ADN original, al separarse, sirven de molde cada una para la síntesis de una nueva cadena complementaria de la cadena molde, de forma que cada nueva doble hélice contiene una de las cadenas del ADN original. Gracias a la complementariedad entre las bases que forman la secuencia de cada una de las cadenas, el ADN tiene la importante propiedad de reproducirse idénticamente, lo que permite que la información genética se transmita de una célula madre a las células hijas y es la base de la herencia del material genético.

La molécula de ADN se abre como una cremallera por ruptura de los puentes de hidrógeno entre las bases complementarias liberándose dos hebras y la ADN polimerasa sintetiza la mitad complementaria añadiendo nucleótidos que se encuentran dispersos en el núcleo. De esta forma, cada nueva molécula es idéntica a la molécula de ADN inicial.

La replicación empieza en puntos determinados: los orígenes de replicación. Las proteínas iniciadoras reconocen secuencias de nucleótidos específicas en esos puntos y facilitan la fijación de otras proteínas que permitirán la separación de las dos hebras de ADN formándose una horquilla de replicación.

Aqui hay un video sobre la replicación del DNA (está en inglés)

http://www.youtube.com/watch?v=teV62zrm2P0

el mismo video en español

http://www.youtube.com/watch?v=-EGKrYdQEHQ&feature=related

Aqui un video muy bueno en inglés con subtítulos en español:

http://www.youtube.com/watch?v=z5ijobRQpOY&feature=related

El experimento de Meselson-Stahl

2011-05-05T18:11:00.001+02:00

El experimento de Meselson-Stahl fue un experimento realizado en 1957 por Matthew Meselson y Franklin Stahl en el que se demostró que la replicación de ADN era semiconservadora. Una replicación semiconservadora es aquella en que la cadena de dos filamentos en hélice del ADN se replica de forma tal que cada una de las dos cadenas de ADN formadas consisten en un filamento proveniente de la hélice original y un filamento nuevo sintetizado.

Para investigar la forma de replicación del ADN, Meselsohn y Stahl idearon una forma muy ingeniosa que se basa en dos premisas fundamentales, por una parte está el hecho de que el nitrógeno es uno de los principales elementos del ADN, y por la otra el nitrógeno posee dos isótopos que pueden ser distinguidos mediante técnicas de laboratorio.

Aunque el 14N es el isótopo más abundante del nitrógeno, el ADN es también viable con el isótopo 15N el cual es más pesado. El isótopo 15N no es radioactivo, solo es más pesado que el nitrógeno común.

De esta forma Meselsohn y Stahl mediante un inteligente planteo del experimento, en el que utilizaron bacterias y observaron cómo replicaban su ADN, pudieron obtener información que les permitió identificar el mecanismo de replicación del ADN y descartar ciertas teorías alternativas.

Desarrollo del experimento:

Se realizó un cultivo de E. coli durante varias generaciones en un medio con 15N. Al extraer ADN de estas células y centrifugarlo en un gradiente de cloruro de cesio, las moléculas de ADN se situaban en el punto donde su densidad igualaba la del medio.

El ADN de estas células tenía una mayor densidad que el de otras cultivadas con 14N. Posteriormente, las células de E. coli que sólo contenían 15N en su ADN se colocaron en un medio con 14N y se les permitió que se replicaran una sola vez. Se extrajo el ADN de estas células y se comparó con el preparado con 14N y con el preparado con 15N, encontrando que su densidad era prácticamente el promedio.

Una replicación conservadora hubiera producido iguales cantidades de ADN de mayor y menor densidad (pero sin producir ADN de una densidad intermedia), se descartó que la replicación siguiera el mecanismo conservador. Sin embargo, este resultado era consistente tanto con una replicación semiconservadora como con una de tipo dispersante.
Una replicación semiconservadora hubiera dado por resultado una doble hélice de ADN donde un filamento tiene 15N mientras que el otro filamento tiene 14N,
Una replicación dispersante hubiera dado por resultado una doble hélice de ADN con ambos filamentos conteniendo mezclas de 15N y 14N; en ambos casos la densidad del ADN tendría un valor promedio entre las densidades de los ADN de 15N y 14N.

Se extrajo ADN de células que habían crecido por varias generaciones en un medio con 15N, y a las que se les había permitido que realizaran dos replicaciones en un medio con 14N. Al analizar estas células se encontró que contenían cantidades iguales de ADN con dos densidades distintas, una igual a la obtenida tras una sola replicación en un medio con 14N, mientras que la otra correspondía al ADN producido exclusivamente con 14N.
Este resultado era claramente inconsistente con una replicación dispersante, que hubiera dado como producto ADN con una densidad única e inferior a la de una sola generación, pero mayor que la de 14N, ya que el ADN original con 15N se habría repartido de forma uniforme entre todos los filamentos de ADN. Este resultado era consistente con una replicación semiconservadora, en cuanto a que la mitad del ADN de segunda generación tiene un filamento original con 15N y otro con 14N, lo que da como resultado un ADN con una densidad intermedia, mientras que la otra mitad del ADN contiene en su totalidad 14N --un filamento sintetizado en la primera división y otro en la segunda división. Este descubrimiento fue sumamente importante en el desarrollo de la biología y es de gran ayuda en la investigación.

mitosis y meiosis

2011-05-02T20:03:00.000+02:00

Os recomeindo que visiteis:

http://www.carisgamba.com/WQOLmitosis_meiosis/Plantilla-violeta/introduccion.html

Es una WebQuest hecha por alumnos de instituto que es muy visual y para explicar los procesos de mitosis y meiosis es más fácil verlo.
Os dejo un dibujo que saqué de su web con el esquema de la mitosis

Experimento bacterias Griffith y Avery

2011-05-02T19:08:00.000+02:00

Para este estudio, Griffith utilizó dos cepas de la bacteria neumococo, tipo III-S y de tipo II-R.

La cepa S-III tiene una capa de polisacáridos que lo hace resistente al sistemainmunológico de los ratones, mientras que la cepa II-R carece de esta capa y así va a ser destruido por el sistema inmune de el anfitrión.

Para la primera etapa del experimento principio de transformación, Griffith demostró que los ratones inyectados con III-S morían, pero cuando se inyecta con II-R vivían y mostraban pocos síntomas.

La siguiente etapa demostró que si los ratones fueron inyectados con el tipo III-S que había estaban muertas por el calor, los ratones vivían todos, lo que indica que las bacterias habían sido ineficaces.

Los resultados interesantes llegaron con la tercera parte del experimento, cuando los ratones fueron inyectados con una mezcla de III-S muertas por aclor y II-R vivas.

Curiosamente, los ratones murieron todos, lo que indica que algún tipo de información se había pasado de la cepa muerta de tipo III-S para la cepa de tipo II-R. Las muestras de sangre mostraron que la sangre de los ratones muertos figuraban tanto cepas de tipo III-S y bacterias de tipo II-R.

De alguna manera el tipo II-R se había transformado en la cepa de tipo III-R, un proceso que él bautizó como el principio de transformación.

Griffith concluyó que había algún «principio» que transformó las cepas rugosas (R) en lisas (S) con una cubierta de azúcares. Cuando Avery leyó los resultados de Griffith se intereso en identificar este «principio transformador», Avery y su equipo comenzaron a experimentar usando un tubo de ensayo en vez de un ratón. Usaron detergente para descomponer las células lisas muertas por calor creando una lisis a partir de ellas. Entonces usaron esta lisis para los ensayos de transformación. Los tubos funcionaron bien y mostraron que la lisis de S muerta por calor podían cambiar (R) Rugosa a (S) Lisa. El principio transformador estaba en algún lugar de la lisis.

Probaron cada uno de los componentes de la lisis para la actividad transformadora. Primero incubaron la lisis de cepa lisa muerta por calor con una enzima, SIII, que consume completamente la cubierta de azúcar. La lisis de cepa lisa sin cubierta seguía siendo útil para transformar. Esto les reveló que las cepas R no creaban una nueva capa a partir de las partes de la cubierta de cepa lisa. Luego incubaron la lisis de cepa lisa sin cubierta con proteínas que digieren enzimas (tripsina y quimotripsina) y después probaron la habilidad de esta lisis para transformar. Esta lisis sin proteínas seguía trasformando, así que el principio trasformador no era proteína.

Cuando querían probar y purificar la lisis, precipitaron los ácidos nucleicos – ADN y ARN - con alcohol. Fueron los primeros en aislar los ácidos nucleicos de un neumococo. Cuando vieron que el «principio» transformador no estaba en la cubierta de azúcar, ni en la proteína sospecharon que tal vez estaría en uno de los ácidos nucleicos.

Disolvieron la mezcla con alcohol en agua, primero destruyeron el ARN con la enzima RNasa, probaron la capacidad trasformadora de esta solución, la solución todavía tenia capacidad para transformar, de tal manera que el ARN no podía ser el «principio» transformador. Cuando habían dejado virtualmente ADN puro, como una prueba final, incubaron la solución con la enzima digestora de ADN, Dnasa. Probaron la capacidad trasformadora de esta solución, esta solución fue incapaz de transformar. Avery y sus colegas concluyeron que el ADN era el principio transformador

Dogma central de la biología molecular

2011-05-02T18:54:00.000+02:00

La transcripción del ADN al ARN a las proteínas: Este dogma es la columna vertebral de la biología molecular

Etapas:

1. El ADN se replica la información en un proceso que implica muchas enzimas: la replicación.

2. Los códigos de ADN para la producción de ARN mensajero (ARNm) durante la transcripción.

3. En las células eucariotas, el ARNm es procesado (esencialmente por corte y empalme) y migra desde el núcleo hasta el citoplasma.

4. El ARN mensajero lleva la información codificada a los ribosomas. Los ribosomas leen esta información y la utilizan para la síntesis de proteínas. Este proceso se denomina traducción.

Según la wikipedia :

El dogma central de la biología molecular es un concepto que ilustra los mecanismos de transmisión y expresión de la herencia genética tras el descubrimiento de la codificación de ésta en la doble hélice del ADN. Propone que existe una unidireccionalidad en la expresión de la información contenida en los genes de una célula, es decir, que el ADN es transcrito a ARN mensajero y que éste es traducido a proteína

Estructura del DNA

2011-05-02T18:37:00.000+02:00

Características del modelo :

-Las dos cadenas de polinucleotidos que están orientadas en direcciones opuestas giran alrededor de un eje común formando una doble hélice dextrógira (=Que gira en el mismo sentido de las agujas del reloj).

-Las bases de purina y de pirimidina están ubicadas en el interior de la hélice, mientras que las unidades de fosfato y de desoxirribosa lo están en el exterior.

-La adenina(A) se empareja con la timina(T), y la gauanina (G) con la citosina(C).Los pares de bases AT están reforzados por dos puentes de hidrógeno y los pares de bases GC lo están por tres.
-La doble hélice también se estabiliza por interacciones entre bases apiladas de la misma hebra.

El modelo de la doble hélice B permitió descubrir el
mecanismo de replicación del DNA y de la expresión de sus genes.

en este enlace :
http://www.eoearth.org/articles/view/158858/?topic=49496

podemos ver esta imagen que nos da una visión de los componentes moleculares del ADN

Strunker, T., et al., "The CatSper channel mediates progesterone-induced Ca2+ influx in human sperm," Nature, 471:382-6.

2011-04-22T01:13:00.000+02:00

Los científicos han resuelto un misterio de 20 años sobre el mecanismo molecular por el cual el esperma humano detectar un ovulo. La respuesta se encuentra en un unico canal de iones sensible a la progesterona, que causa un flujo de calcio en las células de esperma.

El hallazgo, publicado en la revista Nature, proporciona una pista para algunos tipos de infertilidad masculina, y algún día podría ser la base de un método anticonceptivo no hormonal.

Aqui podeis ver un articulo en inglés :

http://www.the-scientist.com/news/display/58053/

alternativa a la heparina

2011-04-20T18:33:00.000+02:00

link de la noticia : http://www.rsc.org/chemistryworld/News/2011/April/20041101.asp

Los químicos en el Reino Unido han desarrollado una posible alternativa a la protamina, una molécula utilizada por los médicos para contrarrestar los efectos de las drogas anti-coagulación. A diferencia de protamina, la nueva molécula debe fácilmente se descomponen en menos metabolitos tóxicos, a pesar de que aún no ha sido probado en la sangre o plasma humano.

Los médicos a menudo usan los agentes anti-coagulación para el tratamiento de trastornos de la sangre, o para prevenir la coagulación de la sangre durante la cirugía. Uno de los agentes más popular anti-coagulación es la heparina, que se ha utilizado desde la década de 1930. Sin embargo, con el fin de luchar contra la sobredosis de heparina peligrosas, o para desactivar después de la cirugía se haya completado, los médicos necesitan una carpeta de heparina. La carpeta heparina sólo clínicamente aprobados es de protamina, pero este agente a veces causa reacciones alérgicas graves, por lo que los científicos están interesados en desarrollar alternativas

La heparina es de carga negativa, por lo que las alternativas de protamina desarrollados hasta ahora han sido en su mayoría con carga positiva, como la protamina misma. Sin embargo, los polímeros con carga positiva son a menudo tóxicos, y estas alternativas han demostrado ser inadecuadas para el uso clínico. Ahora, sin embargo, David Smith y sus colegas de la Universidad de York han desarrollado carpetas de heparina que temporalmente se cargan positivamente, por lo que el riesgo de una reacción alérgica se reduce.

Las moléculas desarrolladas por el grupo de Smith contienen unidades hidrofóbicas que se auto-ensamblan en el agua en nanoestructuras esféricas de un tamaño similar a la protamina. Estas nanoestructuras tienen ramas de carga positiva para ayudar a la unión a la heparina. En efecto, durante las pruebas in vitro en soluciones salinas, la alternativa de protamina fue "directamente comparables, si no un poco mejor que, de protamina," dice Smith.

"El aspecto interesante de este trabajo es que el antídoto heparina diseñado es mucho menor a nivel molecular [de protamina]. y se espera que la bio-degradación de productos inocuos, de tal modo que funciona bajo condiciones in vivo de una manera más previsible y menos nocivas », Dice Umesh Desai, un químico médico en la Universidad Virginia Commonwealth University en los EE.UU..

Desai y otros químicos dicen que la molécula que se han probado en la sangre o plasma, donde su eficacia - y toxicidad - puede ser diferente. Smith ya está trabajando en esto para ver si los líquidos biológicos interfieren con la unión.

integrales

2011-04-13T06:44:00.000+02:00

Aqui os dejo unas tablas de integrales

Actividades de libre configuración

2011-04-13T06:14:00.000+02:00

Una manera rápida de organizar tus actividades en la universidad y conseguir tus créditos de libre configuración es echarle un vistazo en la web de la usc en este enlace
http://xornal.usc.es/ServizosXML/Plantillas/Alumnado/Xsrm_Guia_Alumnado_Menu.xml?&Num_Sistema_Idioma=9&Num_Sistema_Usuario=0&Contenttype=text/html

Así sabes si están los creditos reconocidos o no y tienes una visión global de tus opciones.