Le escribo en relación al programa “Los Desayunos de TVE” que usted dirige y que, gracias a la programación online, puedo disfrutar cada día desde Heidelberg (Alemania). Considero que dicho programa es el referente español en el análisis de la actualidad y no podría recomendar mejor opción para aquel que quiera estar bien informado.

Por “Los Desayunos de TVE” han pasado figuras relevantes del panorama político y social español así como destacados mandatarios extranjeros. La lista abarca a políticos, escritores o artistas; por citar algunos ejemplos.

Sin embargo, no tengo constancia de que ningún científico haya sido jamás invitadoal programa. Más aun, habría que remontarse a las crisis médicas de las bacterias en las verduras alemanas o la Gripe A para encontrar algo de información científica.

Como científico me apena esta situación que además se extiende por casi todos los medios informativos del país. Considero que la ciencia también es actualidad y que el debate de temas científicos tiene cabida en programas de actualidad como el suyo. Son temas que influyen a los ciudadanos ya que marcan -entre otros aspectos- el futuro económico del país, los modelos energéticos, avances médicos que afectan a nuestra salud o el conocimiento que nos permita tomar decisiones más eficientes.

Por poner un sólo ejemplo: escribo estas líneas tras firmar un manifiesto de apoyo a los investigadores del Centro de Investigación Príncipe Felipe en Valencia. Muchos de ellos perderán su puesto de trabajo en los próximos días por culpa de una lamentable e incompetente planificación por parte de varios organismos públicos. Con el desarme de dicho centro se cercenan avances en biomedicina cuyos resultados y aplicaciones ya sólo podremos soñar.

No pretendo interferir en la forma de dirigir su programa ni marcar a quién ni cómo entrevistar. Simplemente escribo estas líneas para que usted y otros periodistas consideren que la ciencia también tiene cabida en la agenda de la actualidad. Los avances científicos, así como las medidas que los favorecen o entorpecen, nos afectan a todos los ciudadanos. Quizás no hoy, pero sí mañana.

Atentamente,

Dr. Sergio P. Acebrón
German Cancer  Research Center (DKFZ)

En estas 2 jornadas partícparan  muchos de los miembros de la Comunidad Amazings repartidos en charlas, coloquios y exposiciones . Yo hablaré el sábado sobre la división celular en la charla «Breve historia de una mitosis». Podéis ver el programa completo aquí y seguir el evento en twitter con el hashtag #amazings2011 .

Si os gusta escuchar la radio podéis escuchar el podcast de America Valenzuela en Ciencia al Cubo de RTVE o seguir este viernes a la tarde (a partir de las 15:00) La Mecánica del Caracol, en Radio Euskadi, donde algunos de los ponentes hablaremos de las jornadas.

Os esperamos allí.

El Problema: Polonio 210 en los cigarrillos.

El Polonio 210 proviene de la desintegración del Uranio 238 que se encuentra en el fertilizante (Imagen Melpor)

El Polonio 21o es un isótopo radiactivo que adquirió cierta notoriedad con el asesinato de un ex agente ruso. Este isótopo emite partículas alfa y es unas 250.000 veces más tóxico que el cianuro. A pesar de su toxicidad podemos encontrarlo en muchos vegetales que cultivamos, incluidas las plantas del tabaco. El Polonio 210 es un producto de la desintegración del Uranio 238 que se encuentra junto al fosfato que normalmente se usa como fertilizante y que es de origen mineral (Minas de fósforo).

El Polonio 210 se introduce en las vías respiratorias de los fumadores y es considerado responsable de al menos el 2% de los cánceres de pulmón derivados del tabaco (Dato considerado conservador, es posible que sea un porcentaje mayor). Puede que parezca un porcentaje pequeño pero supone aproximadamente unas 20.000 muertes al año sólo en la Unión Europea.

¿Cómo eliminar el Polonio 210 de los cigarrillos?

Existen al menos dos vías para evitar el Polonio 210 en los cigarrillos. La primera consiste en el uso de fertilizantes orgánicos procedentes de deshechos agricolas o bien de origen mineral procedentes de rocas con bajos niveles de Uranio 238. Los fertilizantes de origen orgánico son en general más caros (dependiendo de la zona) pero tienen ciertas ventajas desde el punto de vista de la sostenibilidad que no discutiré ahora. La segunda forma es el lavado de las hojas con una solución de agua oxigenada que puede reducir aproximadamente a la mitad la cantidad de este isótopo (Datos de la USDA).

¿Qué puede hacer la UE?

Alguno podría pensar que este problema corresponde a aquellos que deciden fumar. Yo creo sin embargo que es un problema de salud pública. El costo del tratamiento de los tumores derivados del Polonio 210 es aproximadamente unos 2 billones de euros al año en la Unión Europea, además de las muertes antes mencionadas. Demasiado para algo tan fácil de solucionar. La DGT nos aborda con campañas muy agresivas en relación a los accidentes de tráfico que causan muchas menos muertes y no todo el mundo conduce.

En Europa se cultiva aproximadamente el 50% del tabaco que se consume. Además su cultivo está actualmente subvencionado por lo que es razonable que se pueda obligar a los agricultores a cambiar ciertos aspectos del cultivo. Yo propongo que la UE regule este problema de la siguiente forma:

1. La prohibición de cultivar tabaco en Europa con abono de origen mineral rico en Uranio 238 o en caso de hacerlo obligar a los agricultores a limpiar las hojas para reducir los niveles de Polonio 210 al menos por debajo del 50%.

2. La prohibición de importar tabaco a Europa cuyos niveles de Polonio 210 sobrepasen aquellos que estipulen los expertos como «máximos» dentro de lo técnicamente posible.

Dicha regulación tendría varios aspectos positivos. Probablemente el costo para los agricultores europeos crecería pero por otro lado serían los primeros que podrían asegurarse la venta de tabaco en Europa, lo que podría salvar su industria. Incluso si los costes aumentan, la UE tiene una amplia horquilla para jugar con los precios del tabaco debido a los impuestos y al dinero que se ahorraría en sanidad en las próximas décadas. Por otro lado estas normas no afectan a la libertad individual: no hay modificación de hábitos entre los fumadores. Nadie obliga a nadie a dejar de fumar.

Creo que estas medidas son de fácil aplicación e, incluso asumiendo los costes de llevarlas a cabo, resultarían en un ahorro monetario y en la prevención de uno de los tumores más agresivos. Evidentemente esto no quita que puedan desarrollarse otras medidas frente a otros agentes cancerígenos del tabaco o de concienciación.

Referencias y enlaces relacionados:

Los datos sobre muertes y costos de sanidad están calculados a partir de los datos oficiales de la UE en función de los porcentajes que indica el estupendo artículo Radioactive Smoke: A Dangerous Isotope Lurks in Cigarrettes (Scientific American). Gran parte de la información aquí vertida proviene de ese artículo que firma Brianna Rego.

The Radioactive Polonium In Cigarettes Smoke. Donde se explica la intención de la administración Obama de intervenir el proceso de producción del tabaco.

Phillips-Morris Confidential File [pdf]. Done los estudios de esta compañía demuestran que sus cigarrillos tienen Polonio 210 y que este se introduce en los pulmones de los fumadores.

He intentado calcular el coste de cambiar el abono de origen mineral por otro orgánico. Los números varían enormemente en función de la zona y el tipo exacto de fertilizante. No soy un experto en el tema así que si alguien puede dar precios por hectarea los incluiré encantado.

El extraño caso del asesino que leía libros de física nuclear Donde se explica cómo mata el Polonio 210

Figura 1: Supervivencia a 5 años en mujeres con diferentes tipos de cáncer (1970-2001). Datos centrados a mitad del lustro del muestreo.

Los datos de supervivencia de los últimos 40 años para los tumores más frecuentes son muy positivos (figura 1 y 2). Prácticamente todos los tipos de tumores muestran un incremento importante en la supervivencia a 5 años desde el inicio del tratamiento. Algunos, como el cáncer de próstata ha pasado de un 30% de supervivencia a más del 75%. Y lo más importante: las tendencias no parecen haber alcanzado su máximo.

La causa de este notable incremento en la supervivencia al cáncer en las últmas décadas es múltiple, incluso cuando nos fijamos en tipos específicos de tumores. Entre los principales artífices de esta proeza se encuentran los siguientes:

• La prevención: debida en gran parte al descubrimiento de ciertos hábitos sumado a factores ambientales y/o genéticos como causantes de ciertos tipos de cáncer.
• Una temprana detección: mejora en las técnicas de detección, mejor control médico, etc.
• Refinamiento de las técnicas quirúrgicas.
• Nuevos fármacos específicos.
• Refinamiento de la quimioterapia y radioterápia que, entre otras consecuencias, previenen la aparición de metástasis.
• Post tratamiento: seguimiento del paciente para la prevención de metástasis.

Cada uno de estos factores suma un ligero incremento anual que mantiene esta tendencia. Sin embargo, en algunos tipos de tumores un sólo paso puede resultar decisivo variar la tendencia drásticamente, Sucedió en el caso del tumor de testículos donde el descubrimiento de marcadores en el suero sanguíneo sumado a una quimioterapia efectiva en los 60 fueron determinantes para duplicar la supervivencia en un par de décadas. Actualmente, pasados ya 50 años, la supervivencia es superior al 98%. De formar similar los nuevos tratamientos hormonales han aumentado la supervivencia al cáncer de próstata del 40% al 80% en sólo 10 años.

Mucho más impactantes son los datos referentes a niños y jóvenes. Los principales tumores entre este grupo, que incluyen leucemias y linfomas, han pasado de suponer la muerte de más del 80% de los enfermos a menos del 20% de media durante los últimos 50 años. Un caso espectacular es el del linfoma no Hodgkin donde la supervivencia ha pasado del 5% al 90%.

Figura 3: Supervivencia entre jóvenes y niños a varios tipos de tumores durante las últimas décadas

Hay algunas excepciones, como en el caso del cáncer de pulmón (el tipo relacionado con el tabaco) y de páncreas donde la supervivencia a 5 años no llega al 10%. Del cáncer de pulmón hablaré próximamente. El caso del cáncer de páncreas es muy particular. Raramente se encuentran tumores en fase temprana, los cuales son operables y/o tratables. El problema es que normalmente cuando se detecta el tumor ya está muy expandido y resulta imposible su tratamiento o extirpación. Sin embargo el futuro no parece tan desolador. Recientes estudios han mostrado la evolución genética de este tumor y por tanto han abierto una sólida vía para su detección temprana (analizando marcadores genéticos en la sangre, por ejemplo). Dicha detección temprana sumada a la tecnología actual podría suponer en un plazo medio una medida tan efectiva contra el cáncer de páncreas como las actuales para otros tipos tratables de cáncer.

La tendencia nos invita a ser positivos. Probablemente ninguna de las noticias sobre cura del cáncer sea tan real como promete pero en suma, los avances científicos y médicos están arrinconando este conjunto de enfermedades. No sé si habrá un día en el que nadie piense en cáncer como sinónimo de muerte, pero ese es el objetivo y sólo se logrará investigando.

Si te ha gustado puedes menear la noticia aquí.

Actualización: las figuras han sido editadas para facilitar el análisis.

Fuentes:

Los datos usados para confeccionar las figuras 1 y 2 provienen del Cancer Research UK, podéis encontrar las tablas aquí. El gráfico para jóvenes y niños proviene del Deutsches Kinderkrebsregister Mainz. Podéis leer más sobre los avances en marcadores genéticos para el cáncer de páncreas en Nature (requiere acceso). Maikelnai habló hace poco en Amazings precisamente sobre la mortalidad del cáncer de páncreas.

Diferencias en captación de investigadores extranjeros entre el CSIC y su homologo alemán (MPG)

El principal instituto español de ciencia, el Centro Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), cuenta con un 14.4% de investigadores extranjeros. La mayoría de ellos son estudiantes predoctorales e investigadores postdoctorales. Sólo 3% de los directores (profesores investigadores) son extranjeros. El instituto homólogo alemán, el Max-Planck-Gesellschaft (MPG) cuenta con un 28.5% de investigadores extranjeros. El 28.6% de los directores no son alemanes. En comparación con el CSIC, el MPG alemán publica unas 3 veces más artículos en las revistas científicas más relevantes (Nature y Science) por cada euro gastado (datos del CSIC).

Quizás te preguntes a que viene esto. Pues verás:

Hace unas semanas, leyendo una revista, me encontré con 6 dobles páginas de publicidad institucional sobre la investigación científica en Alemania con el lema «Made in Germany». El objetivo convencer a los lectores de las bondades del sistema de investigación alemán para intentar reclutar investigadores extranjeros, incluyendo los de países punteros como Reino Unido o EEUU. No era una revista cualquiera, se trataba de Scientific American, una revista de divulgación científica destinada al público educado, especialmente científicos de todos los países del mundo.

El tema ha saltado recientemente a la opinión pública por el anuncio de la canciller Angela Merkel para reclutar trabajadores altamente cualificados de varios países incluyendo España. No es ningún secreto que Alemania a capeado la crisis financiera con facilidad (por múltiples razones que no vienen al caso). En lo peor de la crisis, el gobierno alemán supo pensar a largo plazo de forma que las dos únicas grandes partidas presupuestarias que no sufrieron recortes fueron ciencia y educación. Alemania se lanza a la caza de talento en el mejor momento, cuando otros países (incluyendo UK y EEUU) titubean con sus presupuestos y otros como España directamente  los hunden. Yo trabajo como investigador en Alemania y puedo dar fe de que tanto la publicidad sobre la investigación como la apuesta por reclutar personal cualificado es sólida.

¿Y España que hace? Cómo respuesta al órdago alemán nuestra ministra de ciencia dice lo siguiente:

«No tememos una fuga de cerebros. España es un país que atrae talento»

–Cristina Garmendia a la agencia Efe.

No sé que datos maneja el Ministerio. Es posible que a la ministra le hayan pasado los datos de las prestigiosas becas europeas ERC, de las cuales España consiguió el 8% del total en 2008 (el resto de años tampoco está nada mal). Suena bien, pero yo no haría tanto ruido por unos 20 investigadores año entre cientos de miles. Investigadores además que llegan con apoyo europeo.

Podéis ver más comparaciones igualmente duras entre Alemania y España el Plan estratégico del CSIC, o en la web del MPG. Ahora que cada un piense lo que quiera.

Podéis menearlo aquí si os ha gustado.

Referencias y enlaces de interés:

• CSIC (Plan estrategico 2010-2013)
• Max Planck Gessellschaft (datos sobre investigadores)
• Young Germany (30% de becas a investigadores extranjeros )
• SINC (España ocupa el undecimo puesto en artículos publicados, en número de citaciones salta varios puestos hacia atrás.)
• Eurostat-Science [pdf, pag. 68; 79] (se puede comprobar que el número de trabajadores extranjeros en el sistema de investigación es muy similar entre España y Alemania. El personal incluye técnicos, administración… Es decir los extranjeros no ocupan, en su mayoría, puestos de investigador.
• Me enteré de las palabras de la ministra casi a la vez en Menéame y por @mimesacojea .

En mayo, el equipo de Craig Venter publicó un trabajo revolucionario donde se mostraba la generación de la primera vida sintética: una bacteria cuyo ADN había sido diseñado en un ordenador, luego sintetizado y ensamblado químicamente. Vida nacida de un chip de silicio. Una década de trabajo, centenares de investigadores, muchas publicaciones previas, innumerables controles e ingente cantidad de dinero para superar todas las barreras que ha exigido tal proeza. Para hacerse una idea: en un primer intento, y una vez completado el ensamblaje del ADN sintético, los esfuerzos para generar vida sintética fueron infructuosos. Una revisión del genoma sintético demostró que se debía a un único fallo entre un millón de bases de ADN. Solo un error, si ocurre en el sitio adecuado, impide que la vida prospere.

Estos últimos días, todos los medios se han hecho eco de un trabajo dirigido por la investigadora Felisa Wolfe-Simon sobre una nueva adaptación a la vida que podría sustituir el indispensable fósforo por el tóxico arsénico en sus biomoléculas, incluso en el ADN. Al poco de ver la luz, muchos investigadores han dado la voz de alarma sobre la falta de controles del estudio así como de datos suficientemente convincentes para hacer tal aseveración.

La vida parece capaz de adaptarse y sobrevivir en casi cualquier ambiente inimaginable. Sin embargo, y como ocurrió en el caso de la bacteria sintética, ciertas circustancias parecen ser incompatibles con la vida basada en el ADN. Habrá que esperar a nuevos análisis para saber si ese sigue siendo el caso para el arsénico. No debemos poner fronteras a la vida pero hay que saber usar buenas herramientas para saltárselas.

Nota: publiqué este artículo en la sección de ciencia del Heraldo de Aragón el 14-12-2010.

Nota: publiqué este artículo originalmente en el suplemento de Tercer Milenio del Heraldo de Aragón el 9 de Noviembre de 2010.

Xenopus tropicalis y Xenopus laevis

Nota: publiqué este artículo originalmente en Amazings el 12 de Noviembre de 2010.

Entre 1938 y 1940, Gerardo Tapia, cruzó la frontera francesa por un punto indeterminado. Fue uno de los 400.000 españoles que huyeron del país hacia Francia. Muchos otros fueron a Latinoamérica, Estados Unidos o a Reino Unido. Se fue sin saber si podría volver. Lo haría unos 40 años más tarde, tras la llegada de la democracia. La mayoría nunca volvió.

En la España de hoy, el exilio político es ya cosa del pasado. Muy lejano para los que hemos nacido con la democracia como cuna. Sufrimos, sin embargo, otro tipo de exilio. Un exilio sin la amenaza de fusiles pero no menos dramático para el futuro de nuestro país. El exilio de la Ciencia.

Los exiliados de hoy en día no cruzan la frontera en los Pirineos ni son retratados en blanco y negro por Robert Cappa. Vuelan en low cost hacia los Estados Unidos, Alemania o Reino Unido. Con sus retratos familiares guardados en Facebook y no en desgastados álbumes. Con el embutido envasado al vacío en vez de en hojas de periódico. Son jóvenes altamente formados: científicos, ingenieros y médicos que se van uno a uno. Poco a poco.

No saben si volverán. Creen que sí, pero probablemente no sea así. La mayoría de los científicos que abandonan España no vuelven nunca. Porque no pueden o porque ya no quieren.

La Dictadura no sólo exilió a soldados como Gerardo Tapia, también fue acompañada por un exilio intelectual y científico causado por una depuración de la universidad. Tras la llegada de la democracia, la Ciencia, al igual que otros campos del saber, comenzó otra vez a ver la luz. Estábamos tan cerca.

Los constantes recortes en I+D han roto el sueño de muchos de los que habitan otras tierras. Jóvenes investigadores aprendiendo o enseñando en los mejores centros del mundo.

Alemania ha mantenido el gasto en ciencia y en educación. Reino Unido lo quería bajar aunque parece que podría recular (en cualquier caso nada comparable a España), EEUU sigue como una locomotora y Asia ya abre las puertas a los investigadores europeos.

Un importante científico vasco comentaba el otro día a una amiga que España está ya tocada para los próximos 10 años. Difícil volver de Alemania, aunque dé con cuadratura del círculo. Diez años. Nadie va esperar tanto.

Muchos de los jóvenes que despunten en otros países no podrán volver. Les darán sus mejores años a otros países que no invirtieron nada en su educación. Mirarán de reojo la situación española. Quizás dentro de mucho tiempo pensarán que algo ha cambiado y que están dispuestos a trabajar con menos recursos, a ganar menos y a ser tratados peor. Todo por el país que les vio nacer. Entonces vendrá otra crisis, como ocurre en cada década, y será peor. A algunos les pillará con el sueño de volver y otros los derrumbará cuando ya estén en España. Cuando ya lo hayan sacrificado todo por volver.

Hablo de los jóvenes porque son los grandes perjudicados con estos recortes y porque son los que podrían iniciar el cambio de modelo. Y es que se nos olvida tan rápido que muchos de los avances de la Ciencia fueron impulsados por jóvenes investigadores.James Watson tenía 25 años cuando propuso junto a Francis Crick (37) la estructura de la doble hélice. Einstein tenía 26 cuando convulsionó la física. Ni siquiera hay que ir tan lejos. Mariano Barbacid tenía 33 años cuando realizó uno de los descubrimientos más importantes de la investigación contra el cáncer. Juan Ignacio Cirac tenía 30 años cuando propuso su modelo de computación cuántica. El primero lo hizo desde los Estados Unidos y el segundo desde Austria. ¿Cuántos podrán cambiar el mundo desde España en esta década? ¿Llegará el día en que un científico extranjero realice un trabajo similar tras emigrar a España?

Dentro de 30 años algunos jóvenes volverán a España desde otros lugares del mundo. Vendrán a conocer el lugar que exilió a sus padres y que tantas veces han oído maldecir. No os preocupéis por ellos, al fin y al cabo están donde se les aprecia. Deberíais preocuparos por vosotros mismos, si os quedáis, ¿O acaso creéis que vuestras pensiones se van a pagar construyendo casas?

Fuente de la imagen: Foro por la Memoria

Enlaces relacionados:

• El día que la homeopatía se coló por la puerta grande
• ¿Qué es la homeopatía?

En 1975 un afortunado estudiante que pisara el Medical Research Council (MRC) de Cambridge podía tener la suerte de encontrarse con muchas de las grandes figuras de la bioquímica del siglo XX. Por los pasillos de este mítico centro de investigación se movían entre otros Max Perutz, Francis Crick, Tim Hunt o Sydney Brenner. Los cuales eran ya o serían galardonados con el premio Nobel. Incluso los estudiantes más jóvenes podían disfrutar de un café en compañía de estos genios ¿de todos los que poblaban el MRC? Probablemente no de la compañía de Frederick Sanger.

Frederick Sanger había ganado el premio Nobel de Química en 1958 por sus estudios sobre la estructura de las proteínas y era una figura de relevancia mundial. Sin embargo, esto no varió considerablemente su curiosidad y dedicación al trabajo de laboratorio. En 1975, lejos de colgar la bata de laboratorio, Sanger pasaba interminables horas, prácticamente sólo, desarrollando un método para analizar secuencias de DNA. Aquellos que vivieron esos gloriosos días en el MRC, apenas recuerdan haber charlado con él. Su determinación le llevó a remover una vez más los cimientos de la bioquímica y por ello sería galardonado por segunda vez con el Nobel de Química en 1980. Se convertía así en la cuarta persona en conseguir el preciado galardón por 2 veces (los otros 3 fueron Marie Curie, Linus Pauling y John Bardeen) y el único que aun se encuentra entre nosotros.

¿Queréis saber cómo el Dr. Sanger cambio nuestro mundo?

Las proteínas poseen una estructura definida

Los años 50 fueron una época dorada para la bioquímica. En 1953 Watson y Crick publicaban la estructura del DNA respondiendo a una pregunta fundamental sobre la organización de la vida. El descubrimiento sirvió como pistoletazo de salida para la biología molecular  cuyas repercusiones tanto científicas, médicas y sociales son incalculables. Quedaba en el aire una pregunta fundamental más antigua que la organización del DNA: la estructura de las proteínas. No hay que olvidar que hasta una década antes las proteínas eran consideradas la base de la herencia y se sabía además que eran las máquinas que mantenían en funcionamiento a las células y por ende a nosotros. A principios de los 50 existía una presunción general de que las proteínas eran masas amorfas aunque ya en 1951  Linus Pauling publicaba un trabajo fundamental sobre la organización de los aminoácidos en la proteínas. Frederick Sanger abordó el problema desde otro punto de vista ¿Poseen todas las moléculas de un tipo de proteína, por ejemplo de insulina, la misma secuencia y estructura? Para ello ideó un astuto método para cortar la insulina en diferentes fragmentos y analizarlos mediante un método de separación por carga eléctrica y diferentes reacciones químicas. De esta forma podía deducir que aminoácido que complementaba cada fragmento. Repetido el proceso innumerables veces, y con ayuda de ciertas reacciones químicas específicas de algunos aminoácidos, averiguó por primera vez la secuencia completa de una proteína y demostró que éstas poseen una estructura definida. Un conocimiento que influenció notablemente a Francis Crick en su Hipótesis de la secuencia: una secuencia de DNA determina la de RNA producido, esta a su vez la secuencia proteica la cual determina su estructura tridimensional y su función.

Hackeando el código genético

Lejos de colgar la bata al recibir el premio Nobel, Sanger dedicó sus estudios a la genética y en 1964 descubrió el iniciador de la transcripción en bacterias que sería una de las guindas del descubrimiento del código genético.

Secuenciación del DNA

Hasta que Sanger abordó el problema la secuenciación de moléculas de DNA era una tarea titánica y muy limitada. El que fuera pionero en la secuenciación de proteínas se aventuraba a un problema de enorme magnitud. Para entenderlo hay que pensar en 3 variables importantes:

• 1.-La secuencia de de DNA que codifica una proteína es, cómo mínimo, 3 veces más larga (un codón = 3 bases).
• 2.- Sólo hay 4 bases diferentes frente a los 20 aminoácidos lo que limita las métodos de detección
• 4.- Las diferencias entre las bases son mínimas.

El sistema ideado por Sanger en los años 70 fue tan ingenioso como sencillo. Consistía en replicar el DNA en 4 tubos diferentes. El secreto de su éxito estaba en añadir en cada tubo las 4 bases no marcadas y una pequeña proporción de 1 de las 4 bases marcada con un isótopo radiactivo de forma que cada tubo contenía una de ellas marcada. Dichas bases marcadas estaban convenientemente modificadas de forma que paraban la replicación, como la incorporación de la misma base marcada y la no marcada se hace de forma aleatoria el resultado eran cadenas de DNA con diferente longitud siempre acabadas en la base marcada. Teniendo en cuanta la gran cantidad de cadenas que se generan, éstas cubren todo el rango de longitud de la cadena inicial y por tanto todas las incorporaciones de esa base en cuestión. Cómo se puede observar en la figura sólo restaba separar las cadenas mediante una carga eléctrica (proporcional al tamaño) hasta una resolución de una base e ir contando en cada salto que tubo de los 4 es el que tiene la señal radiactiva que finalizó la replicación. (Podéis ojear este vídeo para entenderlo mejor)

Utilizando este método, Sanger secuenció el primer genoma (el de un virus bacteriano) y abrió la puerta de la genómica. Su método secuención, con ciertas mejoras (tipo de marcaje y método de detección), fue determinante para la secuenciación del genoma humano y sigue siendo el sistema dominante en todo el mundo, si bien nuevos métodos desarrollados en la última década lo están desplazando.  En 1980 Sanger recibió el premio Nobel junto a Walter Gilbert y Paul Berg por sus trabajos en la secuenciación de cadenas de DNA.

El jardinero con 2 premios Nobel

A los 65 se retiró de la ciencia. La leyenda dice (y él lo medio confirma en el siguiente vídeo) que incluso entonces seguía trabajando regularmente en el laboratorio y nada más cumplir los 65 dejó su pipeta en el laboratorio, colgó la bata, y ya no volvió más. Actualmente el Dr. Sanger vive con su mujer en las afueras de Cambridge y dedica su tiempo a la jardinería. Si os pasáis por la aldea de Swaffham Bulbeck, buscad la casa con los geranios y las rosas más bellas, seguro que allí hallareis a uno de los pocos hombres vivos que de verdad ha cambiado nuestra concepción del mundo.

Podéis escucharle en esta reciente entrevista, desgraciadamente ya mayor y con algunas lagunas de memoria:

Si te ha gustado puedes menearlo aquí.

Referencias:

Me enteré de que Sanger estaba aun vivo gracias a un tweet de @kurioso sobre los 20 científicos vivos más influyentes. Podéis leer algo más sobre Fred Sanger en la biografía que aparece en el Instituto Sanger. También podéis leer sobre aquella maravillosa época en el MRC en esta entrevista a Eddy de Robertis [pdf].

Las imágenes provienen de la Wikipedia y el UWEC. Podéis encontrar mucha de la información que he usado en el post en la página que wikipedia dedica a Fred Sanger.

Relacionado:

• Primer genoma humano secuenciado, y clínicamente interpretado (Apuntes desde el MIT)
• Descifrando el gran código (Amazings)