BioChemIsTry

Enzyme Kinetics Theory and Practice

noreply@blogger.com (Anonymous) — Sat, 21 Dec 2013 07:53:00 +0000

Download Di Sini

*Jika link tidak berfungsi, mohon hubungi melalui "Contact me" (side bar blog)

Kopi atau Bir? Pengaruh Kafein dan Alkohol pada Genom Kita

noreply@blogger.com (Anonymous) — Thu, 19 Dec 2013 04:33:00 +0000

Prof. Martin Kupiec dan timnya di Departemen Bioteknologi dan Mikrobiologi Molekuler Universitas Tel Aviv telah menemukan bahwa minuman mungkin juga memiliki pengaruh yang berlainan pada genom kita. Penelitian ini dilakukan menggunakan 6000 galur khamir yang memiliki banyak kesamaan genetik penting dengan manusia. Para peneliti menemukan bahwa kafein membuat telomer lebih pendek sedangkan alkohol membuat telomer menjadi memanjang. Hal tersebut dapat mempengaruhi pada penuaan dan kanker.

Kopi dan bir memiliki efek yang berlawanan. Kopi membuat kita segar sedangkan bir membuat kita lemas. Para peneliti kini menemukan bahwa keduanya mungkin juga memiliki pengaruh yang berbeda pada genom kita

Antara kematian dan keabadian

Telomer terbuat dari DNA dan protein. Telomer menandai ujung dari untai DNA pada kromosom kita dan berperan penting untuk memastikan untai DNA diperbaiki atau disalin secara benar. Setiap saat sel memperbanyak diri, Kromosom disalin pada sel yang baru dengan telomer yang sedikit lebih pendek. Pada akhirnya telomer akan menjadi terlalu pendek dan sel akan mati. Hanya sel janin dan kanker yang memiliki mekanisme untuk mencegah hal ini terjadi. Mereka terus mengalami proses reproduksi.

Kiri: Perbedaan telomer pada kromosom sel puncak embrio (panjang) dan sel puncak dewasa (pendek).
Kanan: Proses pemanjangan telomer pada anti-aging.

(Sumber)

Handbook of Medicinal Herbs 2nd Ed

noreply@blogger.com (Anonymous) — Tue, 17 Dec 2013 09:15:00 +0000

Download Di Sini

*Jika link tidak berfungsi, mohon hubungi melalui "Contact me" (side bar blog)

Penelitian Baru Mengenai Pengobatan HIV Dengan Radioimunoterapi

noreply@blogger.com (Anonymous) — Sun, 15 Dec 2013 01:00:00 +0000

Highly active antiretroviral therapy (HAART) selama ini digunakan dalam pengobatan pasien yang terinfeksi HIV dengan cara menekan replikasi virus dalam tubuh. Namun dibalik kesuksesan HAART dalam mengurangi virus HIV secara efektif, peneliti yakin bahwa sel dalam tubuh yang terinfeksi secara laten mencegah kemungkinan sembuh secara permanent.

Ekaterina Dadachova, Ph.D. (Profesor Radiologi, Mikrobiologi dan Imunologi di Albert Einstein College of Medicine) mengatakan bahwa di dalam tubuh pasien HIV yang menjalani HAART, obat menekan replikasi virus yang berarti menekan jumlah virus dalam aliran darah agar tetap rendah. Akan tetapi HAART tidak membunuh sel yang terinfeksi HIV. Oleh karena itu diperlukan pengobatan HIV yang membunuh sel-sel terinfeksi HIV.

Dr. Dadachova dan timnya mencoba menggunakan radioimunoterapi (RIT) pada sampel darah dari 15 orang pasien terinfeksi HIV yang diobati dengan HAART. RIT (biasa digunakan dalam terapi pengobatan untuk kanker) menggunakan antibody monoklonal (sel-sel klon yang dijadikan alat oleh sistem imun untuk mengidentifikasi dan menetralkan antigen.

Antibodi yang dilabel radioaktif mengikat protein gp41 virus yang terekspresi pada permukaan limfosit yang terinfeksi HIV. Sel-sel tersebut dibunuh menggunakan radiasi alfa yang dibawa oleh antibodi tersebut.

Dalam penggunaan RIT, antibody mengikat sel terinfeksi dan membunuhnya dengan radiasi. Ketika HAART dan RIT digunakan bersama-sama, mereka dapat membunuh dan sel yang terinfeksi sekaligus. RIT membunuh sel terinfeksi HIV secara spesifik dan jelas. Radionuklir yang digunakan menghasilkan radiasi hanya untuk sel terinfeksi HIV tanpa membunuh sel-sel lain di sekitarnya.

(Source)

Chevening Scholarship, Beasiswa S-2 di UK

noreply@blogger.com (Anonymous) — Thu, 12 Dec 2013 03:22:00 +0000

Chevening Scholarship

Chevening scholarship adalah beasiswa yang disponsori oleh Pemerintah Inggris melalui Kantor kementerian Luar Negeri (Foreign and Commonwealth Office – FCO). Program beasiswa ini diberikan untuk melanjutkan studi di jenjang S-2 (master) selama 1 tahun di berbagai subjek dan berbagai universitas terkemuka di UK.

Beasiswa Chevening menanggung:

Biaya hidup
Biaya kuliah
Tiket pulang pergi

Persyaratannya untuk warga Indonesia:

Warga Negara Indonesia
Lulusan dengan IPK minimum >=3.0
Kemampuan berbicara dan menulis bahasa Inggris IELTS 6.5
Pengalaman bekerja setelah lulus sarjana (S1) minimal 2 tahun
Komitmen untuk pengembangan karir jangka panjang
Harus dapat menunjukkan potensi kepemimpinan dan memiliki kapasitas untuk memainkan peran penting dalam kemajuan masa depan Indonesia
Tidak dapat menerima aplikasi untuk lulusan MBA
Penerima Chevening sebelumnya tidak diperkenankan mendaftar
Karyawan, kerabat karyawan (atau mantan karyawan yang sudah tidak lagi bekerja selama dua tahun terakhir) dari Kantor Kementerian Luar Negeri (FCO), termasuk staf Kedutaan, dan pos-pos FCO, British Council, atau sponsor Chevening lainnya, tidak diperkenankan untuk ikut mendaftar
Pendaftaran untuk 2015/2016 akan dibuka pada summer 2014, silahkan mendaftar terlebih dahulu untuk mendapatkan pemberitahuan mengenai jadwal pembukaan beasiswa.

(Sumber)

Website resmi:

http://www.chevening.org/

Molecular Cloning: A Laboratory Manual 3rd Ed (Sambrook & Russell)

noreply@blogger.com (Anonymous) — Thu, 12 Dec 2013 01:00:00 +0000

Download Di Sini

*Jika link tidak berfungsi, mohon hubungi melalui "Contact me" (side bar blog)

Apa Itu Apoptosis?

noreply@blogger.com (Anonymous) — Tue, 10 Dec 2013 01:00:00 +0000

Tubuh manusia normal memiliki suatu mekanisme keseimbangan (homeo-stasis) antara pertumbuhan (proliferasi) dan kematian sel (cell death). Hal ini berguna untuk pertumbuhan normal. Bila salah satu keseimbangan terganggu akan menyebabkan suatu penyakit, misalnya bila pertumbuhan sel lebih cepat dari kematian sel maka akan menimbulkan Alzheimer dan penyakit parkison.

Apoptosis adalah kematian sel terprogram dengan tujuan untuk menghilangkan sel yang tidak diinginkan dan mengurangi jumlah sel yang terlalu banyak, sehingga jumlah sel dalam jaringan organisme multiseluler dapat dikendalikan. Selain itu apoptosis juga menghilangkan sel yang berbahaya bagi tubuh. Oleh karena itu, apoptosis memiliki peranan penting untuk perkembangan, homeostasis jaringan, dan proteksi terhadap patogen.

Pada sel mamalia, saat terjadi rangsangan untuk apoptosis maka akan mengakibatkan terjadinya peningkatan permeabilitas membran luar mitokondria yang menyebabkan pelepasan sitokrom-c ke dalam sitosol. Sitokrom-c berfungsi sebagai apoptosis-inducing factor (AIF) yang menginduksi terjadinya apoptosis sel. Sitokrom-c bersama dengan molekul adaptor Apaf-1, memicu dimerisasi dan aktivasi proenzim caspase-9. Caspase-9 yang aktif, selanjutnya akan mengaktifkan caspase-3. Caspase-3 akan mengaktifkan beberapa target selular, termasuk inhibitor dari caspase-activated deoxyribonuclease (ICAD). Akibatnya akan terjadi apoptosis inti yang ditandai dengan kondensasi kromatin lanjut dan degradasi DNA oligonukleosomal. Jalur apoptosis yang tergantung pada caspase ini dipengaruhi oleh sistem pengendalian ganda, termasuk anggota keluarga Bcl-2 yang mempunyai pengaruh anti-apoptotik dengan menghambat pelepasan sitokrom-c, yaitu Bcl-2 dan Bcl -X_1. Selain itu ada anggota keluarga Bcl-2 yang mempunyai pengaruh pro-apoptotik dengan mempermudah pelepasan sitokrom-c, yaitu Bax dan Bid. Pengendalian apoptosis melalui jalur ini juga dilakukan oleh IAP (inhibitors of apoptosis) dan smac/ DIABLO.

Mekanisme terjadinya apoptosis

Komponen-komponen yang terlibat dalam proses apoptosis, yaitu protein caspase, protein adaptor, kelompok TNF dan TNF-R, serta kelompok protein Bcl-2. Caspase atau Cystein Aspertyl-specific Protease merupakan enzim yang berperan dalam proses apoptosis. Enzim ini terdiri dari berbagai jenis yang masing-masing memiliki pern dan fungsinya masing-masing, contohnya yaitu caspase-8 yang berperan dalam proses apoptosis melalui jalur ekstrinsik dan caspase -9 yang berperan dalam proses apoptosis melalui jalur intrinsik. Kelompok protein Bcl-2 ada yang berperan sebagai anti-apoptosis (Bcl-2 dan Bcl-X_L) dan ada yang berperan sebagai pro-apoptosis (Bax, Bcl-X₅, Bak, dan Bad). Mekanisme aksi dari protein Bcl-2, yaitu membentuk pori-pori, heterodimerisasi protein pro- & anti-apoptosis, regulasi caspase melalui adaptor, interaksi dengan protein mitokondria lain, dan oligomerisasi membentuk kanal ion selektif.

Harper's Illustrated Biochemistry (26th Ed, 2003)

noreply@blogger.com (Anonymous) — Mon, 09 Dec 2013 01:00:00 +0000

Download di sini

*Jika link tidak berfungsi, mohon hubungi melalui "Contact me" (side bar blog)

Indonesian Austrian Scholarship Program (Doctoral/PhD Scholarship)

noreply@blogger.com (Anonymous) — Sun, 08 Dec 2013 01:00:00 +0000

Based on the Agreement between the Indonesian Ministry of Education and the Austrian Ministry of Science and Research and the agreement between the Directorate General of Higher Education of the Ministry of Education and Culture of the Republic of Indonesia (DIKTI) and the Austrian Agency for International Cooperation in Education and Research (OeAD-GmbH) in cooperation with ASEA-UNINET, we are proud to announce the new scholarships for Indonesian students at Austrian universities.

Eligible for application are postgraduates who are qualified for a doctoral/PhD program in Austria. A letter of acknowledgement from an Austrian supervisor is a prerequisite for a successful application. Good knowledge of English and/or German for the respective study program in Austria has to be proved.

Selection through an Austrian-Indonesian Board of Experts. The nomination of the Austrian representatives within this board is performed by ASEA-UNINET.

Benefit:

1. Monthly grant rate: 1.000 Euro

2. Accident and health insurance, accommodation if necessary, the OeAD-GmbH will take out an accident and health insurance on behalf of the grant recipient. The OeAD-GmbH will endeavor to provide accommodation (student hall of residence or flat) if desired by scholarship holders. Monthly costs: EUR 220 to EUR 470 (depending on how much comfort the scholarship holder wants). The costs for insurance and accommodation have to be paid out of the grant by the scholarship holder.

3. Travel costs subsidy (for arrival and departure) will be paid by Indonesian authority

Closing Date for Applications

1 February 2014

Area of study or research

All areas

Target group

Prospective lecturers or lecturers of a university in Indonesia (postgraduates) who are qualified for a Doctoral/PhD program in Austria

Maximum age

35 years or maximum 5 years after graduating from a master course whichever applies

Authority awarding grant

The OeAD-GmbH on behalf of and financed by the Austrian Ministry of Science and Research (BMWF) and DIKTI

Duration

36 months

Quota

Up to 20 new scholarships per study year

Application form: Download

Where to submit your application

Please send your application to Mr. Tuan Trieu Ha (tuantrieu.ha@oead.at)

The following documents have to be submitted:

- Application form

- Letter of acknowledgement from a supervisor of the Austrian host (“Betreuungszusage”) (Without an acknowledgement from a supervisor of the Austrian host University the application will not be considered)

- Description of study project/thesis (2-4 pages, title, content, methodology, time table) which has been agreed on with the future supervisor in Austria.

- One letter of recommendation by the supervisor (no specific form required: it must contain the letterhead, date and signature of the supervisor recommending the applicant and the stamp of the university/department and must not be older than six months at the time of application.)

- Scan of passport (Page with name and photo)

- Scan of transcripts and graduation certificates of former studies (Diploma, Bachelor, Master, PhD or Doctoral studies)

- Good knowledge of English and/or German for the respective study programme in Austria has to be proved. (TOEFL 500 points or IELTS 5.5 points)

Incomplete applications as well as those not complying with the specific conditions will not take part in the selection process!!

Selection procedure:

Selection through an Austrian-Indonesian board of experts. The nomination of the Austrian representatives within this board is performed by ASEA-UNINET.

Process:

After submission of the documents to the OeAD-GmbH, preselected candidates will be invited to an Interview in Indonesia. Nominated candidates apply for admission in an Austrian university with the support of the OeAD-GmbH. At the same time they have to submit a second application to DIKTI on http://beasiswa.dikti.go.id (for permanent lecturers) or http://beasiswa.dikti.go.id/ln (for prospective lecturers). The final decision about the scholarship award will be made after successful admission to an Austrian University.

Further Information

www.grants.at

(enter in the field "search by name" the name of the scholarship program)

DIKTI

EXPERTS4Asia Scholarship

noreply@blogger.com (Anonymous) — Fri, 06 Dec 2013 01:00:00 +0000

EXPERTS4Asia Call for Applications:

Call Summary:

Open to all level (BA, MA, PhD, PostDoc and Staff) from Asia (Afghanistan, Bangladesh, Bhutan, China, India, Indonesia, Maldives, Nepal, Pakistan, the Philippines, Sri Lanka and Thailand) and Europe (from Croatia, Czech Republic, Finnland, Germany, Sweden, Portugal and United Kingdom).
Please note that Oxford University ONLY offers PhD, PostDoc and Staff mobilities.
There is no undergraduate mobility for Target Group (TG) - 2 and no PostDoc and Staff mobility for Target Group 3.
For Asian Candidate it is for all Target Groups (TG 1 , TG 2 and TG3) and for EU Candidates TG 1 and TG2.
Deadline: 15 February 2014

(Source)

Para Peneliti Mengembangkan Baterai Elektroda Yang Dapat Memperbaiki Diri

noreply@blogger.com (Anonymous) — Thu, 05 Dec 2013 01:00:00 +0000

Para peneliti telah membuat baterai elektroda pertama yang dapat menyembuhkan dirinya sendiri. Penelitian ini memiliki potensi untuk mengembangkan generasi baru dari baterai ion lithium untuk sumber listrik pada mobil, telepon genggam, dan alat-alat yang lain. Rahasianya adalah polimer elastis yang melapisi elektroda mengikatnya bersama dan secara spontan menyembuhkan retakan kecil yang terbentuk selama pengoperasian baterai.

Kiri: mikrograf electron menunjukkan retakan kecil pada polimer pelapis yang terbentuk selama proses pengisian baterai.

Kanan: Lima jam kemudian, retakan-retakan kecil telah diperbaiki dengan sendirinya.

Berita Lengkap>>>>

Nanorobot Untuk Mengangkut Obat Dalam Tubuh

noreply@blogger.com (Anonymous) — Wed, 04 Dec 2013 01:00:00 +0000

Nanorobot merupakan istilah populer untuk molekul-molekul dengan sifat unik yang memungkinkan molekul-molekul tersebut untuk diprogram untuk melakukan tugas spesifik tertentu. Dalam kerja sama antara kolega di Italia dan USA, para peneliti di Aarhus University telah mengambil langkah utama menuju pembuatan nanorobot pertama dari molekul DNA yang dapat meng-enkapsulasi dan melepaskan biomolekul aktif. Nanorobot tersebut diberi nama DNA nanocage yang dapat mengangkut obat ke sekitar tubuh dan ditujukan memberi pengaruh pada sel-sel yang sakit.

Nanocage dengan delapan molekul DNA yang unik bergabung bersama. Para peneliti menjebak sebuah enzim aktif yang disebut Horseradish peroxidase (HRP) dalam nanocage.

Berita Lengkap>>>>

Model Struktur Protein Baru Untuk Mencegah Kanker

noreply@blogger.com (Anonymous) — Fri, 05 Aug 2011 08:07:00 +0000

Para peneliti di University of Hertfordshire telah mengembangkan sebuah model struktural baru dari protein yang memungkinkan untuk mengembangkan obat yang lebih efektif untuk penyakit target seperti kanker, penyakit jantung dan influenza.

Dalam sebuah makalah yang akan dipublikasikan dalam Journal of Structural Biology online bulan ini, sebuah tim peneliti yang dipimpin oleh Dr Andreas Kukol di University's School of Life Sciences, menjelaskan bagaimana mereka telah mengembangkan sebuah model 3D baru dari protein yang merilis penghambatan pertumbuhan sel yang bisa menyebabkan penyebaran kanker atau mendukung terjadinya infeksi seperti influenza.

"Tubuh kita terdiri dari protein yang penting untuk fungsi tubuh," kata Dr Kukol. "Kerusakan protein dapat menyebabkan kanker. Hal ini terjadi ketika sel-sel tersebut menjadi lebih aktif, sehingga tugas kami adalah mengidentifikasi inhibitornya."

Sebuah tim peneliti dipimpin oleh Dr Kukol mengembangkan model 3D dari enzim kinase IKK-β yang merupakan protein yang mengatur protein lain. "Enzim ini mengontrol protein seperti kontrol lalu lintas oleh polisi," kata Dr Kukol. "Jika polisi atau enzim menjadi tidak terkendali, maka akan terjadi kekacauan."

Model 3D baru dapat digunakan untuk mencari inhibitor baru, seperti molekul organik seperti aspirin yang menempel pada situs aktif dari enzim dan membuatnya kurang aktif sehingga menghentikan penyebaran kanker atau influenza. Model ini sekarang siap diterapkan pada perusahaan farmasi sehingga mereka dapat mengembangkan obat yang lebih efektif untuk mengatasi kondisi ini.

Dr Kukol menjelaskan bahwa pemodelan komparatif dan metode simulasi komputer yang mereka gunakan untuk protein ini dapat diambil oleh kelompok-kelompok penelitian lain. Dengan cara ini pemodelan struktur protein dapat menghasilkan model yang lebih akurat di masa depan.

Sumber: Universitas Hertfordshire, AlphaGalileo Foundation.

Potensi Kompleks Kobalt – Piridin-2,6-Dikarboksilat Sebagai Agen Antikanker Baru

noreply@blogger.com (Anonymous) — Tue, 02 Aug 2011 07:49:00 +0000

Kata Kunci: kanker, kemoterapi, kompleks logam dipikolinat
Ditulis oleh Mahbub Alwathoni pada 28-03-2011

Kanker adalah salah satu jenis penyakit tumor ganas (benignant tumour). Penyakit ini timbul akibat terjadinya mutasi pada biosintesis sel, yaitu kesalahan urutan DNA karena terpotong, tersubtitusi atau adanya pengaturan kembali, mengakibatkan pertumbuhan sel-sel jaringan tubuh yang tidak normal, cepat, dan tidak terkendali (Johann dan Barton, 1996 ; Mudasir, 2009). Sel-sel kanker akan terus membelah diri, terlepas dari pengendalian pertumbuhan dan tidak lagi menuruti hukum-hukum pembiakan. Bila pertumbuhan tidak segera dihentikan dan diobati maka sel kanker akan berkembang terus. Sel kanker akan tumbuh menyusup ke jaringan sekitarnya (invasive), lalu membuat anak sebar (metastasis) ke tempat yang lebih jauh melalui pembuluh darah dan pembuluh getah bening. Selanjutnya akan tumbuh kanker baru ditempat lain sampai akhirnya menyebabkan kematian penderitanya.

Penyakit kanker merupakan penyakit penyebab kematian terbesar kedua setelah penyakit jantung. Organisasi Kesehatan Dunia (WHO) menyatakan bahwa, jumlah penderita kanker bertambah menjadi 6.25 juta orang setiap tahun dan diperkirakan sepuluh tahun mendatang 9 juta orang akan meninggal akibat penyakit ini setiap tahunnya (Yayasan Kanker Indonesia, 2006). Sementara di Indonesia penyakit kanker adalah penyebab kematian nomor tujuh setelah stroke, tuberkulosis, hipertensi, cidera, perinatal, dan diabetes militus. Penderita kanker mencapai 6 % dari 200 juta lebih penduduk Indonesia, saat ini diperkirakan dari 100.000 penduduk Indonesia, terdapat 100 penderita baru penyakit kanker setiap tahun (Aditama, 2009). Pola frekuensi relatif jenis kanker yang sering didapati di Indonesia secara berurutan adalah kanker leher rahim (serviks), hati, payudara, paru-paru, kulit, nasofaring, limfoma, leukimia dan kolon (Reksodiputro, 1991).

Pengobatan penyakit kanker telah dilakukan secara intensif. Kemoterapi dengan menggunakan obat-obatan antikanker seperti flourasil, metotreksat dan cisplatin telah dilakukan, namun timbulnya mekanisme multidrug resistance (MDR) akan mengurangi daya kerja obat-obatan ini. Radiotherapy dengan metode penyinaran juga telah banyak dimanfaatkan tetapi kurang efektif, memerlukan biaya yang mahal, terlalu toksik, serta menunjukkan efek samping yang serius. Penelitian tentang penyakit kanker dan cara pengobatannya terus dikembangkan, diantaranya adalah kehadiran senyawa kompleks logam yang diharapkan menjadi obat anti kanker baru yang lebih baik, efektif dan efisien.

Peran senyawa kompleks logam yang diterapkan dalam bidang kedokteran menjadi topik-topik hangat dalam kimia bioanorganik (Szacilowski, et al., 2005 ; Mudasir, 2006). Salah satu topik menarik dan terus berkembang adalah adalah interaksi molekul kecil termasuk didalamnya kompleks logam dengan DNA. Topik ini menarik karena umumnya molekul-molekul kecil yang dapat berinteraksi dengan DNA adalah senyawa-senyawa yang menunjukkan aktivitas obat (terapetik), terutama dalam bidang chemotherapy dan therapy fotodinamik kanker atau senyawa-senyawa yang bersifat racun bagi tubuh (Mudasir, 2006). Oleh karena itu, dengan memahami perilaku dan sifat-sifat interaksi senyawa kompleks logam dengan DNA diharapkan dapat membantu memahami mekanisme kerja obat-obat dan mekanisme toksisitas kompleks logam pada tingkat molekular.

Kompleks logam dengan asam pikolinat merupakan produk degradasi dari tryptophan (Barandika et al., 1999). Studi kompleks pikolinat menunjukkan aktivitas biologi, dapat menginduksi sel murine leukemia HL-60 (Heren et al., 2006), dapat menghambat pertumbuhan mycobacterium ovium complex (Shimizu et al., 2006), dan beberapa laporan kompleks logam-pikolinat menunjukkan pengaruh dalam menghambat pertumbuhan sel-sel kanker. Seperti yang telah dilaporkan oleh Van Rijt, (2008), kompleks osmium(II) pikolinat memberikan pengaruh yang sama dalam menghambat sel-sel kanker seperti cisplatin yang selama ini dikenal sebagai obat chemotherapy kanker. Kompleks kobalt-aspirin seperti yang telah dilaporkan oleh Ingo (2009), juga memberikan pengaruh dalam menghambat sel-sel tumor. Kompleks kobalt-organologam seperti pada [Co2(CO)6] yang selama ini dikenal sebagai antitumor, potensi antitumornya lebih meningkat ketika dipadukan dengan aspirin (asam asetil salisilat). Aspirin adalah golongan nonsteroidal antirheumatics (NSARs) yang telah lama dikenal dikenal dalam bidang farmakologi sebagai antiradang dan penghilang rasa sakit. Efek NSARs diduga melibatkan gugus karboksilat yang melakukan penghambatan enzim cyclooxygenase (Ingo, 2009). Gugus karboksilat ini dijumpai juga pada asam pikolinat (2-piridin karboksilat) maupun dipikolinat (piridin-2,6-dikarboksilat) yang terikat pada cincin piridinnya.

Dengan penambahan satu gugus karboksilat pada cincin piridin ligan pikolinat dan terbentuk struktur dipikolinat (piridin-2,6-dikarboksilat), diharapkan kompleks logam yang dihasilkan memiliki interaksi yang lebih besar dalam menghambat sel-sel anti kanker dan menunjukkan peningkatan bioaktivitas lainnya (Martak, 2008). Kompleks logam dipikolinat seperti yang telah dilaporkan oleh Yang et al., (2002) memberikan pengaruh dalam mereduksi hyperlipidemia pada diabetes. Demikian juga laporan Colak et al., (2009) yang menunjukkan kompleks logam dipikolinat berpengaruh sebagai inhibitor pertumbuhan bakteri.

Limbah Pabrik Kertas Disulap Menjadi Produk Ramah Lingkungan

noreply@blogger.com (Anonymous) — Tue, 02 Aug 2011 07:46:00 +0000

Oleh: Rian Triana

Seorang mahasiswa pascasarjana jurusan pertanian di Yerusalem telah berhasil mengembangkan suatu metode baru untuk mengubah limbah pabrik kertas menjadi ramah lingkungan dengan memanfaatkannya pada industri busa dari sumber daya terbarukan.

Busa banyak digunakan dalam kehidupan sehari-hari, termasuk dalam pembuatan furnitur dan interior mobil. Aplikasi pada material komposit banyak menggunakan busa sebagai bahan inti dalam panel "sandwich" untuk mencapai kekuatan tinggi, penurunan berat badan, disipasi energi dan penyekatan. Busa konvensional dihasilkan dari polimer seperti poliuretan, polistiren, polivinil klorida (PVC) dan polietilen terftalat (PET). Pembuatan busa ini saat ini bergantung pada minyak fosil sehingga mengakibatkan kerugian pada lingkungan.

Shaul Lapidot, Ph.D, mahasiswa Prof Oded Shoseyov, bersama dengan rekan laboratorium di Fakultas Pertanian, Pangan dan Lingkungan Robert H. Smith, telah merumuskan suatu prosedur untuk memproduksi nano-kristal selulosa (NCC) dari limbah pabrik kertas . NCC diproses lebih lanjut menjadi komposit busa untuk diaplikasikan dalam industri bahan komposit sebagai pengganti berbasis bio untuk busa sintetis.

Proses produksi kertas melibatkan hilangnya semua serat dengan ukuran yang lebih rendah daripada ukuran mesh kain pembentuk. Akibatnya sekitar 50% dari keseluruhan serat awal untuk produksi dibuang sebagai lumpur. Di Eropa saja, 11 juta ton limbah yang dihasilkan setiap tahun oleh industri ini. Hal ini mendorong penemuan untuk mencari alternatif dan menggunakan aplikasi yang berbeda untuk limbah tersebut.

Lapidot telah menemukan bahwa serat dari lumpur pabrik kertas merupakan sumber yang sempurna untuk produksi NCC karena ukurannya yang kecil membuatnya membutuhkan energi dan bahan kimia yang relatif rendah untuk mengolahnya menjadi NCC. Ia juga mengembangkan aplikasi NCC ke busa struktur nano. Hal ini diproses lebih lanjut menjadi busa komposit untuk aplikasi dalam industri bahan komposit untuk digunakan sebagai pengganti busa sintesis berbasis bio.

Sumber: http://www.sciencedaily.com/releases/2011/08/110801094309.htm

Seminar Biokimia "Your Healthy is in Your Hand"

noreply@blogger.com (Anonymous) — Mon, 25 Apr 2011 13:47:00 +0000

Community of Research and Education in Biochemistry's (CREB's) presents :

Seminar Biokimia

"Your Healthy is in Your Hand"

Seminar 1 "Peningkatan Kualitas Hidup dengan Deteksi Dini Penyakit Degeneratif"
Pembicara : Rini Budiarti, M.Si (Prodia Product Executive)

Seminar 2 "Stay Healthy with Nanotechnology"
Pembicara :... Dr. Etik Mardliyati (ahli Nanofarmasi)

Grand Launching Buku "Teknik Penelitian Biokimia"
Penulis : Prof. Dr. drh. Maria Bintang, MS.

Minggu, 1 Mei 2011 @ auditorium Andi Hakim Nasution (AHN) IPB

pukul 08.00 - 13.00

htm :

S0-S1 Biokimia Rp 15.000,-

S0-S1 non Biokimia Rp 20.000,-

S2,S3,dan umum Rp 25.000,-

*ticket box @koridor faperta (21-30 April 2011)

*ON THE SPOT *

Transfer melalui rekening BNI a.n Muhamad Daviq Fahrizal no.rek 015451916

# Doorprize, Hiburan, Snack, Lunch, Coffee break, SERTIFIKAT

CP : Daviq (0856782331964)
Nur Aeny (081319313458)

DON'T MISS IT!

Biochemistry Seminar and Expo "Health and Biochemistry"

noreply@blogger.com (Anonymous) — Fri, 05 Nov 2010 13:17:00 +0000

BIOCHEMISTRY SEMINAR & EXPO

“Health and Biochemistry”

Sabtu-Minggu, 27-28 November 2010

08.00-16.00

Auditorium Andi Hakim Nasution

Kampus IIPB Dramaga Bogor

Harga tiket:

Pelajar: Rp 35.000,-/hari atau Rp 60.000,-/2 hari

Mahasiswa: Rp 40.000,-/hari atau Rp 70.000,-/2 hari

Umum: Rp 50.000,-hari atau Rp 80.000,-/2 hari

Tiket bisa didapatkan dengan mendaftar melalui sms ke:

Leli Nurfitriyani (085723567730)

Ganep Agus dj (085718855869)

dengan format: Nama_asal kota/sekolah/universitas_daftar1/2 hari_tanggal seminar_sudah transfer

setelah mentransfer uang pendaftaran melalui rekening BNI

ke no. 0132602915 atas nama Leli Nurfitriyani

Info lebih lanjut: http:// biochemistry.blogspot.com

CP: Ganep (085718855869)

Ageng (08568434431)

Fasilitas:

Sertifikat, Souvenir, Lunch, Seminarkit, Snack, Coffee Break,

Door Prize:

Hp, jam tangan, souvenir, dll.

Majalah Kulinologi Indonesia (bagi 300 pendaftar pertama)

Test Gula Darah Gratis (bagi 100 pendaftar pertama)

Sabtu, 27 November 2010

Diabetes Mellitus

Prof. Dr. Zulies Ikawati, Apt

(Guru Besar Farmasi UGM, Penulis Buku Cerdas Mengenali Obat, dan Buku Resep Hidup Sehat)

Epi Suryono

(Persatuan Diabetes Indonesia)

Kanker Serviks

dr. Sigit Purbadi, SpOG

(Dokter dan Pakar Kanker Serviks)

Titah Rahayu

(Rumah Kanker Indonesia)

Jantung Koroner dan Atherosklerosis

Dr. Hasim, DEA

(Dosen Biokimia IPB dan Ketua Ikatan Dekan FMIPA se-Indonesia)

drh. Sulistiyani M. Sc. Ph. D

Minggu, 28 November 2010

Osteoporosis

dr. Prastuti

(Dokter dan Dosen Pengajar Kelas Internasional FK-UI)

Gaya Hidup Sehat

drh. Rizal Damanik, M.Rep.Sc, Ph.D

(Dosen Gizi dan Peneliti IPB)

Andang Gunawan

(Pimred Majalah Kesehatan “Nirmala”)

Hiburan

Accoustic Performance by: F-Ribosa, Yan Zewa

Drama Musical by: D’cebochs

Apresisi Puisi: Paturohman

Diselenggarakan oleh:

Himpunan Profesi Departemen Biokimia

Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam

Institut Pertanian Bogor

Lomba Biochemistry Expo

noreply@blogger.com (Anonymous) — Sat, 21 Aug 2010 14:17:00 +0000

Lomba Fotografi

Tema : “Biochemistry in Our Life”, karya fotografi yang menggambarkan sebuah potret kehidupan yang dekat dengan dunia Biokimia, menunjukkan sisi lain biokimia di berbagai bidang (pangan, industri, kesehatan, lingkungan atau bioteknologi). Bersifat mendidik, kritis dan membangun tidak terbatas hanya pada aktivitas laboratorium.

Ketentuan Lomba :

1. Lomba terdiri atas satu kategori yaitu UMUM.

2. Pemotretan dilakukan dengan menggunakan kamera digital tanpa pengeditan (kecuali cropping, contrass, brightness).

3. Setiap peserta menyerahkan satu foto digital dengan format JPEG dalam bentuk CD dan menyerahkan hasil cetakan foto dalam ukuran 10R.

4. Foto merupakan hasil karya terbaru dan seluruh konten yang terdapat dalam gambar merupakan tanggung jawab peserta.

5. Gambar dalam karya tidak mengandung kekerasan, pornografi dan SARA

6. Menyertakan judul foto, deskripsi foto, nama lengkap, fotokopi identitas diri (KTP/ KTM/ SIM/ Kartu Pelajar/ Paspor), nomor telepon/hp dalam selembar kertas beserta struk transfer bukti pembayaran.

7. Karya yang dikumpulkan menjadi milik panitia

Keterangan lebih lanjut: klik disini

Campuran bakterial mempermanis sintesis bioobat

noreply@blogger.com (Anonymous) — Sat, 21 Aug 2010 13:51:00 +0000

Ditulis oleh Awan Ukaya pada 15-06-2010

Bakteri yang berada pada perut manusia diatur untuk menjadi pabrik yang bagus bagi obat biologis dan terima kasih telah memodifikasi beberapa gen dari spesies lain, yang menyebabkan gastroenteritis. Dengan menggunakan pasangan yang kedengarannya tidak mungkin, para peneliti dari Ammrika Serikat dan Swiss telah menciptakan metode bakterial pertama kali dalam pembuatan glycoprotein yang kebanyakan ditemukan pada tubuh manusia. Pendekatan ini memberikan kontrol yang belum terjadi sebelumnyaterhadap gula mana yang direkatkan pada protein dan selanjutnya dapat meningkatkan performa obat biologis.

‘Metode kombinasi dapa memberikan ini suatu cara efisien untuk menghasilkan obat glycoprotein buatan sendiri seperti antibodi monoclonal,’ jelas Lai-Xi Wang dari University of Maryland, Amerika Serikat. Sebagaimana glycoprotein, aktifitas antiobodi monoclonal sekarang ini dapat saja tidak konsisten dikarenakan bagian glycan – atau polysaccharide – yang mereka hasilkan sangat banyak. ‘Glycoprotein dihasilkan sebagai campuran in vivo,’ jelas Wang. ‘Hanya beberapa dari glycoform yang sangat aktif.’ Protein glycosylating yang homogen dengan glycan aktif menghasilkan obat yang lebih manjur.

Biasanya Escherichia coli yang tidak berbahaya dimana dapat memusnahkan mikroba telah digunakan dalam industri menghasilkan protein tetapi bukannya glycoprotein, dimana mereka tidak mampu untuk menambahkan gula yang fungsinya memodulasikan. ‘Pada umumnya bakteri tidak memiliki perlengkapan glycosylasi protein,’ jelas Wang. Namun begitu Markus Aebi dari Swiss Federal Institute of Technology (ETH) di Zurich telah menemukan bahwa bakteri Campylobacter jejuni yang berbahaya tidak memiliki kemampuan yang tidak biasa untuk merekatkan gula pada protein.

Rekayasa dan pentransferan perlengkapan glycosylasi dari C. jejuni kedalam E. coli dan kemudian menggunakan beberapa enzim untuk memodifikasi porsi gula menghasilkan protein ter-glycosylasi secara homogen. Sayangnya, C. Jejuni yang menghasilkan glycoprotein secara normal memicu respon kekebalan tubuh di manusia. Hal ini dikarenakan bakteri N-glycan, sebuah alpha yang dihubungkan N-acetyl galactosamine oligosaccharide, menempel pada residu asparagine dari protein melalui suatu aminosugar yang tidak biasa disebut dengan bacillosamine yang membuatnya tidak seperti glycan pada manusia. Aebi dan tim Wang merekayasa gen glycosylasi sebelum mentransfer mereka kedalam E. coli, untuk merubah gula yang pertama yang dilekatkan pada asparagine kedalam N-acetylglucosamine yang umumnya ditemukan di tubuh kita. Lalu, menggunakan metode enzimatik in vitro, mereka menghiasi dan menggantikan residu N-acetyl galactosamine dengan N-glycans yang dipilih mereka bagi glycosylasi ‘manusiawi’ homogen.

‘Kemampuan untuk mengekspresikan protein pada E. coli sangat mudah dan lebih murah,’ kata Antony Fairbanks dari University of Canterbury, New Zealand. Bagaimana Fairbanks, yang mendirikan perusahaan pentargetan obat di Inggris, Glycoform, mencatat bahwa sementara metode ini berhasil dengan glycoprotein C. jejuni , hal ini meng- glycosylasi antibodi immunoglobulin G yang umumnya pada manusia sedikit tidak lengkap.

Andy Extance

Referensi
F Schwarz et al, Nature Chemical Biology, 2010, DOI: 10.1038/nchembio.314

Mikroba yang tercakup dalam penyakit Alzheimer

noreply@blogger.com (Anonymous) — Sat, 21 Aug 2010 13:49:00 +0000

Ditulis oleh Awan Ukaya pada 18-08-2010

Peptida beta amyloid sudah lama dianggap terlibat dalam penyakit Alzheimer, meski ada banyak sekali kontroversi mengenai apakah hal ini merupakan penyebab utama penyakit ini, atau hanya suatu symptom saja. Sekarang ini, Rudolph Tanzi dan kelompoknya pada Massachusetts General Hospital telah menunjukkan bahwa hal ini bukanlah ‘bualan’ belaka – ini dapat dipergunakan untuk melindungi otak dari beberpa patogen sebagai bagian sistem kekebalan tubuh bawaan.

Selama pencarian kelompok ini mengenai beberapa gen yang dikaitkan dengan penyakit Alzheimer, Kolega Tanzi yaitu Robert Moir menunjukkan struktur beta amyloid yang sangat mirip dengan apa yang dikenal sebagai antimicrobial peptide LL-37 – dimana hal ini memunculkan pertanyaan tentang ‘bagaimana jika beta amyloid juga memiliki properti antimikrobial?’ Lalu, seorang mahasiswi yaitu Stephanie Soscia mengujinya dengan suatu susunan patogen yang umum, seperti Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae dan Candida albicans, dan menemukan delapan dari pathogen dibunuh oleh amyloid – serta, di beberapa kasus, hal ini lebih efektif dari pada LL-37.

‘Hal ini sesegera mungkin menunjukkan dua hal,’ kata Tanzi. ‘Mungkin saja pada system kekebalan penyakit Alzheimer memicu beta amyloid sebagaimana kita perkirakan, dan jika hal ini terlalu sering terpicu maka akan ada resiko yang tinggi pada penyakit Alzheimer. Hal yang kedua adalah bahwa dengan banyaknya obat-obatan pada saluran pentargetan beta amyloid, kita percaya bahwa hal ini mungkin ditunjukkan pada cara yang sama seperti kolesterol pada penyakit jantung – anda tidak dapat mematikan keduanya secara bersama-sama namun dengan menurunkannya pada tingkatan aman sehingga anda tidak mendapati suatu peringatan.’

Kata dia bahwa suatu pertanyaan besar adalah apa yang memicu system kekebalan tubuh bawaan sebagaimana perkiraan kita? Ada beberapa contoh pathogen yang terakumulasi pada otak, termasuk Chlamydia pneumoniae dan Herpes simplex virus 1 (HSV1). Kita juga sedang mencari dengan beitu dekatnya pada ragi Candida albicans, sebagaimana sangat manjur melawan pathogen ini pada tampilan kami,’ katanya. ‘Bagaimanapun, system kekebalan tubuh bawaan juga dapat dipicu oleh stroke dan luka otak traumatis, yang juga menaikkan tingkat beta amyloid. Kita namai hipotesis kami dengan fungsi hipotesis yang menghasilkan racun, sebagaimana beta amyloid mempunyai fungsi normal, namun terlalu banyak sekali fungsinya yang dapat menyebabkan racun.’

Jika pathogen di otak sebenarnya berubah menjadi penyebab terbesar dari system kekebalan tubuh bawaan sebagaimana yang kita perkirakan, dia menyakini hal ini mungkin saja dapat memvaksinasi melawan mereka sama seperti cara mencegah penyakit Alzheimer. ‘Kita juga akan berpandangan terbuka – hal ini mungkin saja penyebab stroke atau luka di otak, atau penyebab kesemuanya diatas,’ katanya. ‘Dan peptide antimikrobial biasanya mempunyai cakupan luas; kita tahu ini dapat menyerang jamur dan ragi, jadi kenapa tidak dengan virus seperti HSV-1?’

Ruth Itzhaki pada University of Manchester sedang mengerjakan mengenai implikasi HSV-1 pada penyakit Alzheimer beberapa waktu lalu dan membuktikan bahwa hal ini mungkin saja mikroba yang memicu produksi beta amyloid di otak. ‘Pekerjaan Tanzi sangatlah menarik, sebagaiamana ada banyak sekali pertentangan pad aide tersebut bahwasannya agen yang menginfeksi mungkin saja bertanggung jawab pada penyakit Alzheimer,’ katanya. ‘Kita pikir HSV-1 bekerja pada kombinasi dengan factor genetic yang diketahui bagi penyakit Alzheimer, dan amyloid bersifat merusak saat diproduksi secara berlebihan yang berkenaan dengan infeksi.’

Sarah Houlton

Referensi
S. J, Soscia et al, PLoS one, DOI:10.1371/journal.pone.0009505

Lebah Sutra Buatan Selangkah Lagi Menjadi Kenyataan

noreply@blogger.com (Anonymous) — Sat, 21 Aug 2010 13:43:00 +0000

Ditulis oleh Awan Ukaya pada 08-06-2010

Seorang ilmuwan CSIRO yaitu Dr Tara Sutherland dan timnya telah memperoleh tonggak penting lainnya dalam pencarian berskala internasional dalam memproduksi sutra serangga buatan. Mereka telah melakukan perlakuan yang baik mengenai sutra lebah madu dari suatu ’sup’ protein sutra yang telah mereka hasilkan secara transgenik. Beberapa perlakuan tersebut sama kuatnya dengan perlakuan yang diambil dari kelenjar lebah madu sutra, suatu langkah signifikan menuju pengembangan dari biomaterial kumparan sutra koil.

“Ini berarti bahwa sekarang kita dapat secara serius mempertimbangkan pennggunaan ini dimana bahan biomimetik tersebut dapat diletakkan,” kata Dr Sutherland. “Kita menggunakan rekombinan sel-sel bakteri E. coli untuk menghasilkan protein sutra dimana, dibawah kondisi yang tepat, perakitan dengan sendirinya kedalam beberapa struktur sama pada sutra lebah madu tersebut. “Kita telah mengetahui bahwa serat sutra lebah madu tersebut dapat dihasilkan dari isi kelenjar sutra sehingga menggunakan pengetahuan ini dalam membuat serat dari suatu campuran rekombinan protein sutra yang kental dan terkonsentrasi secara memadai.
“Faktanya, kita telah membuat mereka dua kali untuk menghasilkan suatu serat tembus cahay yang stabil.”

Dr Sutherland mengatakan bahwa berbagai macam pecrobaantelah dilakukan untuk menunjukkan sutra dari mahkluk intervebrata lainnya pada sistem transgenik namun struktur gen sutra yang rumit pada organisme lainnya berarti bahwa dengan menghasilkan sutra diluar kelenjar sutra sangatlah sulit sekali. “Sebelumnya kita telah mengidentifikasikan bahwa gen sutra lebah madu dan mengetahui bahwa sutra yang telah disandikan oleh empat gen non repetitif yang kecil – suatu susunan yang lebih sederhana yang menjadikan mereka beberapa calon yang bagus dalam produksi sutra transgenik.”

Penggunaan praktis yang memungkinkan bagi beberapa sutra tersebut sangatlah kuat, tekstil yang ringan, aplikasi dengan kekuatan yang tinggi seperti komposit yang modern dalam penggunaannya pada bidang penerbangan dan kelautan, serta aplikasi media seperti jahitan pada luka, otot tendon dan ligamen buatan.

Menghentikan epilepsi dengan mempelajari synapsis

noreply@blogger.com (Anonymous) — Sun, 20 Jun 2010 04:31:00 +0000

Ditulis oleh Awan Ukaya pada 14-05-2010

Gambar Irisan otak manusia dikulturkan secara terpisah dan koneksinya tumbuh melalui mikrosaluran kecil yang menghubungkan mereka.

Para ilmuwan di Amerika Serikat telah memproduksi suatu sistem microfluidic yang dapat digunakan untuk memelajari perkembangan epilepsi. Otak manusi merupakan organ komplek yang penuh dengan koneksi synaptic yang berkomunikasi dengan menggunakan serat fiber panjang yang disebut akson. Pemahaman proses ini yang mengarahkan pada perkembagan sirkuit synaptic tersebut dapat memeberikan wawasan kedalam penyakit sistem saraf.

Beberapa pendekatan in vivo telah digunakan untuk memelajari koneksi tersebut namun mengalami keterbatasan mengenai manipulasi selektif dan terkontrol dari porsi jaringan yang tergambar dengan jelas. Ini mengarahkan Kevin Staley dan timnya pada Harvard Medical School, Cambridge, untuk mengembangkan suatu platform in vitro microfluidic untuk memelajari bagaimana koneksi tersebut dibuat dan bagaimana mereka terpengaruh oleh obat – obatan.

Alat ini memungkinkan irisan otak dikulturkan secara terpisah, tetapi mikrocaluran kecil memungkinkan akson untuk tumbuh dan menghubungkan irisan yang terpisah. Ini memungkinkan para ilmuwan untuk mengekspos irisan – irisan tersebut bagi obat – obatan yang berbeda untuk melihat apa yang terjadi pada koneksi tersebut. Yevgeny Berdichevsky, yang bekerja dalam tim dengan Staley, menjelaskan bahwa ‘Kita memutuskan untuk menggunakan microfluidic karena teknologi ini memungkinkan kita untuk menciptakan saluran akson yang berukuran mikro dan membatasi obat – obatan untuk menyesuaikan dengan ruangan pada chip kultur.’

Dengan memungkinkan pertumbuhan dan fungsi koneksi neuronal untuk mudah diteliti dan dimanupulasi, tim ini mengatakan mereka mungkin mendapatkan pemahaman yang besar mengenai tumbuh kembangnya akson dan formasi synapse, yang relevan terhadap sejumlah penyakit, dari epilepsi hingga kerusakan otak.

Richard Miles, yang bekerja pada mekanisme epilepsi pada Pierre and Marie Curie University, Paris, Perancis mengatakan bahwa dia gembira dengan pekerjaan ini, karena ini dapat digunakan untuk memelajari bagaimana koneksi synaptic dapat dibuat dan unutk mengisolasi bagian dan melihat bagaimana mereka merespon pada obat – obatan tersebut. ‘Ini benar – benar usaha yang bagus dan dapat bkerja dalam seluruh bidang,’ komentarnya.

Kelompok Staley sekarang bermaksud untuk menggunakan alat ini untuk memahami proses yang terlibat dalam konektifitas yang berlebihan, yang dianggap sebagai penyebab epilepsi, dan berharap untuk menemukan obat – obatan yang dapat menghentikan atau memperlambat perkembangan penyakit ini.

Laura Howes

Mantel yang cerdik dari virus Ebola

noreply@blogger.com (Anonymous) — Sat, 22 May 2010 01:53:00 +0000

Ditulis oleh Awan Ukaya pada 10-05-2010

Biologi Struktural: Protein yang menyembunyikan viral RNA mencegah pendeteksian sistem kekebalan tubuh dari virus yang mematikan

Carmen Drahl

Ebola, RNA, VP35

Struktur sinar X dari dua salinan virus protein Ebola di Zaire (hijau, biru) membentengi viral RNA (merah muda).

Suatu pandangan molekular baru menyibak tabir bagaimana virus Ebola mengindari pengenalan oleh sistem kekebalan tubuh: Ini menggunakan suatu mekanisme pemantelan untuk menyamarkan tanda pembuka rahasia dari penginvasiannya (Nat. Struc. Mol. Biol., DOI: 10.1038/nsmb.1765). Temuan ini dapat mengarahkan pada penyembuhan demam hemorrhagic Ebola, penyakit berbahaya dan seringkali fatal yang diiringi dengan infeksi virus tersebut.

Ebola merupakan suatu agen penular yang cerdik dimana tidak ada obat penyembuhnya, jelas Gaya K. Amarasinghe, seorang biochemist pada Iowa State University. Virus tersebut meninggalkan kartu identitas pada beberapa sel selama infeksi: untaian ganda RNA – nya. Umumnya, RNA tersebut dapat memicu sistem kekebalan manusia. Namun virus ini membuat protein yang dinamakan VP35 yang membuat RNA, selanjutnya mementahkan respon kekebalan.

Untuk memelajari lebih lanjut mengenai bagaimana penyamaran ini bekerja, Amarasinghe, seorang virologist dari Christopher F. Basler of Mount Sinai School of Medicine, dan beberapa koleganya menentukan struktur kristal sinar X dari untaian ganda RNA Ebola mengikat pada VP35 dari spesies virus di Zaire yang mematikan. Mereka menemukan bahwa berbagai macam salinan VP35 merakit mantel RNA. Satu salinan menggunakan kantong asam amino hydrophobic untuk mngenali tulang belakang RNA dan menutup untaian ganda RNA paling belakang. Salinan ynag lainnya mengikat tulang belakang melalui suatu jalur asam amino dasar. Perubahan pada dua dari residu dasar tersebut cukup untuk memusnahkan penyakit penyebab kemampuannya virus pada babi guinea, yang ditemukan tim tersebut baru – baru ini (J. Virol., DOI: 10.1128/JVI.02459-09).

Pada bulan lalu, sebuah tim yang dipimpin oleh biologist struktural yaitu Erica Ollmann Saphire dari Scripps Research Institute mendeteksi pengikatan VP35-RNA tidak biasa yang sama pada spesies Ebola yang sedikit patogenik (Proc. Natl. Acad. Sci. USA, DOI: 10.1073/pnas.0910547107). Hal ini memberi kepuasan bahwa beberapa strukturdari spesies berbeda, yang diperoleh dibawah kondisi berbeda, menunjukkan mekanisme tidak ortodok yang sama, kata Ollmann Saphire. “Tentu saja, jika anda melihat pada suatu virus tidak biasa, anda akan terikat untuk menemukan sesuatu yang tidak biasa,” tambahnya.

Disamping memelajari bagaimana virus bekerja, tim ini berharap bahwa pandangan struktural akan mengisinya dengan usaha penemuan obat molekul kecil untuk Ebola, yang akhir – akhir ini ketinggalan dibelakang pengembangan vaksin, kata Basler.

Mencegah sel tumor ganas

noreply@blogger.com (Anonymous) — Sun, 02 May 2010 06:14:00 +0000

Ditulis oleh Awan Ukaya pada 12-03-2010

Para ilmuwan di Amerika Serikat telah mengembangkan suatu cara untuk melacak dan menghancurkan sel tumor dalam darah. Sel – sel yang dilepaskan dari tumor utama dapat mensirkulasikan pada aliran darah dan akhirnya berdiam diri pada daerah lain di tubuh. Hal ini menyebarkan penyakit yang menyebabkan kanker metastatis, yang mana merupakan penyebab utama kematian diantara para pasien kanker yang kelihatannya sudah berhasil disembuhkan. Sekarang Chang Lu dari Universitas Purdue, West Lafayette, Amerika Serikat, telah menggunakan suatu teknik yang disebut electroporation yang secara selektif membersihkan sirkulasi sel – sel tumor tersebut dari darah.

Pada electroporation, suatu medan listrik didalam diaplikasikan pada suatu sel, yang menciptakan sejumlah lubang – lubang nanoskala pada sel membran. Lubang – lubang tersebut, atau pori – pori, mengijinkan benda – benda asing, seperti obat – obatan, untuk masuk ke dalam sel dan pada akhirnya dapat mengarahkan pada sel mati. Tim dari Lu membawa sel – sel tersebut melalui suatu saluran microfluidic dan menemukan bahwa sel tumor secara substansial lebih rentan untuk rusak oleh electoporation ketimbang sel darah merah atau putih yang sehat.

Suatu teknik aliran melalui electroporation memelajari perbedaan respon dari sel – sel darah dan sel – sel tumor pada medan listrik. Lu mengatakan bahwa kesedarhanaan dan kecepatan dalam menyembuhkan sel – sel tersebut adalah suatu metode yang atraktif. ‘Kita mengidam – idamkan bahwa teknik kami dapat diaplikasikan untuk memusnahkan sel – sel tumor sisa di dalam darah setelah pemindahan tumor utamanya. Praktek ini secara potensial akan menurunkan metastasis yang berkaitan dengan kematian,’ tambahnya.

Tilak Jain, seorang ahli electroporation pada Scripps Research Institute, La Jolla, Amerika Serikat, menemukan bahwa pekerjaan ini adalah inovatif dan menggembirakan, dengan mengatakan ‘dengan dikombinasikan dengan keberadaan kemoterapi, hal ini dapat memberikan suatu kekuatan serangan ganda dalam menyerang dual sirkulasi sel – sel.’Lu dan para koleganya sekarang sedang mengalihkan perhatian mereka untuk membuktikan nilai klinis dari teknik mereka, khususnya mempertahankan kelangsungan hidup sel – sel darah putih dalam prosesnya.

Hilary Burch

Reaksi ‘click’ terbaru untuk memodifikasi protein

noreply@blogger.com (Anonymous) — Sun, 02 May 2010 06:11:00 +0000

Ditulis oleh Awan Ukaya pada 28-03-2010

Ahli kimia di amerika Serikat telah menemukan suatu cara baru untuk menempelkan molekul kecil pada protein dan peptida dibawah kondisi reaksi aqueous yang ringan. Metode ini, yang bersandar pada suatu tipe baru yaitu ‘click chemistry’, meliputi reaksi ikatan diazo dengan phenol dari asam amino tyrosine. Pekerjaan ini menawarkan suatu pendekatan baru terhadap ‘bioconjugation’ – menempelkan persenyawaan pada molekul – molekul biologis – yang merupakan kunci di berbagai bidang penelitian biologis, termasuk pengembangan obat – obatan baru.

Akhir – akhir ini kebanyakan dari molekul kecil secara tipikal ditempelkan pada protein melalui residu lysine atau cysteine. Bagaimanapun sebagai sasaran asam amino, hal ni mempunyai keterbatasan; sebagai contoh lysine banyak diketemukan yang mana ini sulit sekali dipilih secara akurat dimana molekul –molekul tersebut menempel pada struktur protein. Lebih lanjut, pemberian biomolekul relatif sangat rentan, ilmu kimiawi manapun yang mencoba untuk memodifikasi protein harus dilakukan dibawah kondisi yang ringan. Menemukan calon molekul yang akan bereaksi dengan cara ini sangatlah menantang.

Sekarang ini, Carlos Barbas dan para koleganya pada Scripps Research Institute di California telah menemukan suatu cara baru untuk menghubungkan molekul – molekul ke protein dan peptida melalui tyrosine.

Tim ini menunjukkan bahwa cyclic diazodicarboxamide dapat bereaksi dengan molekul tyrosine yang dimodifikasi dengan ikatan diazo ‘meng – klik’ pada phenol dari tyrosine. Click chemistry, suatu konsep yang dikembangkan oleh Barry Sharpless pada tahun 2001, meliputi perakitan modular molekul melalui reaksi energi tinggi dibawah kondisi reaksi yang ringan.

Kunci persenyawaan diazo adalah di sebelah kiri, dan pada sebelah kanan adalah suatu ilustrasi bagaimana molekul kecil menempel pada cincin phenol dari tyrosine yang pendek berisikan peptida. Dengan telah menunjukkan reaksi klik baru ini bekerja sesuai prinsipnya, Barbas dan timnya lalu menempelkan molekul diazo pada susunan peptida dan protein melalui residu tyrosine dan menunjukkan bahwa molekul dapat membawa susunan kelompok fungsional. Jika suatu azide ‘tail’ dibawa oleh molekul diazo lalu click chemistry konvensional lebih lanjut lagi adalah mungkin untuk menempel jangkauan yang luas dari kefungsionalisasian lainnya melalui azide.

Yang paling penting sekali adalah produk ini sangatlah stabil, kata Barbas, dan reaksinya ’sangat efisien dan dapat berguna untuk penggunaaan pada ruang lingkup yang luas lagi dan tidak hanya pada bioconjugation tetapi meluas untuk memodifikasi phenol manapun yang berisi molekul. Barbas menambahkan, ‘Ini berfungsi baik dengan kesuksesan Sharpless click chemistry yang sangat mengagumkan yang telah diaplikasikan secara luas di berbagai disiplin ilmu.’

Claude Meares, seorang ahli bioconjugation pada Universitas California, Davis, mengatakan, ‘Kondisi reaksi, hasilnya, dan selektifitas sangat penting khususnya bagi bioconjugations. Hasil yang dilaporkan dari lab Barbas sungguh menjanjikan, dan sangat jelas penggunaannya bagi ilmu kimiawi ini jika selektifitas bagi tyrosine terhadap lysine membuktikan untuk dapat diaplikasikan pada protein umumnya.’
Simon Hadlington

Referensi
H Ban, J Gavrilyuk, and C F Barbas III, J. Am. Chem. Soc., 2010, DOI: 10.1021/ja909062q