tag:blogger.com,1999:blog-86387056188096313852016-03-09T23:16:24.905-08:00pan-AvesT. rex, T.rex, burning bright...David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.comBlogger81125tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-65272684404168476882015-11-28T10:03:00.000-08:002016-01-13T00:42:21.293-08:00Dinosauři v Zoo Praha, díl 3. – Afroaves     Ke třetímu a poslednímu dílu Dinosaurů ze Zoo jsem se dostal s extrémním zpožděním: sérii zakončuji více než čtyři roky poté, co jsem na blogu zveřejnil její první část. Formát zůstává stále stejný: k fotkám z mobilu nebo kompaktu jsou připojeny stručné popisy jednotlivých druhů zkompilované z různých zdrojů. S každým dalším dílem ale rostla jak doba, kterou jsem nad článkem trávil (první David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-14357962179529401202015-09-08T05:25:00.000-07:002016-03-09T23:16:24.933-08:00Údajní fosilní papoušci pomáhají odhalit morfologickou evoluci skupiny Eufalconimorphae 1. Úvod a historie     Jedním z nejzajímavějších vývojů v paleornitologii (studiu vymřelých ptáků) posledních zhruba deseti let je reinterpretace fosilií ve světle nových poznatků o příbuzenských vztazích, získaných z analýz molekulárních dat. V rozporu s představami dřívějších systematiků, že ojedinělé fosilní nálezy představují jedinou naději na rozřešení ptačí fylogeneze (např. Stresemann David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-44345906532890508692014-12-12T04:57:00.002-08:002015-10-07T17:17:18.421-07:00Avian Phylogenomics Project První strana úvodníku v žurnálu Science, shrnujícího výsledky APP. (Zdroj: Zhang et al. 2014: 1308)     Před několika hodinami byly napříč 8 různými žurnály prakticky současně publikovány výsledky Avian Phylogenomics Project (APP), výzkumného programu, na kterém se v předchozích čtyřech letech podílelo 80 institucí z celého světa. Výsledkem stovek let procesorového času a nákladů v David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-33054902932861851492014-11-23T02:46:00.000-08:002015-03-19T17:56:53.954-07:00Zrychlená morfologická evoluce podporuje výjimečnost ptáků a ptačí linie v rámci teropodů     Brusatte a spol. analyzují rychlost morfologické evoluce na přechodu od neptačích dinosaurů k ptákům. Autoři se tak snaží otestovat hypotézu G. G. Simpsona, podle které je vznik nového tělního plánu doprovázen "vlnami" zrychlené morfologické evoluce. Slepice (Gallus gallus f. domestica), konfuciusornitid Zhongornis (považovaný ovšem i za "přechodný článek" mezi dlouho- a krátkoocasými David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-34339440542037053302014-11-11T03:33:00.000-08:002015-11-28T18:04:16.356-08:00Identita kostí v ptačím zápěstí – syntéza paleontologických a embryologických dat     Botelho et al. (2014) publikovali před několika týdny v žurnálu PLOS Biology fascinující práci, ve kterém se vracejí k jednomu z nejproblematičtějších témat v rámci přechodu od dinosaurů k ptákům: k anatomii ruky a zápěstí. Problém s identitou ptačích prstů je dobře známý (na blogu jsem mu vyhradil celou samostatnou kategorii článků), nepředstavuje ale jedinou komplikaci, se kterou se David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-37094151102094690772013-12-28T17:46:00.000-08:002015-10-23T15:36:33.768-07:00Omyly molekulárních hodin: pěvci v křídě nežili     Nejsem mrtvý! V posledních 9 měsících jsem ale na blogování prakticky neměl čas. Je to škoda – kromě osobních zážitků, jako byly moje už druhé vykopávky v polském Krasiejowě (které na svém blogu zachycuje Daniel Madzia), jsem nereferoval ani o ohromné spoustě zajímavých studií, které se v průběhu roku objevily.     Zanedbal jsem tak popis středně- až svrchno-jurských taxonů Eosinopteryx a David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-27857334904676419122013-02-27T18:57:00.000-08:002015-04-18T17:41:11.195-07:00Největší úspěchy ve výzkumu pan-avianů za rok 2012     Přehled největších paleo-objevů předchozího roku jsem nesestavoval už od založení blogu, minulý rok o to však vyloženě škemrá. Počet článků v něm oproti předešlým letem klesl na méně než polovinu, za což určitě může jejich příšerná délka. (Předsevzetí pro rok 2013 zní "kratší články!" a, jak je asi vidět, v jeho naplňování absolutně selhávám.) Díky tomu jsem zanedbal i ty objevy, o kterých David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-55689897589919987092013-01-04T17:30:00.001-08:002015-11-28T10:30:47.267-08:00Dinosauři v Zoo Praha, díl 2. – Telluraves bez Afroaves     S těžko uvěřitelným zpožděním (které dosáhlo jednoho a půl roku) konečně předkládám druhý díl dinosaurů ze zoo. Do pražské zoo jsem se od té doby podíval celkem třikrát, což mi aspoň umožnilo pořídit dostatek vhodných fotek. Opět platí, že článek sestává ze snímků ptáků doplněných krátkými textíky, sestavenými z wikipedie, encyklopedie Ptáci (BirdLife International 2007), stránek organizace David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-38763014303639141512012-12-21T17:22:00.000-08:002015-10-07T23:08:26.363-07:00Kanadský Ornithomimus s křídly: milníky v evoluci peří posunuty do minulosti, ontogeneze složitější, než se zdálo     Jednou z velmi významných studií, na kterou jsem si nedokázal v minulých týdnech najít čas, je ta o křídlech ornitomima, která mění náš náhled na evoluci peří. Opeřený Ornithomimus se svým o něco méně opeřeným mláďatem uprostřed bujné vegetace toho, co se bude o 70 milionů let později zvát Alberta. Autorem rekonstrukce je Julius Csotonyi. Neméně povedená je i klidnější a umírněnější David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-35138707224524166882012-11-04T15:15:00.000-08:002015-03-10T22:09:32.729-07:00Abstrakty k listopadu 2012, díl 1. Viz také: Abstrakty k listopadu 2012, díl 2.     Kvůli dlouhatánským článkům o moderních ptácích jsem úplně zanedbával přehledy nových abstraktů, kterých se zase za poslední dva měsíce nashromáždilo úctyhodné množství. Pterosauři už tradičně dostanou v rámci pozitivní diskriminace svůj vlastní přehled.     Půjdeme-li v abecedním pořadí, Averianov a Alifanov v první ze zde uvedených studií David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-81339398063844679312012-11-03T13:51:00.000-07:002015-03-08T23:39:38.607-07:00První fylogeneze všech žijících ptáků: tempo ptačí diverzifikace nezávisí na zeměpisné šířce a už 50 milionů let neustále zrychluje It would thus seem that every phylogenetic analysis, in order to be valid, must include every species of bird [...], which is clearly impossible. Harshman 2007:2 1. Celoptačí fylogeneze: sen, který došel naplnění     Fylogeneze ptáků je stále kontroverzním tématem, kde nový výzkum může mnoho změnit a přinést spoustu překvapujících závěrů – viz i studie, které o tomto tématu pravidelně David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-1496625979816945802012-10-19T13:40:00.000-07:002015-02-22T16:52:53.698-08:00Ultrakonzervované elementy pomáhají rozřešit příbuzenské vztahy v Neoaves: novinky o myšácích, hoacinovi a Metaves 1. Úvod     Jedním z nejtvrdších oříšků, jaké ve fylogenezi obratlovců najdeme, jsou příbuzenské vztahy mezi ptáky z kladu Neoaves. Z žijících ptáků sem nespadají pouze hrabaví s vrubozobými (Galloanserae) a "běžci" včetně tinam (Palaeognathae), a soustředí se zde tedy hodně přes 90% celkové ptačí diverzity. Vnitřní vztahy skupiny systematiky matou už od poloviny 19. století – a nutno dodat, žeDavid Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-37463923266171052522012-09-24T15:19:00.000-07:002014-06-08T13:00:40.057-07:00Proč neexistují "běžci" (Ratitae), díl 3. – protože to říkají retropozony Viz také: Proč neexistují "běžci" (Ratitae), díl 1. – co DNA skrývala a morfologové přehlíželi Proč neexistují "běžci" (Ratitae), díl 2. – neusaditelné tinamy a 40 nových genů 1. Úvod     Když jsem se v posledních dnech roku 2011 začítal do Living Dinosaurs, v kapitole z pera Brada Livezeye mě velmi zaujala následující zmínka: An hypothesis of polyphyly of ratites indicated by sequence David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-85926208635571909042012-08-26T17:32:00.000-07:002015-03-02T00:41:36.449-08:00Proč neexistují "běžci" (Ratitae), díl 2. – neusaditelné tinamy a 40 nových genů Viz také: Proč neexistují "běžci" (Ratitae), díl 1. – co DNA skrývala a morfologové přehlíželi Proč neexistují "běžci" (Ratitae), díl 3. – protože to říkají retropozony     V předchozím díle minisérie jsem ukázal, jak se zrodila hypotéza o "běžcích" coby polyfyletickém seskupení ptáků v rámci monofyletické skupiny Palaeognathae, a vyjmenoval jsem nedlouhou řádku studií, které tento závěr David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-12295366777255509522012-08-23T17:32:00.006-07:002015-04-23T23:07:50.444-07:00Proč neexistují "běžci" (Ratitae), díl 1. – co DNA skrývala a morfologové přehlíželi Viz také: Proč neexistují "běžci" (Ratitae), díl 2. – neusaditelné tinamy a 40 nových genů Proč neexistují "běžci" (Ratitae), díl 3. – protože to říkají retropozony     Je to skoro trapné, ale už jsem zase jednou blog bez přijatelné výmluvy zanedbával – dvoutýdenní pobyt v Krasiejowě by sice přijatelný byl, ale už jsem přece jen měsíc zpátky. Pauzu tedy zakončuji s článkem o historickém David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com3tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-72360169408052730402012-05-24T09:01:00.990-07:002012-05-26T13:29:42.591-07:00Nová metoda pro studium ptačích retropozonů potvrzuje sesterský vztah potápek a plameňáků (Mirandornithes)1. Co jsou retropozony a k čemu jsou dobré     O retropozonech jsem na blogu už dvakrát psal v souvislosti s fylogenetikou žijících ptáků. Jde o podtřídu elementů známých jako "skákající geny" (formálně transpozibilní elementy) a i přes minuciózní rozlišování mezi retropozony a retrotranspozony, které někteří autoři obhajují, sem lze zahrnout všechny DNA sekvence, které vznikly reverzní David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com2tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-41466763155379149092012-05-06T16:38:00.004-07:002015-08-16T12:55:53.981-07:00Avolatavis tax. nov. a fylogeneze Pan-Psittaciformes: papoušci byli původně dravci a prodělali složitý vývoj chápavé nohy     Pokud o nějaké nové práci nedokážu napsat do dvou měsíců od jejího vydání, většinou o ní už nenapíšu vůbec. Tentokrát však udělám výjimku: studie Ksepky & Clarke (2012) o vymřelých papoušcích byla sice v Journal of Vertebrate Paleontology publikována už 29. února (hned vedle další Ksepkovy studie o tučňácích), připadá mi ale příliš zajímavá na to, abych ji na blogu zcela opomněl. Přál bych David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-18131206611274625202012-04-29T15:18:00.002-07:002012-09-30T07:50:31.280-07:00Kairuku tax. nov. – podivně vypadající největší tučňák všech dob popsán z oligocénu Nového Zélandu     Nerad bych uvozoval každý článek frází "Mezi mé oblíbené pan-aviany patří mimojiné [taxon X]", tentokrát si to ale nemohu odpustit. Vedle kasuárů, člunozobců, arů hyacintových, kostěnozubých ptáků nebo wukongopteridních pterosaurů mám v mimořádné oblibě také tučňáky.     Zároveň je na místě omluva: tučňáky začíná dlouhá série neontologických a paleontologických prací týkajících se moderních David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-65372498016156567242012-04-22T16:38:00.004-07:002012-11-03T09:28:39.805-07:00Vangy: dvoufázová adaptivní radiace madagaskarských pěvců     Nicolás Diez na svém Google+ streamu před několika dny upozornil na mimořádně zajímavou studii, publikovanou zatím coby elektronický preprint v PNASu. Jønsson et al. (2012) v ní využívají molekulární fylogenetiku, aby určili, jaké příčiny stály za adaptivní radiací vangovitých (Vangidae), zvláštní skupiny pěvců endemické pro Madagaskar.     Vangovití jsou podivní. Na pěvčím evolučním David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com2tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-32645590209571197312012-03-25T06:09:00.004-07:002014-07-07T09:56:34.295-07:00Na oslavu kolibříků: co mají společného nejmenší a největší pan-aviani všech dob? 1. Úvod: kdo je endoterm, kdo tachymetabolik a proč na tom záleží     Jednou z mnoha otázek, která přestane dávat smysl po přijetí dinosauří příslušnosti ptáků, je ta na dinosauří endotermii. Většina známých dinosaurů samozřejmě endotermní je, můžeme se ptát akorát na to, zda byli endotermní úplně všichni. Také oblíbená otázka, zda dinosauři byli "ektotermní podobně jako dnešní plazi", nebo David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-85701045343695227822012-02-29T11:34:00.001-08:002012-02-29T11:36:00.323-08:00A přece nelétali: ohebnost primárních letek archeopteryga a konfuciusornise    Jak jinak zakončit poslední únorový den, když ne se zprávou ze světa mrtvých ptáků? Nudds & Dyke (2010) předloni přišli s kontroverzní studií, podle níž peří dlouhoocasých ptáků typu archeopteryga či konfuciusornise nemělo osten (rhachis) dostatečně pevný na to, aby sneslo mechanické namáhání spojenou s aktivním letem. To by dávalo smysl vzhledem k jiným typům důkazů, jako je třeba laterálně David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-86506843212974973902012-02-18T14:13:00.001-08:002015-10-25T19:04:41.819-07:00Picavus litencicensis tax. nov., nový šplhavec z oligocénu východní Evropy     Kenozoických dinosaurů není nikdy dost: právě oni nám víc než cokoli jiného pomáhají pochopit, odkud se na světě vzala současná ohromná ptačí diverzita. Naneštěstí zrovna ty oblasti, které nám slibují objasnit o ptačí evoluci nejvíc – totiž kontinenty bývalé Gondwany, kam biogeografické rekonstrukce kladou společné předky paleognátů, pozemních ptáků nebo pěvců (Cracraft 2001; Ericson 2012) –David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-21306591409405972702012-02-18T09:26:00.001-08:002013-12-13T14:34:18.655-08:00Tajemství pštrosího penisu: erekce bez krve     Richard Prum si už v ornitologii udělal jméno novým modelem evoluce ptáků, založeným na syntéze poznatků z embryologie a fosilního záznamu (Prum 1999; Prum & Brush 2002). My, fandové dinosaurů, také známe jeho obhajobu dinosauřího původu ptáků před ornitologickými BANDity, ostře uvozenou otázkou "Are current critiques of the theropod origin of birds science?" (Prum 2003).     Od té doby se David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com1tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-70063369838282199962012-02-10T14:06:00.005-08:002013-11-09T14:50:44.268-08:00Ptáci vstupují do roku 2012: retropozony, ztráta zubů, osteoartróza a definitivně mrtvý datel 1. Retropozony potvrzují prudkou diverzifikaci Neoaves     Už jsem psal o tom, že nedovedu odolat studiím zabývajícím se velkoškálovou fylogenezí moderních ptáků; z toho důvodu dnešní článek začíná s retropozonovým výzkumem, který Matzke et al. (2012) publikovali na začátku letošního roku v žurnálu Molecular Biology and Evolution. Autoři patří do stejného týmu výzkumníků, který loni publikoval David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0tag:blogger.com,1999:blog-8638705618809631385.post-30231554360100683652012-02-02T15:40:00.004-08:002015-03-02T03:15:59.800-08:00Recenze: Living Dinosaurs Obálka knihy Living Dinosaurs, složená z fotografií bezejmenného pozemního ptáka, protiptáka pengornise a raného krátkoocasého sapeornise. (Zdroj: books.google.com) 1. Úvod     Na Living Dinosaurs jsem narazil poprvé, když už byly úryvky z jejího obsahu digitalizovány na Google Books. Ihned mě zaujala hromada citací k obskurním hypotézám o dvojím vzniku moderních ptáků; ani jsem si nevšiml David Černýhttps://plus.google.com/118373745163618996024noreply@blogger.com0